MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREL1

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007491	TG	3	6	516	521	0 %	50 %	50 %	0 %	77454568
2	NC_007491	CG	3	6	2177	2182	0 %	0 %	50 %	50 %	77454570
3	NC_007491	CG	3	6	2342	2347	0 %	0 %	50 %	50 %	77454570
4	NC_007491	CG	3	6	4636	4641	0 %	0 %	50 %	50 %	77454571
5	NC_007491	GA	3	6	4722	4727	50 %	0 %	50 %	0 %	77454571
6	NC_007491	TG	3	6	4933	4938	0 %	50 %	50 %	0 %	77454571
7	NC_007491	GC	3	6	5311	5316	0 %	0 %	50 %	50 %	77454571
8	NC_007491	TC	3	6	5392	5397	0 %	50 %	0 %	50 %	77454571
9	NC_007491	TC	3	6	6353	6358	0 %	50 %	0 %	50 %	77454573
10	NC_007491	CG	3	6	7150	7155	0 %	0 %	50 %	50 %	77454574
11	NC_007491	CG	3	6	7996	8001	0 %	0 %	50 %	50 %	77454575
12	NC_007491	CA	3	6	8813	8818	50 %	0 %	0 %	50 %	77454575
13	NC_007491	AG	3	6	9387	9392	50 %	0 %	50 %	0 %	77454575
14	NC_007491	GC	4	8	13360	13367	0 %	0 %	50 %	50 %	77454576
15	NC_007491	GC	3	6	13450	13455	0 %	0 %	50 %	50 %	77454576
16	NC_007491	GC	4	8	13470	13477	0 %	0 %	50 %	50 %	77454576
17	NC_007491	CG	3	6	14974	14979	0 %	0 %	50 %	50 %	77454578
18	NC_007491	CG	3	6	16643	16648	0 %	0 %	50 %	50 %	77454579
19	NC_007491	GC	3	6	16829	16834	0 %	0 %	50 %	50 %	77454579
20	NC_007491	GT	3	6	17119	17124	0 %	50 %	50 %	0 %	77454579
21	NC_007491	GC	3	6	22595	22600	0 %	0 %	50 %	50 %	77454584
22	NC_007491	AG	3	6	22785	22790	50 %	0 %	50 %	0 %	77454584
23	NC_007491	TC	3	6	22803	22808	0 %	50 %	0 %	50 %	77454584
24	NC_007491	CG	3	6	22904	22909	0 %	0 %	50 %	50 %	77454584
25	NC_007491	GC	4	8	24412	24419	0 %	0 %	50 %	50 %	77454586
26	NC_007491	CA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	0 %	50 %	77454588
27	NC_007491	GC	3	6	26287	26292	0 %	0 %	50 %	50 %	77454589
28	NC_007491	CA	3	6	26387	26392	50 %	0 %	0 %	50 %	77454589
29	NC_007491	GC	3	6	26793	26798	0 %	0 %	50 %	50 %	77454589
30	NC_007491	GC	3	6	27231	27236	0 %	0 %	50 %	50 %	77454589
31	NC_007491	CG	3	6	27869	27874	0 %	0 %	50 %	50 %	77454589
32	NC_007491	AC	3	6	28152	28157	50 %	0 %	0 %	50 %	77454589
33	NC_007491	GC	3	6	28411	28416	0 %	0 %	50 %	50 %	77454589
34	NC_007491	CA	3	6	28740	28745	50 %	0 %	0 %	50 %	77454590
35	NC_007491	TC	3	6	28841	28846	0 %	50 %	0 %	50 %	77454590
36	NC_007491	GT	3	6	29346	29351	0 %	50 %	50 %	0 %	77454590
37	NC_007491	CG	3	6	30169	30174	0 %	0 %	50 %	50 %	77454590
38	NC_007491	TC	3	6	30507	30512	0 %	50 %	0 %	50 %	77454590
39	NC_007491	TC	3	6	31425	31430	0 %	50 %	0 %	50 %	77454591
40	NC_007491	GC	3	6	32197	32202	0 %	0 %	50 %	50 %	77454591
41	NC_007491	AC	3	6	32988	32993	50 %	0 %	0 %	50 %	77454592
42	NC_007491	CT	3	6	33053	33058	0 %	50 %	0 %	50 %	77454592
43	NC_007491	CG	3	6	36441	36446	0 %	0 %	50 %	50 %	77454595
44	NC_007491	CA	3	6	36712	36717	50 %	0 %	0 %	50 %	77454595
45	NC_007491	TC	3	6	37407	37412	0 %	50 %	0 %	50 %	77454595
46	NC_007491	CG	3	6	38127	38132	0 %	0 %	50 %	50 %	77454596
47	NC_007491	CG	3	6	38617	38622	0 %	0 %	50 %	50 %	77454596
48	NC_007491	GC	3	6	38960	38965	0 %	0 %	50 %	50 %	77454596
49	NC_007491	GC	3	6	39036	39041	0 %	0 %	50 %	50 %	77454597
50	NC_007491	GT	3	6	39447	39452	0 %	50 %	50 %	0 %	77454597
51	NC_007491	GC	3	6	39608	39613	0 %	0 %	50 %	50 %	77454597
52	NC_007491	GC	3	6	40420	40425	0 %	0 %	50 %	50 %	77454599
53	NC_007491	GA	3	6	40795	40800	50 %	0 %	50 %	0 %	77454599
54	NC_007491	CG	3	6	41723	41728	0 %	0 %	50 %	50 %	77454600
55	NC_007491	GC	3	6	42007	42012	0 %	0 %	50 %	50 %	77454600
56	NC_007491	CG	3	6	42203	42208	0 %	0 %	50 %	50 %	77454600
