MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	GCCG	2	8	163	170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007489	CGTC	2	8	333	340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007489	CCGG	2	8	524	531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007489	CGCT	2	8	1398	1405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007489	TTCT	2	8	1801	1808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007489	CTGC	2	8	5931	5938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007489	CCCG	2	8	5988	5995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_007489	GCGG	2	8	7676	7683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007489	CCTG	2	8	8573	8580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007489	CGGC	2	8	8706	8713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007489	CCGA	2	8	8851	8858	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007489	AGGC	2	8	8874	8881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007489	CGAC	2	8	9600	9607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007489	AGGC	2	8	9637	9644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007489	TCTT	2	8	10584	10591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007489	CAGG	2	8	11468	11475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007489	CTGC	2	8	13608	13615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007489	CTTC	2	8	14424	14431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007489	GAAA	2	8	14864	14871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007489	GTCG	2	8	18849	18856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007489	CAGG	2	8	18899	18906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007489	GGCC	2	8	19150	19157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007489	GGCA	2	8	23167	23174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007489	CCGG	2	8	23178	23185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007489	TCGA	2	8	25978	25985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007489	ACGC	2	8	28716	28723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007489	CGCC	2	8	29607	29614	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_007489	GCCG	2	8	35454	35461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007489	AGGG	2	8	35649	35656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007489	GCCT	2	8	37618	37625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007489	TCAT	2	8	39848	39855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007489	CGGT	2	8	41731	41738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007489	AGGC	2	8	41851	41858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007489	CCGA	2	8	42572	42579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007489	CCCG	2	8	46626	46633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_007489	CCGC	2	8	47231	47238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_007489	GGAC	2	8	47537	47544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007489	GCCC	2	8	47610	47617	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_007489	GCAC	2	8	49234	49241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007489	ATGC	2	8	49630	49637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007489	AGCG	2	8	56020	56027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007489	CGAC	2	8	56344	56351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007489	GATC	2	8	56629	56636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007489	GCCC	2	8	56807	56814	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_007489	ACTC	2	8	57406	57413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007489	CGGG	2	8	59742	59749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007489	TCCG	2	8	61070	61077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007489	CGCC	2	8	61145	61152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_007489	GCTC	2	8	61214	61221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007489	ACCA	2	8	63895	63902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007489	CTCG	2	8	67628	67635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007489	CGAC	2	8	68589	68596	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007489	TGGG	2	8	69737	69744	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007489	CGAG	2	8	69939	69946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007489	ACGG	2	8	70045	70052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007489	GCCC	2	8	71149	71156	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_007489	CGGT	2	8	73782	73789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007489	CCGG	2	8	73805	73812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007489	GGGT	2	8	74157	74164	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007489	TGAC	2	8	75162	75169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007489	GCTG	2	8	75232	75239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007489	AACT	2	8	75289	75296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007489	TCGG	2	8	75433	75440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007489	CATC	2	8	75454	75461	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007489	CAAT	2	8	75551	75558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007489	CGGC	2	8	84439	84446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007489	GATG	2	8	86744	86751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007489	AAGA	2	8	87915	87922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007489	TTCA	2	8	88017	88024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007489	CGAT	2	8	91245	91252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007489	TTTC	2	8	91446	91453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007489	CCGG	2	8	91799	91806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007489	AGGA	2	8	92248	92255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007489	GGAT	2	8	93460	93467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007489	TGAT	2	8	95150	95157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007489	TCCA	2	8	95270	95277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007489	GGGA	2	8	95336	95343	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007489	CCAG	2	8	96769	96776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007489	CCAG	2	8	97919	97926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007489	TCCC	2	8	97941	97948	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_007489	GCTC	2	8	98535	98542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007489	TGAA	2	8	104305	104312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007489	AGCA	2	8	104348	104355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007489	CAAG	2	8	104542	104549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007489	ACGA	2	8	104641	104648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007489	CCCG	2	8	105166	105173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.