MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 2

Total Repeats: 967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007494	TCGTG	2	10	1014	1023	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007494	GATCA	2	10	2126	2135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007494	CTCAT	2	10	4637	4646	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007494	ATCCC	2	10	5145	5154	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007494	GCGCT	2	10	5636	5645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007494	GGCCG	2	10	9986	9995	0 %	0 %	60 %	40 %	77464995
7	NC_007494	CGCTG	2	10	11070	11079	0 %	20 %	40 %	40 %	77464995
8	NC_007494	CTCGC	2	10	11273	11282	0 %	20 %	20 %	60 %	77464995
9	NC_007494	TGCGC	2	10	12734	12743	0 %	20 %	40 %	40 %	77464997
10	NC_007494	TCGCG	2	10	14347	14356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007494	TGTCG	2	10	14699	14708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007494	GGCGC	2	10	15674	15683	0 %	0 %	60 %	40 %	77464999
13	NC_007494	GGCCG	2	10	16107	16116	0 %	0 %	60 %	40 %	77464999
14	NC_007494	TCGGC	2	10	18984	18993	0 %	20 %	40 %	40 %	77465004
15	NC_007494	GCGCG	2	10	19692	19701	0 %	0 %	60 %	40 %	77465004
16	NC_007494	GGTGC	2	10	19793	19802	0 %	20 %	60 %	20 %	77465004
17	NC_007494	ACGGA	2	10	20099	20108	40 %	0 %	40 %	20 %	77465005
18	NC_007494	GGTCG	2	10	22129	22138	0 %	20 %	60 %	20 %	77465007
19	NC_007494	GCGCC	2	10	22227	22236	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007494	GGGGC	2	10	22599	22608	0 %	0 %	80 %	20 %	77465008
21	NC_007494	GGGGC	2	10	24855	24864	0 %	0 %	80 %	20 %	77465011
22	NC_007494	GGACG	2	10	25548	25557	20 %	0 %	60 %	20 %	77465012
23	NC_007494	CGGGC	2	10	29122	29131	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007494	GGACC	2	10	29204	29213	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007494	CCCTG	2	10	29315	29324	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_007494	GAAGC	2	10	29424	29433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007494	CCGCA	2	10	29590	29599	20 %	0 %	20 %	60 %	77465015
28	NC_007494	GCATC	2	10	30129	30138	20 %	20 %	20 %	40 %	77465015
29	NC_007494	CCGCG	2	10	30186	30195	0 %	0 %	40 %	60 %	77465015
30	NC_007494	GGCCG	2	10	31646	31655	0 %	0 %	60 %	40 %	77465019
31	NC_007494	GGGCG	2	10	31730	31739	0 %	0 %	80 %	20 %	77465019
32	NC_007494	CCGGG	2	10	33041	33050	0 %	0 %	60 %	40 %	77465019
33	NC_007494	TCGTG	2	10	34687	34696	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007494	GATCA	2	10	35799	35808	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007494	CTCAT	2	10	38309	38318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007494	ATCCC	2	10	38817	38826	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_007494	GCTGC	2	10	39344	39353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007494	GGTCG	2	10	40090	40099	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007494	GGTCC	2	10	42642	42651	0 %	20 %	40 %	40 %	77465025
40	NC_007494	ACGCG	2	10	42867	42876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007494	AGAAA	2	10	43030	43039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007494	CGGTC	2	10	44032	44041	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007494	TCCTC	2	10	44185	44194	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_007494	CCAGA	2	10	44747	44756	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007494	CCGCC	2	10	47270	47279	0 %	0 %	20 %	80 %	77465028
