MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 2

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007494	TCGTG	2	10	1014	1023	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007494	GATCA	2	10	2126	2135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007494	CTCAT	2	10	4637	4646	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007494	ATCCC	2	10	5145	5154	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007494	GCGCT	2	10	5636	5645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007494	TCGCG	2	10	14347	14356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007494	TGTCG	2	10	14699	14708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007494	GCGCC	2	10	22227	22236	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_007494	CGGGC	2	10	29122	29131	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007494	GGACC	2	10	29204	29213	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007494	CCCTG	2	10	29315	29324	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_007494	GAAGC	2	10	29424	29433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007494	TCGTG	2	10	34687	34696	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007494	GATCA	2	10	35799	35808	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007494	CTCAT	2	10	38309	38318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007494	ATCCC	2	10	38817	38826	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_007494	GCTGC	2	10	39344	39353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007494	GGTCG	2	10	40090	40099	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007494	ACGCG	2	10	42867	42876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007494	AGAAA	2	10	43030	43039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007494	CGGTC	2	10	44032	44041	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007494	TCCTC	2	10	44185	44194	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_007494	CCAGA	2	10	44747	44756	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007494	CGGCC	2	10	49481	49490	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_007494	GTCAG	2	10	52920	52929	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007494	CGTCC	2	10	61822	61831	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_007494	CCGGC	2	10	68189	68198	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_007494	GCCGG	2	10	86043	86052	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007494	GGCGG	2	10	88436	88445	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007494	TCCGG	2	10	90630	90639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007494	GCGCA	2	10	90689	90698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007494	CCCGC	2	10	93079	93088	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_007494	TCGGG	2	10	99457	99466	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007494	TCCCG	2	10	101270	101279	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_007494	TGCCT	2	10	109026	109035	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007494	AAATG	2	10	114014	114023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007494	CGCGG	2	10	126563	126572	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007494	GCCCG	2	10	127349	127358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_007494	CCGCC	2	10	136265	136274	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
40	NC_007494	GCCGC	2	10	139063	139072	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_007494	CGGGG	2	10	158902	158911	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007494	TCGAG	2	10	162397	162406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007494	CATAT	2	10	162718	162727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007494	CCTGT	2	10	165735	165744	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007494	CGGAG	2	10	168814	168823	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007494	ACGCT	2	10	173315	173324	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007494	GCCCG	2	10	183413	183422	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_007494	GAGGG	2	10	186116	186125	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007494	CGGAC	2	10	188254	188263	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007494	GTCCC	2	10	188641	188650	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_007494	GGCCC	2	10	202176	202185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_007494	CCCCG	2	10	202263	202272	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
53	NC_007494	CTAAT	2	10	205779	205788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007494	CGCGC	3	15	207593	207607	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_007494	GCCCG	2	10	215361	215370	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_007494	CGGTG	2	10	215845	215854	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007494	CGGCC	2	10	215863	215872	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_007494	GGCCG	2	10	228585	228594	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007494	CCGGC	2	10	231940	231949	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_007494	GTGCC	2	10	237170	237179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007494	GCCCC	2	10	237188	237197	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
62	NC_007494	GCGAT	2	10	242118	242127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007494	GGGAC	2	10	246101	246110	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007494	CTCCC	2	10	246225	246234	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
65	NC_007494	CCGGA	2	10	246856	246865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007494	CGGGC	2	10	251754	251763	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007494	TCCTT	2	10	255370	255379	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007494	GCCGG	2	10	275310	275319	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007494	TCGGT	2	10	275552	275561	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007494	CCGCC	2	10	277074	277083	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_007494	CATGA	2	10	277715	277724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007494	GACGC	2	10	277747	277756	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007494	GCCGG	2	10	277986	277995	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007494	GCGGG	2	10	287519	287528	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007494	CCCGA	2	10	320337	320346	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_007494	CGGCG	2	10	368839	368848	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_007494	GGTCA	2	10	371328	371337	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007494	GAACC	2	10	371575	371584	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007494	GGCGC	2	10	376934	376943	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_007494	GCCCC	2	10	386998	387007	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
81	NC_007494	GCCCG	2	10	387012	387021	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_007494	CCCCT	2	10	387155	387164	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
