MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 2

Total Repeats: 476

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007494	GCGA	2	8	2417	2424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007494	GCCA	2	8	2472	2479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007494	CGTC	2	8	3113	3120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007494	CGGA	2	8	5436	5443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007494	CGTC	2	8	5566	5573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007494	GGAC	2	8	9500	9507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007494	AGAA	2	8	9611	9618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007494	GCCG	2	8	13270	13277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007494	AGTG	2	8	13413	13420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007494	TTTC	2	8	13677	13684	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007494	AAGG	2	8	13884	13891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007494	CGGA	2	8	14389	14396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007494	CGGG	2	8	16160	16167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007494	CCGG	2	8	16274	16281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007494	CCGG	2	8	17174	17181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007494	CGGG	2	8	20060	20067	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007494	GGGC	2	8	21958	21965	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007494	GGAA	2	8	21978	21985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007494	GAGG	2	8	22318	22325	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007494	CCGG	2	8	23945	23952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007494	CCGC	2	8	28861	28868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_007494	CCGG	2	8	29142	29149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007494	TCCT	2	8	29260	29267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007494	CGGA	2	8	31210	31217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007494	GACG	2	8	31260	31267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007494	GCCG	2	8	31497	31504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007494	CGGA	2	8	33340	33347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007494	GTTT	2	8	33429	33436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007494	GCGG	2	8	33479	33486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007494	GCGA	2	8	36090	36097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007494	GCCA	2	8	36145	36152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007494	CGTC	2	8	36786	36793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007494	TTGC	2	8	39317	39324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007494	GCCA	2	8	39556	39563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007494	TTGT	2	8	40279	40286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007494	AATG	2	8	40413	40420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007494	GCAC	2	8	41122	41129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007494	GCGA	2	8	42934	42941	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007494	ACGA	2	8	43429	43436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007494	TCGG	2	8	43896	43903	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007494	TCGG	2	8	43978	43985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007494	CCGG	2	8	45724	45731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007494	CCCG	2	8	45938	45945	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_007494	CGAT	2	8	46159	46166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007494	CGTC	2	8	52886	52893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007494	GGCG	2	8	56858	56865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007494	GCAG	2	8	56889	56896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007494	TGCC	2	8	60273	60280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007494	CGCC	2	8	61600	61607	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_007494	CCCT	2	8	62648	62655	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_007494	GGAG	2	8	68295	68302	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007494	CCGA	2	8	71690	71697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007494	CCGC	2	8	87375	87382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_007494	GCCC	2	8	88451	88458	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_007494	CCGA	2	8	94455	94462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007494	CGGC	2	8	97272	97279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007494	GCGG	2	8	100649	100656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007494	CCGG	2	8	100920	100927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007494	TGCA	2	8	101193	101200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007494	CGAT	2	8	101315	101322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007494	GCCT	2	8	105328	105335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007494	GACG	2	8	106761	106768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007494	CCCG	2	8	109052	109059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_007494	TCCT	2	8	109623	109630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007494	GGAG	2	8	110004	110011	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007494	GCCG	2	8	112341	112348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007494	CCGG	2	8	113942	113949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007494	AGGC	2	8	114056	114063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007494	GGCC	2	8	114767	114774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007494	CGGG	2	8	114899	114906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007494	CGGG	2	8	114991	114998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007494	CGTC	2	8	115007	115014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007494	GGCG	2	8	117102	117109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007494	GCCC	2	8	119405	119412	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_007494	CCGG	2	8	121490	121497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007494	GTCG	2	8	124205	124212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007494	TTCC	2	8	124447	124454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007494	TGCC	2	8	124481	124488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007494	GGCT	2	8	126429	126436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007494	AGCC	2	8	126914	126921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007494	CCGG	2	8	127328	127335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007494	CGTC	2	8	129857	129864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007494	GCCC	2	8	131748	131755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_007494	CTGC	2	8	134157	134164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007494	GGCC	2	8	134829	134836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007494	GCCG	2	8	135153	135160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007494	TGCG	2	8	136288	136295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007494	CCCG	3	12	136318	136329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_007494	