MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 27400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007503	CGG	2	6	252	257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043997
2	NC_007503	CTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043997
3	NC_007503	CGG	2	6	324	329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043997
4	NC_007503	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045102
5	NC_007503	TGT	2	6	509	514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045102
6	NC_007503	TTA	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78045102
7	NC_007503	GTT	2	6	591	596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045102
8	NC_007503	AAG	2	6	622	627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045102
9	NC_007503	ATG	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045102
10	NC_007503	CTT	2	6	787	792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043459
11	NC_007503	CTT	2	6	851	856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043459
12	NC_007503	AGG	2	6	988	993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043459
13	NC_007503	TAT	2	6	1093	1098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043134
14	NC_007503	CAG	3	9	1232	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043134
15	NC_007503	GTT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043134
16	NC_007503	GCT	2	6	1436	1441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043134
17	NC_007503	CGG	2	6	1554	1559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043134
18	NC_007503	GGT	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043134
19	NC_007503	ATT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043134
20	NC_007503	CAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043134
21	NC_007503	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043134
22	NC_007503	AGC	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045166
23	NC_007503	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045166
24	NC_007503	ATC	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045166
25	NC_007503	CGG	2	6	2046	2051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045166
26	NC_007503	ATT	2	6	2052	2057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78045166
27	NC_007503	ACG	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045166
28	NC_007503	ATC	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045166
29	NC_007503	TAA	2	6	2260	2265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78045166
30	NC_007503	ATG	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
31	NC_007503	AGG	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044593
32	NC_007503	CTG	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044593
33	NC_007503	TGA	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
34	NC_007503	CGG	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044593
35	NC_007503	GAC	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044593
36	NC_007503	TGA	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
37	NC_007503	ATA	2	6	2962	2967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044593
38	NC_007503	CTT	2	6	2983	2988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78044593
39	NC_007503	CCG	2	6	3029	3034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78044593
40	NC_007503	TTA	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
41	NC_007503	TTA	2	6	3082	3087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
42	NC_007503	ATT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
43	NC_007503	TCG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044593
44	NC_007503	TGT	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044593
45	NC_007503	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
46	NC_007503	GAT	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
47	NC_007503	TTG	2	6	3352	3357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044593
48	NC_007503	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044593
49	NC_007503	TGC	2	6	3377	3382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044593
50	NC_007503	TTA	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
51	NC_007503	TGA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
52	NC_007503	ATG	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043339
53	NC_007503	TGG	2	6	3909	3914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043339
54	NC_007503	GTG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043339
55	NC_007503	CGG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043339
56	NC_007503	AGG	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043339
57	NC_007503	ATT	3	9	4243	4251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043339
58	NC_007503	CGG	2	6	4277	4282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043339
59	NC_007503	AAC	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043339
60	NC_007503	CTG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043339
61	NC_007503	AAT	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043339
62	NC_007503	GAA	2	6	4885	4890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043339
63	NC_007503	TGC	2	6	4923	4928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043339
64	NC_007503	ACT	2	6	5061	5066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78043339
65	NC_007503	GGA	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043339
66	NC_007503	GAT	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043339
67	NC_007503	AAC	2	6	5411	5416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043339
68	NC_007503	TAA	2	6	5436	5441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043339
69	NC_007503	TAT	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044839
70	NC_007503	TTA	2	6	5720	5725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044839
71	NC_007503	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044839
72	NC_007503	ACT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044839
73	NC_007503	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044839
74	NC_007503	GAA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044839
75	NC_007503	GCA	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044839
76	NC_007503	AAC	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78044839
77	NC_007503	TAC	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044839
78	NC_007503	TGG	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044839
79	NC_007503	ATA	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043660
80	NC_007503	ATT	2	6	6492	6497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043660
81	NC_007503	ACT	2	6	6531	6536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78043660
