MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007490	CCCCG	2	10	581	590	0 %	0 %	20 %	80 %	552530954
2	NC_007490	CGCAG	2	10	936	945	20 %	0 %	40 %	40 %	552530954
3	NC_007490	CGCGG	2	10	4108	4117	0 %	0 %	60 %	40 %	552530955
4	NC_007490	CACGC	2	10	4691	4700	20 %	0 %	20 %	60 %	552530956
5	NC_007490	GGCCC	2	10	8525	8534	0 %	0 %	40 %	60 %	77404780
6	NC_007490	CCGCT	2	10	9456	9465	0 %	20 %	20 %	60 %	552530963
7	NC_007490	GCGAA	3	15	16519	16533	40 %	0 %	40 %	20 %	77404790
8	NC_007490	GCAAC	2	10	17876	17885	40 %	0 %	20 %	40 %	552530964
9	NC_007490	CGGCG	2	10	19180	19189	0 %	0 %	60 %	40 %	77404792
10	NC_007490	AGGGG	2	10	23354	23363	20 %	0 %	80 %	0 %	77404796
11	NC_007490	ACCGC	2	10	30727	30736	20 %	0 %	20 %	60 %	552530966
12	NC_007490	AGCGC	2	10	36888	36897	20 %	0 %	40 %	40 %	77404806
13	NC_007490	CCATG	2	10	39411	39420	20 %	20 %	20 %	40 %	77404810
14	NC_007490	CGATC	2	10	40815	40824	20 %	20 %	20 %	40 %	77404811
15	NC_007490	CGATG	2	10	42466	42475	20 %	20 %	40 %	20 %	77404812
16	NC_007490	CGTAT	2	10	44914	44923	20 %	40 %	20 %	20 %	77404813
17	NC_007490	CGGCG	2	10	45734	45743	0 %	0 %	60 %	40 %	77404814
18	NC_007490	GATGA	2	10	49154	49163	40 %	20 %	40 %	0 %	552530967
19	NC_007490	TGCGT	2	10	50325	50334	0 %	40 %	40 %	20 %	77404818
20	NC_007490	GGCCT	2	10	51481	51490	0 %	20 %	40 %	40 %	77404819
21	NC_007490	TGCCT	2	10	51555	51564	0 %	40 %	20 %	40 %	77404819
22	NC_007490	GAGGG	2	10	53320	53329	20 %	0 %	80 %	0 %	77404822
23	NC_007490	CCTGC	2	10	57203	57212	0 %	20 %	20 %	60 %	77404826
24	NC_007490	TCGGC	2	10	58375	58384	0 %	20 %	40 %	40 %	77404827
25	NC_007490	GCCTT	2	10	58879	58888	0 %	40 %	20 %	40 %	77404827
26	NC_007490	GCGCC	2	10	59587	59596	0 %	0 %	40 %	60 %	77404828
27	NC_007490	TGCGG	2	10	59692	59701	0 %	20 %	60 %	20 %	77404828
28	NC_007490	CTGGC	2	10	60192	60201	0 %	20 %	40 %	40 %	77404829
29	NC_007490	CCTGC	2	10	60641	60650	0 %	20 %	20 %	60 %	77404829
30	NC_007490	GCGTG	2	10	68753	68762	0 %	20 %	60 %	20 %	77404836
31	NC_007490	CGGAG	2	10	68798	68807	20 %	0 %	60 %	20 %	77404836
32	NC_007490	CAGGG	2	10	69666	69675	20 %	0 %	60 %	20 %	77404837
33	NC_007490	CATCG	2	10	70461	70470	20 %	20 %	20 %	40 %	77404838
34	NC_007490	GCGGA	2	10	73478	73487	20 %	0 %	60 %	20 %	77404840
35	NC_007490	CGGTG	2	10	74275	74284	0 %	20 %	60 %	20 %	77404842
36	NC_007490	AATGC	2	10	75208	75217	40 %	20 %	20 %	20 %	77404844
37	NC_007490	GCTCG	2	10	76022	76031	0 %	20 %	40 %	40 %	77404844
38	NC_007490	CCTCG	2	10	81136	81145	0 %	20 %	20 %	60 %	77404850
39	NC_007490	GTCCG	2	10	83459	83468	0 %	20 %	40 %	40 %	77404851
40	NC_007490	TGATG	2	10	86565	86574	20 %	40 %	40 %	0 %	552530970
41	NC_007490	ACTGA	2	10	88139	88148	40 %	20 %	20 %	20 %	77404853
42	NC_007490	TGGCG	2	10	89240	89249	0 %	20 %	60 %	20 %	77404853
43	NC_007490	GATCT	2	10	89979	89988	20 %	40 %	20 %	20 %	77404853
44	NC_007490	GCAGG	2	10	96724	96733	20 %	0 %	60 %	20 %	77404858
45	NC_007490	GCAGG	2	10	98246	98255	20 %	0 %	60 %	20 %	77404860
46	NC_007490	TGCGC	2	10	99819	99828	0 %	20 %	40 %	40 %	77404863

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.