CGGC	2	8	146082	146089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007494	GCCG	2	8	146094	146101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007494	GCGG	2	8	146712	146719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007494	GCCG	2	8	147210	147217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007494	GGCG	2	8	149074	149081	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007494	GGCC	2	8	151402	151409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007494	GGCG	2	8	152312	152319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007494	CAAG	2	8	155445	155452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007494	GCCC	2	8	158825	158832	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_007494	ACCG	2	8	159065	159072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007494	GGCC	2	8	160436	160443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007494	GCCG	2	8	160487	160494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007494	CGGC	2	8	162621	162628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007494	CCGG	2	8	165812	165819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007494	GCAG	2	8	165848	165855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007494	AGGC	2	8	165918	165925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007494	GGCG	2	8	165956	165963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007494	GGTG	2	8	166507	166514	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007494	GACA	2	8	168766	168773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007494	CGAC	2	8	171845	171852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007494	ATCG	2	8	171861	171868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007494	AGGC	2	8	171911	171918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007494	TGCG	2	8	173185	173192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007494	GCCG	2	8	173219	173226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007494	GCCG	2	8	173287	173294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007494	GAGG	2	8	173539	173546	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007494	ACCG	2	8	183295	183302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007494	CTGA	2	8	186205	186212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007494	CGGC	2	8	188072	188079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007494	GGCC	2	8	188427	188434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007494	GCAG	2	8	188505	188512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007494	CCGA	2	8	188590	188597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007494	GGTC	2	8	190196	190203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007494	GCCT	2	8	190377	190384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007494	GTCC	2	8	191167	191174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007494	TGTA	2	8	191379	191386	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007494	CGGG	2	8	191560	191567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007494	GGAG	2	8	200028	200035	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007494	CGGG	2	8	200094	200101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007494	CGGC	2	8	203979	203986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007494	CGAA	2	8	205714	205721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007494	CGGC	2	8	207534	207541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007494	CGGT	2	8	212571	212578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007494	CGCC	2	8	215323	215330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_007494	GGGC	2	8	216044	216051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007494	GACC	2	8	216404	216411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007494	CCGG	2	8	216412	216419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007494	CTCC	2	8	223188	223195	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_007494	CGGC	2	8	227918	227925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007494	GGAA	2	8	227947	227954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007494	CGTC	2	8	231298	231305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007494	CTGC	2	8	237067	237074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007494	GCCC	2	8	238571	238578	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_007494	CAGC	2	8	239781	239788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007494	GCCC	2	8	240033	240040	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_007494	CCGC	2	8	242218	242225	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_007494	GCCT	2	8	244149	244156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007494	TCCC	2	8	246010	246017	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_007494	GCGG	2	8	246142	246149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007494	GGCG	2	8	246249	246256	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007494	GCCC	2	8	254285	254292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_007494	GGGC	2	8	255497	255504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007494	CAGC	2	8	257851	257858	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007494	AACG	2	8	261726	261733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_007494	CGGG	2	8	269489	269496	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_007494	CCTG	2	8	274158	274165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007494	GGCG	2	8	275200	275207	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_007494	GGGC	2	8	275262	275269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_007494	CGCC	2	8	276711	276718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
159	NC_007494	GCTC	2	8	276834	276841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_007494	CCGG	2	8	277043	277050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_007494	TAGC	2	8	277765	277772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_007494	TCCC	2	8	278084	278091	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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164	NC_007494	CGGC	2	8	278306	278313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_007494	CGGG	2	8	278331	278338	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_007494	CCGG	2	8	361515	361522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_007494	GCGG	2	8	371021	371028	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
187	NC_007494	CCGT	2	8	373403	373410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_007494	GGCG	2	8	376119	376126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_007494	CGGC	2	8	376822	376829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_007494	GAAG	2	8	376876	376883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_007494	GTGG	2	8	376975	376982	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_007494	CCAG	2	8	377175	377182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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234	NC_007494	CCGC	2	8	424543	424550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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262	NC_007494	CGCA	2	8	488498	488505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.