46	NC_007494	AGCGA	2	10	47646	47655	40 %	0 %	40 %	20 %	77465028
47	NC_007494	CGGCC	2	10	49481	49490	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_007494	GGCCC	2	10	49818	49827	0 %	0 %	40 %	60 %	77465031
49	NC_007494	CGGCC	2	10	52072	52081	0 %	0 %	40 %	60 %	77465034
50	NC_007494	CCGCC	2	10	52412	52421	0 %	0 %	20 %	80 %	77465034
51	NC_007494	GTCAG	2	10	52920	52929	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007494	CGGCG	2	10	53673	53682	0 %	0 %	60 %	40 %	552536497
53	NC_007494	CGGTG	2	10	54271	54280	0 %	20 %	60 %	20 %	77465036
54	NC_007494	CACCG	2	10	54574	54583	20 %	0 %	20 %	60 %	77465036
55	NC_007494	GCTCT	2	10	54805	54814	0 %	40 %	20 %	40 %	77465036
56	NC_007494	GCGCC	2	10	55087	55096	0 %	0 %	40 %	60 %	77465037
57	NC_007494	GACCG	2	10	58541	58550	20 %	0 %	40 %	40 %	77465040
58	NC_007494	TGCGG	2	10	58623	58632	0 %	20 %	60 %	20 %	77465040
59	NC_007494	CGTCC	2	10	61822	61831	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_007494	CGCGG	2	10	62386	62395	0 %	0 %	60 %	40 %	77465042
61	NC_007494	CTGGG	2	10	63100	63109	0 %	20 %	60 %	20 %	552536498
62	NC_007494	GCTGG	2	10	63258	63267	0 %	20 %	60 %	20 %	552536498
63	NC_007494	GCCCG	2	10	63565	63574	0 %	0 %	40 %	60 %	552536498
64	NC_007494	CGCGC	2	10	63910	63919	0 %	0 %	40 %	60 %	77465044
65	NC_007494	CGGGC	2	10	63937	63946	0 %	0 %	60 %	40 %	77465044
66	NC_007494	GATCA	2	10	65188	65197	40 %	20 %	20 %	20 %	77465045
67	NC_007494	CGCGC	2	10	65481	65490	0 %	0 %	40 %	60 %	77465045
68	NC_007494	GCCGC	2	10	65552	65561	0 %	0 %	40 %	60 %	77465045
69	NC_007494	GGCGC	2	10	66092	66101	0 %	0 %	60 %	40 %	77465046
70	NC_007494	GCCGC	2	10	66499	66508	0 %	0 %	40 %	60 %	77465046
71	NC_007494	GCCCG	2	10	66526	66535	0 %	0 %	40 %	60 %	77465046
72	NC_007494	CGACC	2	10	68013	68022	20 %	0 %	20 %	60 %	77465047
73	NC_007494	GCCGC	2	10	68024	68033	0 %	0 %	40 %	60 %	77465047
74	NC_007494	CCGGC	2	10	68189	68198	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_007494	TCCAT	2	10	68424	68433	20 %	40 %	0 %	40 %	77465048
76	NC_007494	CCTCG	2	10	69313	69322	0 %	20 %	20 %	60 %	77465048
77	NC_007494	GCCCG	2	10	70470	70479	0 %	0 %	40 %	60 %	77465049
78	NC_007494	CGAGG	2	10	71832	71841	20 %	0 %	60 %	20 %	77465050
79	NC_007494	CGGCC	2	10	72470	72479	0 %	0 %	40 %	60 %	77465050
80	NC_007494	CGTCC	2	10	76319	76328	0 %	20 %	20 %	60 %	77465054
81	NC_007494	GTCAT	2	10	76614	76623	20 %	40 %	20 %	20 %	77465055
82	NC_007494	GCCGC	2	10	77815	77824	0 %	0 %	40 %	60 %	77465057
83	NC_007494	CCGGG	2	10	79644	79653	0 %	0 %	60 %	40 %	77465058
84	NC_007494	CCGGC	2	10	80303	80312	0 %	0 %	40 %	60 %	77465058
85	NC_007494	GCCGC	2	10	80610	80619	0 %	0 %	40 %	60 %	77465058
86	NC_007494	GTCAG	2	10	83526	83535	20 %	20 %	40 %	20 %	77465062
87	NC_007494	TCGAT	2	10	83777	83786	20 %	40 %	20 %	20 %	77465062
88	NC_007494	GCCGG	2	10	86043	86052	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007494	GCCGC	2	10	86374	86383	0 %	0 %	40 %	60 %	77465063
90	NC_007494	GGCGG	2	10	88436	88445	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007494	CGGGC	2	10	88654	88663	0 %	0 %	60 %	40 %	77465065
