MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007490	AGGGC	2	10	2400	2409	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007490	AGGGC	2	10	2538	2547	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007490	AGGGC	2	10	2812	2821	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007490	AGGGC	2	10	2950	2959	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007490	CAGTG	2	10	6148	6157	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007490	GCCCG	2	10	12393	12402	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_007490	CGGCT	2	10	15013	15022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007490	CGGCT	2	10	26996	27005	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007490	ACGCG	2	10	31176	31185	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007490	CCTTC	2	10	40573	40582	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_007490	GCCGG	2	10	44440	44449	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_007490	GCGCC	2	10	46902	46911	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_007490	GCGGG	2	10	54500	54509	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007490	TGTCG	2	10	62015	62024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007490	GACCA	2	10	63089	63098	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007490	CCAAC	2	10	85260	85269	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_007490	TGAGC	2	10	85385	85394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007490	GACCC	2	10	92514	92523	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007490	AATGC	2	10	98684	98693	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007490	ATGGG	2	10	100409	100418	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007490	TCGGC	2	10	100567	100576	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.