MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	GCCGGT	2	12	509	520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007489	CCGTCC	2	12	1933	1944	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007489	ATCCCC	2	12	3748	3759	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	77404695
4	NC_007489	GCCAGC	2	12	4214	4225	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404695
5	NC_007489	GGCTCG	2	12	5634	5645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404696
6	NC_007489	GCCATC	2	12	6636	6647	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404697
7	NC_007489	GGCCGC	2	12	9312	9323	0 %	0 %	50 %	50 %	77404699
8	NC_007489	GCCCAC	2	12	10798	10809	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77404701
9	NC_007489	TCGATG	2	12	13241	13252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404703
10	NC_007489	GCCCCT	2	12	14388	14399	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007489	GCACCG	2	12	15281	15292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404705
12	NC_007489	TCACCG	2	12	15308	15319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404705
13	NC_007489	AACGAC	2	12	17475	17486	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	77404706
14	NC_007489	GCGACG	2	12	18093	18104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404707
15	NC_007489	GTGCCG	2	12	18607	18618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404708
16	NC_007489	CCAGCT	2	12	24456	24467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404715
17	NC_007489	CTCGGT	2	12	33713	33724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404724
18	NC_007489	GCTGGC	2	12	34184	34195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404724
19	NC_007489	CCTTGC	2	12	34877	34888	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77404724
20	NC_007489	CCTCGC	2	12	37754	37765	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007489	ATCCGG	2	12	38831	38842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404727
22	NC_007489	GCAGCG	2	12	40680	40691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404728
23	NC_007489	AGGCCG	2	12	40916	40927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404728
24	NC_007489	GTAGCG	2	12	42825	42836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404730
25	NC_007489	CCGGCC	2	12	43175	43186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404730
26	NC_007489	TCGCAT	2	12	47795	47806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007489	GAAGCC	2	12	49939	49950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007489	CATGGC	2	12	53283	53294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007489	GCCGCA	2	12	55716	55727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007489	GGACGG	2	12	56925	56936	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007489	GCGGCC	2	12	58286	58297	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
32	NC_007489	GCCTCG	2	12	58625	58636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404740
33	NC_007489	TCCAGC	2	12	59198	59209	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404740
34	NC_007489	GCCCGC	2	12	61612	61623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404743
35	NC_007489	GATCTG	2	12	78342	78353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404754
36	NC_007489	CTGCAG	2	12	78684	78695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404754
37	NC_007489	TGAACG	2	12	78733	78744	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77404754
38	NC_007489	TCCGCC	2	12	80352	80363	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	77404757
39	NC_007489	ACCTGC	2	12	81918	81929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404759
40	NC_007489	GTAGAT	2	12	84703	84714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404762
41	NC_007489	GCCGAC	2	12	85069	85080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404763
42	NC_007489	TGGCCG	2	12	85470	85481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404763
43	NC_007489	GAGAAG	2	12	87755	87766	50 %	0 %	50 %	0 %	77404764
44	NC_007489	TCGGGC	2	12	94512	94523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007489	CAAAGG	2	12	94586	94597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007489	CGGGAT	2	12	97525	97536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007489	CTATGC	2	12	99595	99606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404769
48	NC_007489	ACCCGA	2	12	100906	100917	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007489	AAGATG	2	12	102108	102119	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	77404771
50	NC_007489	GGTCAG	2	12	103313	103324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404773
51	NC_007489	CCGGCC	2	12	105251	105262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.