82	NC_007503	TGG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043660
83	NC_007503	TGG	2	6	6673	6678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043660
84	NC_007503	GAA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043660
85	NC_007503	GAA	2	6	6783	6788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043660
86	NC_007503	TTA	2	6	6874	6879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043660
87	NC_007503	TAT	2	6	6933	6938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043660
88	NC_007503	TAA	2	6	6961	6966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043660
89	NC_007503	GTA	2	6	7065	7070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043660
90	NC_007503	AGC	2	6	7358	7363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043063
91	NC_007503	TGG	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043063
92	NC_007503	GGT	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043063
93	NC_007503	GAA	2	6	7558	7563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043063
94	NC_007503	GGT	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043063
95	NC_007503	GAG	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043063
96	NC_007503	TGG	2	6	7757	7762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043063
97	NC_007503	AGG	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043063
98	NC_007503	GAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043063
99	NC_007503	GGA	2	6	8055	8060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043063
100	NC_007503	ACA	2	6	8146	8151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78044965
101	NC_007503	AAT	2	6	8267	8272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044965
102	NC_007503	CGG	2	6	8317	8322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044965
103	NC_007503	CTT	2	6	8379	8384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78044965
104	NC_007503	ATC	2	6	8483	8488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044965
105	NC_007503	GCG	2	6	8652	8657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044965
106	NC_007503	CTG	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044965
107	NC_007503	CGG	2	6	8753	8758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044965
108	NC_007503	CGG	2	6	8816	8821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044965
109	NC_007503	GGA	2	6	8828	8833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044965
110	NC_007503	CCG	2	6	8841	8846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78044965
111	NC_007503	GAA	3	9	9222	9230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044965
112	NC_007503	AGC	2	6	9576	9581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043356
113	NC_007503	GTT	2	6	9701	9706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043356
114	NC_007503	ATT	2	6	9774	9779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043356
115	NC_007503	TGG	2	6	9822	9827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043356
116	NC_007503	TGC	2	6	9908	9913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043356
117	NC_007503	GAT	2	6	9936	9941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043356
118	NC_007503	TTG	2	6	9967	9972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043356
119	NC_007503	GCA	2	6	10223	10228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043356
120	NC_007503	TTC	2	6	10269	10274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043356
121	NC_007503	CCT	2	6	10301	10306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78043356
122	NC_007503	GCT	2	6	10424	10429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043356
123	NC_007503	ATT	2	6	10484	10489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043356
124	NC_007503	GTG	2	6	10567	10572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044734
125	NC_007503	GCT	2	6	10597	10602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044734
126	NC_007503	AGA	2	6	10653	10658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044734
127	NC_007503	CTT	2	6	10675	10680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78044734
128	NC_007503	GCT	2	6	10789	10794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044734
129	NC_007503	GCT	2	6	10860	10865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044734
130	NC_007503	AAT	2	6	10911	10916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044734
131	NC_007503	ACC	2	6	10987	10992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78044734
132	NC_007503	GTA	2	6	11032	11037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044734
133	NC_007503	GGA	2	6	11085	11090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044734
134	NC_007503	AGA	2	6	11148	11153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044734
135	NC_007503	GCA	2	6	11210	11215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044734
136	NC_007503	AGC	2	6	11309	11314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044734
137	NC_007503	ATA	3	9	11363	11371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044734
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141	NC_007503	TTC	2	6	11745	11750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78042797
142	NC_007503	TTC	2	6	11797	11802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78042797
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162	NC_007503	ATT	2	6	13930	13935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043673
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164	NC_007503	CGG	2	6	14055	14060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043673
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247	NC_007503	CAT	2	6	21442	21447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78042960
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249	NC_007503	TTC	2	6	21578	21583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043847
250	NC_007503	TCC	2	6	21723	21728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78043847
251	NC_007503	TCG	2	6	21774	21779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043847
252	NC_007503	TGG	2	6	21790	21795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043847
253	NC_007503	CTT	2	6	22048	22053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043847
254	NC_007503	TCC	2	6	22104	22109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78043847
255	NC_007503	CGC	2	6	22162	22167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78043847
256	NC_007503	TTA	2	6	22401	22406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044067
257	NC_007503	GGA	2	6	22423	22428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044067
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