92	NC_007494	TCCGG	2	10	90630	90639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_007494	GCGCA	2	10	90689	90698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_007494	GCAGG	2	10	91053	91062	20 %	0 %	60 %	20 %	77465066
95	NC_007494	CGGTG	2	10	91571	91580	0 %	20 %	60 %	20 %	77465066
96	NC_007494	CCGGC	2	10	91946	91955	0 %	0 %	40 %	60 %	77465067
97	NC_007494	GGCCG	2	10	92116	92125	0 %	0 %	60 %	40 %	77465067
98	NC_007494	CCCGC	2	10	93079	93088	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_007494	GCGCC	2	10	93414	93423	0 %	0 %	40 %	60 %	77465068
100	NC_007494	CCGAT	2	10	93644	93653	20 %	20 %	20 %	40 %	77465068
101	NC_007494	GCCGT	2	10	94025	94034	0 %	20 %	40 %	40 %	77465069
102	NC_007494	CCCGG	2	10	94067	94076	0 %	0 %	40 %	60 %	77465069
103	NC_007494	CCGGC	2	10	94997	95006	0 %	0 %	40 %	60 %	77465071
104	NC_007494	AGCCG	2	10	95992	96001	20 %	0 %	40 %	40 %	77465071
105	NC_007494	TGTCC	2	10	97697	97706	0 %	40 %	20 %	40 %	552536499
106	NC_007494	CGGCA	2	10	98854	98863	20 %	0 %	40 %	40 %	77465073
107	NC_007494	TCGGG	2	10	99457	99466	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007494	TCCCG	2	10	101270	101279	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_007494	CGCCA	2	10	101742	101751	20 %	0 %	20 %	60 %	552536500
110	NC_007494	GCGAC	2	10	102213	102222	20 %	0 %	40 %	40 %	77465076
111	NC_007494	ACGGC	2	10	103110	103119	20 %	0 %	40 %	40 %	77465078
112	NC_007494	CCGCA	2	10	103960	103969	20 %	0 %	20 %	60 %	77465078
113	NC_007494	CCGGC	2	10	106593	106602	0 %	0 %	40 %	60 %	77465080
114	NC_007494	GCCAG	2	10	107775	107784	20 %	0 %	40 %	40 %	77465081
115	NC_007494	TGCCT	2	10	109026	109035	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007494	GCGCC	2	10	110210	110219	0 %	0 %	40 %	60 %	77465084
117	NC_007494	CGGCC	2	10	110998	111007	0 %	0 %	40 %	60 %	77465084
118	NC_007494	GGGCG	2	10	111133	111142	0 %	0 %	80 %	20 %	77465084
119	NC_007494	CGAGG	2	10	112029	112038	20 %	0 %	60 %	20 %	77465085
120	NC_007494	CGCGG	2	10	113122	113131	0 %	0 %	60 %	40 %	77465086
121	NC_007494	AAATG	2	10	114014	114023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007494	GGAGC	2	10	117597	117606	20 %	0 %	60 %	20 %	77465089
123	NC_007494	CCGCT	2	10	117763	117772	0 %	20 %	20 %	60 %	77465089
124	NC_007494	TGCGC	2	10	118511	118520	0 %	20 %	40 %	40 %	77465090
125	NC_007494	ACCCG	2	10	118618	118627	20 %	0 %	20 %	60 %	77465090
126	NC_007494	CGGCG	2	10	120214	120223	0 %	0 %	60 %	40 %	77465091
127	NC_007494	GCATC	2	10	120304	120313	20 %	20 %	20 %	40 %	77465091
128	NC_007494	GCCGG	2	10	120746	120755	0 %	0 %	60 %	40 %	77465091
129	NC_007494	TGCCC	2	10	121621	121630	0 %	20 %	20 %	60 %	77465093
130	NC_007494	GGCGT	2	10	123811	123820	0 %	20 %	60 %	20 %	77465094
131	NC_007494	GACCG	2	10	123951	123960	20 %	0 %	40 %	40 %	77465094
132	NC_007494	CGGGC	2	10	125422	125431	0 %	0 %	60 %	40 %	77465095
133	NC_007494	CGCGG	2	10	126563	126572	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_007494	GAGGC	2	10	127208	127217	20 %	0 %	60 %	20 %	77465096
135	NC_007494	GCCCG	2	10	127349	127358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_007494	CCCGC	2	10	127656	127665	0 %	0 %	20 %	80 %	77465097
