MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 2

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007494	GCCAGC	2	12	1785	1796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007494	TCCGGG	2	12	4340	4351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007494	ATCGGA	2	12	14134	14145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007494	CCCGTC	2	12	17215	17226	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007494	GCCCGC	2	12	31118	31129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007494	GCCAGC	2	12	35458	35469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007494	TCCGGG	2	12	38013	38024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007494	GGTCCT	2	12	43644	43655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007494	CCAGTT	2	12	44251	44262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007494	CAGCCG	2	12	44575	44586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007494	CTTCAC	2	12	45829	45840	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007494	CCCTTC	2	12	105534	105545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007494	CGACGG	2	12	109806	109817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007494	GGCTTG	2	12	136191	136202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007494	GTGTCC	3	18	151862	151879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007494	CATGGT	2	12	152330	152341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007494	GGGTAT	2	12	152691	152702	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007494	TTTCGC	2	12	159003	159014	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007494	GCGAGG	2	12	159018	159029	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007494	GGGGAA	2	12	237109	237120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007494	CGCCAG	2	12	245904	245915	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007494	GCCCGC	2	12	254203	254214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007494	CGGTCC	2	12	285077	285088	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007494	GGCGCA	2	12	288837	288848	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007494	CCGATC	2	12	299323	299334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007494	GGGCCG	2	12	320942	320953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007494	TGCGGC	2	12	343788	343799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007494	GGGCCG	2	12	373158	373169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007494	TCCGGC	2	12	376577	376588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007494	GCGGCC	2	12	387255	387266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007494	GGGTCC	2	12	396294	396305	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007494	GGGCAG	2	12	405811	405822	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007494	CGGCCC	2	12	449622	449633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007494	TCATTT	2	12	495506	495517	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007494	GCGGCT	2	12	571828	571839	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007494	GGGGCG	2	12	579129	579140	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007494	GGGCCC	2	12	586912	586923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007494	CGAGCG	2	12	587055	587066	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007494	CGGCCG	2	12	593318	593329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007494	TGGCCG	2	12	617132	617143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007494	GCAGCC	2	12	620542	620553	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007494	CTTTCA	2	12	673154	673165	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007494	GCGGCC	2	12	677928	677939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007494	CGGATC	2	12	723339	723350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007494	TCGCCC	2	12	725852	725863	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007494	GCGGCT	2	12	729936	729947	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007494	TCGACC	2	12	730028	730039	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007494	AATGCC	2	12	730203	730214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007494	CGAAGG	2	12	758873	758884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007494	CCGGAT	2	12	758962	758973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007494	CCGCCT	2	12	759081	759092	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007494	CGAGCT	2	12	759147	759158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007494	GGCGAG	2	12	759514	759525	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007494	GCGGGA	2	12	768667	768678	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007494	CCGGCC	2	12	773427	773438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007494	GCCCGA	2	12	805101	805112	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007494	ACCTCA	2	12	805252	805263	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007494	TCGGGA	2	12	807575	807586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007494	CGGCAG	2	12	855014	855025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007494	GGGTTC	2	12	901211	901222	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007494	GCCGAT	2	12	927995	928006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007494	GACGAG	2	12	928193	928204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007494	TCTGGG	2	12	929161	929172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007494	GCTGCG	2	12	929401	929412	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.