MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	CCGTC	2	10	73	82	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_007489	TGCCG	2	10	826	835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007489	CCCAT	2	10	1414	1423	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_007489	CCGGG	2	10	9434	9443	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007489	AGCCG	2	10	10507	10516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007489	CGATC	2	10	11255	11264	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007489	GGTGC	2	10	18333	18342	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007489	CCGGC	2	10	18886	18895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_007489	AGCCG	2	10	22959	22968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007489	GGCAG	2	10	31379	31388	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007489	TCGCC	2	10	37637	37646	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_007489	AGGTC	2	10	39562	39571	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007489	CTCCG	2	10	39744	39753	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_007489	AGCCA	2	10	41789	41798	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007489	GCTTT	2	10	42693	42702	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007489	ACCGC	2	10	57263	57272	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_007489	GCAAC	2	10	57327	57336	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007489	TCCTC	2	10	59631	59640	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007489	GCCGC	2	10	59717	59726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007489	CACGG	2	10	66953	66962	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007489	ACCTC	2	10	67333	67342	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_007489	CACGC	2	10	68026	68035	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_007489	TTGGA	2	10	90875	90884	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007489	GCGAC	2	10	98288	98297	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007489	CATGC	2	10	100687	100696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007489	TTTGC	2	10	101392	101401	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007489	GATGC	2	10	103572	103581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.