137	NC_007494	GTGGC	2	10	129358	129367	0 %	20 %	60 %	20 %	77465098
138	NC_007494	GCTCG	2	10	130704	130713	0 %	20 %	40 %	40 %	77465099
139	NC_007494	GCGCT	2	10	130714	130723	0 %	20 %	40 %	40 %	77465099
140	NC_007494	CCTCG	2	10	131812	131821	0 %	20 %	20 %	60 %	77465100
141	NC_007494	CAGGT	2	10	133184	133193	20 %	20 %	40 %	20 %	77465101
142	NC_007494	GCCGC	2	10	133458	133467	0 %	0 %	40 %	60 %	77465102
143	NC_007494	CCGCC	2	10	136265	136274	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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172	NC_007494	CATAT	2	10	162718	162727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_007494	CCTGT	2	10	165735	165744	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_007494	GCGCC	2	10	166338	166347	0 %	0 %	40 %	60 %	77465133
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181	NC_007494	GCGCC	2	10	170757	170766	0 %	0 %	40 %	60 %	77465139
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199	NC_007494	CGAGC	2	10	184704	184713	20 %	0 %	40 %	40 %	77465150
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201	NC_007494	GTGAT	2	10	187928	187937	20 %	40 %	40 %	0 %	77465151
202	NC_007494	CGGAC	2	10	188254	188263	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
203	NC_007494	GTCCC	2	10	188641	188650	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
204	NC_007494	CAGAA	2	10	194085	194094	60 %	0 %	20 %	20 %	77465158
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214	NC_007494	CCCCG	2	10	202263	202272	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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221	NC_007494	CCGCG	2	10	209598	209607	0 %	0 %	40 %	60 %	552536511
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244	NC_007494	TGCGC	2	10	233137	233146	0 %	20 %	40 %	40 %	77465194
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250	NC_007494	GTGCC	2	10	237170	237179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
251	NC_007494	GCCCC	2	10	237188	237197	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
252	NC_007494	CCCAG	2	10	239351	239360	20 %	0 %	20 %	60 %	77465199
253	NC_007494	GCCTC	2	10	240394	240403	0 %	20 %	20 %	60 %	77465200
254	NC_007494	GCGAT	2	10	242118	242127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
255	NC_007494	CGGGG	2	10	242403	242412	0 %	0 %	80 %	20 %	552536512
256	NC_007494	GCCGG	2	10	243707	243716	0 %	0 %	60 %	40 %	552536513
257	NC_007494	AGGCG	2	10	244219	244228	20 %	0 %	60 %	20 %	77465204
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259	NC_007494	CTCCC	2	10	246225	246234	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
260	NC_007494	TTCGG	2	10	246684	246693	0 %	40 %	40 %	20 %	77465206
261	NC_007494	CCGGA	2	10	246856	246865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_007494	CGGGC	2	10	248350	248359	0 %	0 %	60 %	40 %	77465208
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268	NC_007494	GGCAC	2	10	253967	253976	20 %	0 %	40 %	40 %	77465214
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270	NC_007494	TCCTT	2	10	255370	255379	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
271	NC_007494	TCTGC	2	10	258187	258196	0 %	40 %	20 %	40 %	77465218
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