MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	ATCCCC	2	12	3748	3759	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	77404695
2	NC_007489	GCCAGC	2	12	4214	4225	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404695
3	NC_007489	GGCTCG	2	12	5634	5645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404696
4	NC_007489	GCCATC	2	12	6636	6647	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404697
5	NC_007489	GGCCGC	2	12	9312	9323	0 %	0 %	50 %	50 %	77404699
6	NC_007489	GCCCAC	2	12	10798	10809	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77404701
7	NC_007489	TCGATG	2	12	13241	13252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404703
8	NC_007489	GCACCG	2	12	15281	15292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404705
9	NC_007489	TCACCG	2	12	15308	15319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404705
10	NC_007489	AACGAC	2	12	17475	17486	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	77404706
11	NC_007489	GCGACG	2	12	18093	18104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404707
12	NC_007489	GTGCCG	2	12	18607	18618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404708
13	NC_007489	CCAGCT	2	12	24456	24467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404715
14	NC_007489	CTCGGT	2	12	33713	33724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404724
15	NC_007489	GCTGGC	2	12	34184	34195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404724
16	NC_007489	CCTTGC	2	12	34877	34888	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77404724
17	NC_007489	ATCCGG	2	12	38831	38842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404727
18	NC_007489	GCAGCG	2	12	40680	40691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404728
19	NC_007489	AGGCCG	2	12	40916	40927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404728
20	NC_007489	GTAGCG	2	12	42825	42836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404730
21	NC_007489	CCGGCC	2	12	43175	43186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404730
22	NC_007489	GCGGCC	2	12	58286	58297	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
23	NC_007489	GCCTCG	2	12	58625	58636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404740
24	NC_007489	TCCAGC	2	12	59198	59209	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404740
25	NC_007489	GCCCGC	2	12	61612	61623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404743
26	NC_007489	GATCTG	2	12	78342	78353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404754
27	NC_007489	CTGCAG	2	12	78684	78695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404754
28	NC_007489	TGAACG	2	12	78733	78744	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77404754
29	NC_007489	TCCGCC	2	12	80352	80363	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	77404757
30	NC_007489	ACCTGC	2	12	81918	81929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404759
31	NC_007489	GTAGAT	2	12	84703	84714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404762
32	NC_007489	GCCGAC	2	12	85069	85080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404763
33	NC_007489	TGGCCG	2	12	85470	85481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404763
34	NC_007489	GAGAAG	2	12	87755	87766	50 %	0 %	50 %	0 %	77404764
35	NC_007489	CTATGC	2	12	99595	99606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404769
36	NC_007489	AAGATG	2	12	102108	102119	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	77404771
37	NC_007489	GGTCAG	2	12	103313	103324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404773

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.