MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 1274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007490	TGC	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530954
2	NC_007490	CCT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530954
3	NC_007490	CTC	2	6	280	285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530954
4	NC_007490	ACC	2	6	331	336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530954
5	NC_007490	TCC	2	6	349	354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530954
6	NC_007490	CGC	2	6	373	378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530954
7	NC_007490	AGA	2	6	455	460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	552530954
8	NC_007490	CGA	2	6	492	497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530954
9	NC_007490	TCA	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530954
10	NC_007490	GCG	2	6	536	541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530954
11	NC_007490	ACC	2	6	560	565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530954
12	NC_007490	CGC	2	6	633	638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530954
13	NC_007490	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530954
14	NC_007490	ATC	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530954
15	NC_007490	GGC	2	6	999	1004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530954
16	NC_007490	GCT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
17	NC_007490	ACG	3	9	3211	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404778
18	NC_007490	ATG	2	6	3223	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404778
19	NC_007490	GCA	2	6	3285	3290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404778
20	NC_007490	ACT	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404778
21	NC_007490	CAC	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404778
22	NC_007490	AGA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404778
23	NC_007490	GCT	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
24	NC_007490	GCG	2	6	3532	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404778
25	NC_007490	ATG	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404778
26	NC_007490	CGG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404778
27	NC_007490	CAA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404778
28	NC_007490	CTG	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
29	NC_007490	GAG	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404778
30	NC_007490	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
31	NC_007490	CAT	2	6	3870	3875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404778
32	NC_007490	GAA	2	6	3890	3895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404778
33	NC_007490	AGG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530955
34	NC_007490	CCA	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530955
35	NC_007490	TTG	2	6	4173	4178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	552530955
36	NC_007490	CTG	2	6	4212	4217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530955
37	NC_007490	TCA	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530955
38	NC_007490	GCG	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530955
39	NC_007490	TGC	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530955
40	NC_007490	GCT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530955
41	NC_007490	CAA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	552530955
42	NC_007490	TGA	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	552530955
43	NC_007490	CTA	2	6	4451	4456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530955
44	NC_007490	CTG	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530956
45	NC_007490	AGC	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530956
46	NC_007490	CCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530956
47	NC_007490	GCA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530957
48	NC_007490	CCA	2	6	4966	4971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530957
49	NC_007490	GAG	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530957
50	NC_007490	AGA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	552530957
51	NC_007490	CGC	2	6	5118	5123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530957
52	NC_007490	GAG	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530957
53	NC_007490	CGG	2	6	5241	5246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530958
54	NC_007490	GTG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	552530958
55	NC_007490	CGC	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530959
56	NC_007490	GGC	2	6	6494	6499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530960
57	NC_007490	TCA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530960
58	NC_007490	GCC	2	6	6591	6596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530960
59	NC_007490	CTC	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530960
60	NC_007490	GCT	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530960
61	NC_007490	GCC	2	6	7361	7366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404779
62	NC_007490	ATG	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404779
63	NC_007490	AAC	2	6	7450	7455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404779
64	NC_007490	GAC	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404779
65	NC_007490	AGG	2	6	7592	7597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404779
66	NC_007490	GCC	2	6	7602	7607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404779
67	NC_007490	ATG	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404779
68	NC_007490	CGG	2	6	7784	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404779
69	NC_007490	AGG	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404779
70	NC_007490	CGG	2	6	7796	7801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404779
71	NC_007490	GCC	2	6	8046	8051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530961
72	NC_007490	CCG	2	6	8232	8237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404780
73	NC_007490	GCT	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404780
74	NC_007490	AGA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404780
75	NC_007490	GGC	2	6	8500	8505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404780
76	NC_007490	CCG	2	6	8543	8548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404780
77	NC_007490	GGC	2	6	8557	8562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404780
78	NC_007490	GCC	2	6	8891	8896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530962
79	NC_007490	GGA	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530962
80	NC_007490	TGC	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530962
81	NC_007490	GGA	2	6	8992	8997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530962
82	NC_007490	GCC	2	6	9080	9085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530962
83	NC_007490	CTC	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530962
84	NC_007490	TCA	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530962
85	NC_007490	CGC	2	6	9240	9245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530963
86	NC_007490	GGC	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530963
87	NC_007490	GCC	3	9	9319	9327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530963
88	NC_007490	TCC	2	6	9340	9345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530963
89	NC_007490	TCC	2	6	9388	9393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530963
90	NC_007490	GTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	552530963
91	NC_007490	GCG	2	6	9466	9471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530963
92	NC_007490	GGC	2	6	9585	9590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
93	NC_007490	GGC	2	6	9604	9609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
94	NC_007490	GCC	2	6	9710	9715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404782
95	NC_007490	TCA	2	6	9781	9786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404782
96	NC_007490	GAG	2	6	9926	9931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404782
97	NC_007490	CCG	2	6	9945	9950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404782
98	NC_007490	CGG	2	6	9955	9960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
99	NC_007490	CCG	2	6	10099	10104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404782
100	NC_007490	CGG	2	6	10156	10161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
101	NC_007490	GAA	2	6	10223	10228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404782
102	NC_007490	CCG	2	6	10286	10291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404782
103	NC_007490	CGA	2	6	10397	10402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404782
104	NC_007490	CGG	2	6	10461	10466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
105	NC_007490	CGC	2	6	10519	10524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404782
106	NC_007490	GTC	2	6	10601	10606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404782
107	NC_007490	CAT	2	6	10622	10627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404782
108	NC_007490	TTC	2	6	10643	10648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404782
109	NC_007490	GCG	2	6	10682	10687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
110	NC_007490	GGC	2	6	10691	10696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
111	NC_007490	GGC	2	6	10733	10738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
112	NC_007490	GCA	2	6	10812	10817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404782
113	NC_007490	GGC	2	6	10820	10825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
114	NC_007490	AGC	2	6	11024	11029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404783
115	NC_007490	GCC	2	6	11040	11045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404783
116	NC_007490	CAT	2	6	11067	11072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404783
117	NC_007490	CGC	2	6	11133	11138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404783
118	NC_007490	CCA	2	6	11220	11225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404783
119	NC_007490	CGT	2	6	11241	11246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404783
120	NC_007490	CCA	2	6	11256	11261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404783
121	NC_007490	GCG	2	6	11336	11341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404783
122	NC_007490	CGC	2	6	11727	11732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404784
123	NC_007490	GAG	2	6	11798	11803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404784
124	NC_007490	ACG	2	6	12007	12012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404784
125	NC_007490	AGA	2	6	12053	12058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404784
126	NC_007490	CAT	2	6	12108	12113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404784
127	NC_007490	CGA	2	6	12134	12139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404784
128	NC_007490	TCC	2	6	12191	12196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404784
129	NC_007490	GGC	2	6	12267	12272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404784
130	NC_007490	GAC	2	6	12285	12290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404784
131	NC_007490	CAT	2	6	12305	12310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404784
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135	NC_007490	GAC	2	6	12919	12924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404786
136	NC_007490	CGA	2	6	12982	12987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404786
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148	NC_007490	CAT	2	6	14164	14169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404787
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