57	NC_007491	AT	3	6	43609	43614	50 %	50 %	0 %	0 %	77454602
58	NC_007491	AT	3	6	43839	43844	50 %	50 %	0 %	0 %	77454602
59	NC_007491	GA	3	6	44513	44518	50 %	0 %	50 %	0 %	77454603
60	NC_007491	GT	3	6	45069	45074	0 %	50 %	50 %	0 %	77454604
61	NC_007491	CG	3	6	45743	45748	0 %	0 %	50 %	50 %	77454604
62	NC_007491	CA	3	6	46798	46803	50 %	0 %	0 %	50 %	77454606
63	NC_007491	CG	4	8	46842	46849	0 %	0 %	50 %	50 %	77454606
64	NC_007491	GC	3	6	46937	46942	0 %	0 %	50 %	50 %	77454606
65	NC_007491	GC	3	6	46965	46970	0 %	0 %	50 %	50 %	77454606
66	NC_007491	AC	3	6	47245	47250	50 %	0 %	0 %	50 %	77454606
67	NC_007491	GC	3	6	47924	47929	0 %	0 %	50 %	50 %	77454607
68	NC_007491	CA	3	6	49217	49222	50 %	0 %	0 %	50 %	77454608
69	NC_007491	AC	3	6	50250	50255	50 %	0 %	0 %	50 %	77454609
70	NC_007491	CG	3	6	52010	52015	0 %	0 %	50 %	50 %	77454611
71	NC_007491	CT	3	6	52718	52723	0 %	50 %	0 %	50 %	77454613
72	NC_007491	CG	3	6	52764	52769	0 %	0 %	50 %	50 %	77454613
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74	NC_007491	CG	3	6	53909	53914	0 %	0 %	50 %	50 %	77454616
75	NC_007491	CG	3	6	54641	54646	0 %	0 %	50 %	50 %	77454617
76	NC_007491	AC	3	6	54701	54706	50 %	0 %	0 %	50 %	77454617
77	NC_007491	AC	3	6	54878	54883	50 %	0 %	0 %	50 %	77454617
78	NC_007491	TC	3	6	55565	55570	0 %	50 %	0 %	50 %	77454617
79	NC_007491	TC	3	6	55737	55742	0 %	50 %	0 %	50 %	77454617
80	NC_007491	CG	3	6	55780	55785	0 %	0 %	50 %	50 %	77454617
81	NC_007491	GC	3	6	55918	55923	0 %	0 %	50 %	50 %	77454617
82	NC_007491	CA	3	6	56540	56545	50 %	0 %	0 %	50 %	77454617
83	NC_007491	CG	3	6	56757	56762	0 %	0 %	50 %	50 %	77454617
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88	NC_007491	GA	3	6	60430	60435	50 %	0 %	50 %	0 %	77454622
89	NC_007491	GC	3	6	60613	60618	0 %	0 %	50 %	50 %	77454622
90	NC_007491	CG	3	6	60665	60670	0 %	0 %	50 %	50 %	77454622
91	NC_007491	AT	3	6	61618	61623	50 %	50 %	0 %	0 %	77454623
92	NC_007491	CG	3	6	62254	62259	0 %	0 %	50 %	50 %	77454624
93	NC_007491	CG	3	6	62709	62714	0 %	0 %	50 %	50 %	77454624
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96	NC_007491	TC	4	8	64942	64949	0 %	50 %	0 %	50 %	77454628
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98	NC_007491	TG	3	6	65210	65215	0 %	50 %	50 %	0 %	77454628
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108	NC_007491	TC	3	6	71518	71523	0 %	50 %	0 %	50 %	77454635
109	NC_007491	GC	3	6	71637	71642	0 %	0 %	50 %	50 %	77454635
110	NC_007491	GA	3	6	71767	71772	50 %	0 %	50 %	0 %	77454636
111	NC_007491	CG	3	6	72008	72013	0 %	0 %	50 %	50 %	77454636
112	NC_007491	GC	3	6	72617	72622	0 %	0 %	50 %	50 %	77454637
113	NC_007491	GC	3	6	72750	72755	0 %	0 %	50 %	50 %	77454637
114	NC_007491	CA	3	6	72773	72778	50 %	0 %	0 %	50 %	77454637
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117	NC_007491	CG	3	6	73755	73760	0 %	0 %	50 %	50 %	77454639
118	NC_007491	AC	3	6	74636	74641	50 %	0 %	0 %	50 %	77454640
119	NC_007491	AG	3	6	75257	75262	50 %	0 %	50 %	0 %	77454641
120	NC_007491	CA	3	6	75685	75690	50 %	0 %	0 %	50 %	77454642
121	NC_007491	GC	3	6	76050	76055	0 %	0 %	50 %	50 %	77454643
122	NC_007491	GA	3	6	76643	76648	50 %	0 %	50 %	0 %	77454643
123	NC_007491	AG	3	6	76821	76826	50 %	0 %	50 %	0 %	77454644
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127	NC_007491	TG	3	6	77553	77558	0 %	50 %	50 %	0 %	77454645
128	NC_007491	CT	3	6	77571	77576	0 %	50 %	0 %	50 %	77454645
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.