83	NC_007494	CGGCG	2	10	391309	391318	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007494	CTCCA	2	10	392422	392431	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_007494	GCCCG	2	10	392987	392996	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_007494	CGCCA	2	10	394016	394025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_007494	CTCCG	2	10	394419	394428	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_007494	GCCCG	2	10	403929	403938	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_007494	GGCCG	2	10	405676	405685	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007494	GACAG	2	10	405720	405729	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007494	CGGCG	2	10	406410	406419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007494	CGACC	2	10	415055	415064	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_007494	TGGCG	2	10	424762	424771	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007494	GCCGG	2	10	435834	435843	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007494	CCGGG	2	10	448480	448489	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007494	CGGGA	2	10	454877	454886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007494	GAGGC	2	10	457885	457894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007494	CCTGC	2	10	464684	464693	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_007494	CCCGG	2	10	482417	482426	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_007494	CTCCG	2	10	483664	483673	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_007494	CACCG	2	10	486944	486953	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_007494	CAGCG	2	10	491447	491456	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007494	GGCGG	2	10	492369	492378	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007494	ACGCT	2	10	495454	495463	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_007494	TCGCC	2	10	505624	505633	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_007494	CGCCC	2	10	513301	513310	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
107	NC_007494	TTCCC	2	10	524024	524033	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_007494	TTTCG	2	10	526865	526874	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007494	CCCCA	2	10	528188	528197	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
110	NC_007494	CCGTC	2	10	535026	535035	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_007494	GGGAC	2	10	556729	556738	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007494	CCCCG	2	10	591948	591957	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_007494	GCCGC	2	10	660276	660285	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_007494	GGGCC	2	10	678471	678480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007494	CGGTC	2	10	685576	685585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007494	AAGAG	2	10	692917	692926	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007494	CCGAG	2	10	694352	694361	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007494	CCGTC	2	10	699002	699011	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_007494	GCGGG	2	10	699041	699050	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007494	TCGGA	2	10	709936	709945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007494	CAGGA	3	15	712375	712389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007494	CACAG	2	10	723572	723581	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007494	AGCTT	2	10	725794	725803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007494	CCGAC	2	10	726930	726939	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_007494	CGTGC	2	10	728935	728944	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007494	CACGT	2	10	729348	729357	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007494	CCGCT	2	10	730051	730060	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_007494	TCAGC	2	10	731320	731329	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_007494	GCGGT	2	10	739049	739058	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007494	GGCCG	2	10	743259	743268	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007494	CGCCC	2	10	745221	745230	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
132	NC_007494	CCGTC	2	10	755201	755210	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_007494	CTGCC	2	10	755961	755970	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_007494	CGGGA	2	10	756124	756133	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007494	CCGTG	2	10	759399	759408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007494	CCGCG	2	10	763247	763256	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_007494	CCCGG	2	10	763725	763734	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_007494	CGCGG	2	10	768681	768690	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007494	GCCCC	2	10	772749	772758	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
140	NC_007494	CGGCC	2	10	773333	773342	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_007494	CTGCC	2	10	821004	821013	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_007494	CGCAG	2	10	838597	838606	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_007494	CCGAC	2	10	849961	849970	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_007494	GCGCC	2	10	855032	855041	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_007494	CGGCG	2	10	855099	855108	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007494	CGGAG	2	10	867729	867738	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007494	AGCCA	2	10	873417	873426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_007494	TCGGC	2	10	885743	885752	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_007494	GGGCG	2	10	889190	889199	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
150	NC_007494	CGGCC	2	10	891370	891379	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
151	NC_007494	ACCGG	2	10	891538	891547	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_007494	GACGG	2	10	903721	903730	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
153	NC_007494	TGTCT	2	10	912575	912584	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_007494	TGTCT	2	10	912586	912595	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_007494	CGGCG	2	10	918852	918861	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
156	NC_007494	AGGTG	2	10	924116	924125	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
157	NC_007494	GCCGC	2	10	925123	925132	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
158	NC_007494	CCCGT	2	10	927189	927198	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
159	NC_007494	CGGAT	2	10	927638	927647	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_007494	AGGCC	2	10	928333	928342	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_007494	AATTG	2	10	930702	930711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007494	CGGAG	2	10	932868	932877	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
163	NC_007494	CGGAG	2	10	934179	934188	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_007494	CGTGC	2	10	937510	937519	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.