MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREL1

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007491	TGAG	2	8	2725	2732	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007491	GCCG	2	8	6229	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007491	CCTG	2	8	6245	6252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007491	CCGG	2	8	13177	13184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007491	GTGC	2	8	16179	16186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007491	TGCG	2	8	16200	16207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007491	GCTT	2	8	16382	16389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007491	CACT	2	8	17249	17256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007491	GCAG	2	8	18433	18440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007491	CCAG	2	8	18848	18855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007491	CGCA	2	8	18905	18912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007491	CTCC	2	8	19048	19055	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_007491	GGCA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007491	TGTT	2	8	23317	23324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007491	GGCC	2	8	33447	33454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007491	CCCG	2	8	39910	39917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_007491	TTTG	2	8	39944	39951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007491	GGCA	2	8	45948	45955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007491	GCCA	2	8	46654	46661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007491	CTTC	2	8	48311	48318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007491	TTGC	2	8	60883	60890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007491	GGGT	2	8	62005	62012	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007491	CCGA	2	8	68986	68993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007491	GTGC	2	8	73000	73007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007491	CGAA	2	8	74179	74186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007491	GAGG	2	8	77351	77358	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007491	CTCA	2	8	79024	79031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007491	TCGG	2	8	85072	85079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007491	GGCC	2	8	85232	85239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007491	CTCG	2	8	85653	85660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007491	CGCA	2	8	86414	86421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007491	CGAG	2	8	90903	90910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007491	GATG	2	8	94015	94022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007491	TCTT	2	8	95107	95114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007491	CGCA	2	8	95254	95261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007491	AGAC	2	8	105315	105322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007491	TGGG	2	8	105356	105363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007491	GATC	2	8	109094	109101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007491	CGGT	2	8	110453	110460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007491	CGAG	2	8	110482	110489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007491	CCGA	2	8	114044	114051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007491	CTCC	2	8	114260	114267	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_007491	GAAG	2	8	118900	118907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007491	GTTC	2	8	124444	124451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007491	ATCG	2	8	124539	124546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007491	CGAG	2	8	125163	125170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007491	GTTC	2	8	133150	133157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007491	ATTG	2	8	133711	133718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007491	GGTG	2	8	133920	133927	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007491	ATCG	2	8	135532	135539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007491	GCTC	2	8	135633	135640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007491	CCGA	2	8	139719	139726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007491	CCGG	2	8	141377	141384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007491	GGCC	2	8	145059	145066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007491	CCGC	2	8	150746	150753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_007491	TGAA	2	8	152120	152127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007491	ATGT	2	8	153934	153941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007491	CTGG	2	8	160651	160658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007491	GGGC	2	8	162212	162219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007491	AAAG	2	8	167262	167269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007491	ACCC	2	8	168645	168652	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_007491	CGGG	2	8	171101	171108	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007491	CATC	2	8	172277	172284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007491	ATTG	2	8	172421	172428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007491	GCCC	2	8	172482	172489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_007491	GTTG	2	8	173368	173375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007491	GTTG	2	8	173671	173678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007491	GGAA	2	8	173836	173843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007491	ACAG	2	8	173846	173853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007491	AGCC	2	8	173877	173884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007491	ACCC	2	8	173990	173997	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_007491	GATC	2	8	174038	174045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007491	TTGG	2	8	174923	174930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007491	GTCG	2	8	174934	174941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007491	ACGT	2	8	175897	175904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007491	CGGT	2	8	175941	175948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007491	CAAC	2	8	178207	178214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007491	CGAC	2	8	181426	181433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007491	ACGT	2	8	181472	181479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007491	CACC	2	8	182257	182264	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_007491	CCAA	2	8	182446	182453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007491	CCTT	2	8	183890	183897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007491	ATAC	2	8	183996	184003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007491	GCCC	2	8	185109	185116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_007491	GCAG	2	8	198926	198933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007491	CGAA	2	8	201645	201652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007491	GTTC	2	8	203855	203862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007491	TTGA	2	8	203920	203927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007491	GTAC	2	8	203938	203945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007491	GTAC	2	8	206137	206144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007491	CACC	2	8	207048	207055	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_007491	ACGC	2	8	208291	208298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007491	CCGA	2	8	210663	210670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007491	GCTC	2	8	210830	210837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007491	CGTC	2	8	218278	218285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007491	ACGG	2	8	222310	222317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007491	TGGT	2	8	222686	222693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007491	GCAC	2	8	222861	222868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007491	CGTG	2	8	224193	224200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007491	TCGC	2	8	228975	228982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007491	CGAT	2	8	229438	229445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007491	CAGT	2	8	232290	232297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007491	TCGA	2	8	237272	237279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007491	GCGA	2	8	237290	237297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007491	ACTG	2	8	237521	237528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007491	GATC	2	8	244156	244163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007491	TGGC	2	8	244316	244323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007491	CTGT	2	8	244348	244355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007491	TGGG	2	8	247241	247248	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007491	GGTC	2	8	247338	247345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007491	CGGC	2	8	247651	247658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007491	GACA	2	8	247673	247680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007491	TCCT	2	8	249664	249671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007491	TCCA	2	8	252815	252822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007491	GAAG	2	8	253482	253489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007491	ATCG	2	8	253578	253585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007491	GTCA	2	8	256850	256857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007491	CTGA	2	8	258340	258347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007491	TCGA	2	8	264816	264823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007491	GTCG	2	8	268092	268099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007491	CGCC	2	8	270883	270890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_007491	TCCC	2	8	271366	271373	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_007491	TCGA	2	8	271467	271474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007491	GTCT	2	8	271480	271487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.