MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	CAGA	2	8	2542	2549	50 %	0 %	25 %	25 %	77404694
2	NC_007489	AAGG	2	8	2659	2666	50 %	0 %	50 %	0 %	77404694
3	NC_007489	TCCG	2	8	3198	3205	0 %	25 %	25 %	50 %	77404695
4	NC_007489	CGCA	2	8	3217	3224	25 %	0 %	25 %	50 %	77404695
5	NC_007489	GCCG	2	8	3406	3413	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
6	NC_007489	GTCG	2	8	3760	3767	0 %	25 %	50 %	25 %	77404695
7	NC_007489	GACT	2	8	3930	3937	25 %	25 %	25 %	25 %	77404695
8	NC_007489	GGGC	2	8	4302	4309	0 %	0 %	75 %	25 %	77404695
9	NC_007489	ATCG	2	8	4643	4650	25 %	25 %	25 %	25 %	77404696
10	NC_007489	TGGA	2	8	4727	4734	25 %	25 %	50 %	0 %	77404696
11	NC_007489	CGCA	2	8	4970	4977	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
12	NC_007489	CGAC	2	8	5104	5111	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
13	NC_007489	TCGA	2	8	5142	5149	25 %	25 %	25 %	25 %	77404696
14	NC_007489	AAAG	2	8	5314	5321	75 %	0 %	25 %	0 %	77404696
15	NC_007489	CCAG	2	8	5419	5426	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
16	NC_007489	GCCG	2	8	5582	5589	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
17	NC_007489	CCGA	2	8	5732	5739	25 %	0 %	25 %	50 %	77404696
18	NC_007489	TGCT	2	8	6688	6695	0 %	50 %	25 %	25 %	77404697
19	NC_007489	CGAC	2	8	6735	6742	25 %	0 %	25 %	50 %	77404697
20	NC_007489	GCAG	2	8	6886	6893	25 %	0 %	50 %	25 %	77404697
21	NC_007489	TTCG	2	8	6960	6967	0 %	50 %	25 %	25 %	77404697
22	NC_007489	GCAA	2	8	8274	8281	50 %	0 %	25 %	25 %	77404698
23	NC_007489	AGGA	2	8	9165	9172	50 %	0 %	50 %	0 %	77404699
24	NC_007489	GGCG	2	8	9735	9742	0 %	0 %	75 %	25 %	77404700
25	NC_007489	GCCT	2	8	10829	10836	0 %	25 %	25 %	50 %	77404701
26	NC_007489	CGGC	2	8	11052	11059	0 %	0 %	50 %	50 %	77404701
27	NC_007489	CGTG	2	8	11608	11615	0 %	25 %	50 %	25 %	77404702
28	NC_007489	ATGT	2	8	11789	11796	25 %	50 %	25 %	0 %	77404702
29	NC_007489	TGGA	2	8	12178	12185	25 %	25 %	50 %	0 %	77404703
30	NC_007489	TCGT	2	8	12238	12245	0 %	50 %	25 %	25 %	77404703
31	NC_007489	GCCT	2	8	12631	12638	0 %	25 %	25 %	50 %	77404703
32	NC_007489	GCAC	2	8	12821	12828	25 %	0 %	25 %	50 %	77404703
33	NC_007489	CGGA	2	8	13128	13135	25 %	0 %	50 %	25 %	77404703
34	NC_007489	GCGG	2	8	14045	14052	0 %	0 %	75 %	25 %	77404704
35	NC_007489	GCTG	2	8	15189	15196	0 %	25 %	50 %	25 %	77404705
36	NC_007489	GTCC	2	8	16061	16068	0 %	25 %	25 %	50 %	77404706
37	NC_007489	CCGT	2	8	16266	16273	0 %	25 %	25 %	50 %	77404706
38	NC_007489	GGGC	2	8	16529	16536	0 %	0 %	75 %	25 %	77404706
39	NC_007489	CCTC	2	8	16579	16586	0 %	25 %	0 %	75 %	77404706
40	NC_007489	CGCC	2	8	16712	16719	0 %	0 %	25 %	75 %	77404706
41	NC_007489	GCCC	2	8	17447	17454	0 %	0 %	25 %	75 %	77404706
42	NC_007489	CGGA	2	8	18433	18440	25 %	0 %	50 %	25 %	77404708
43	NC_007489	CCCG	2	8	19605	19612	0 %	0 %	25 %	75 %	77404709
44	NC_007489	GCTG	2	8	19729	19736	0 %	25 %	50 %	25 %	77404709
45	NC_007489	ACAG	2	8	19902	19909	50 %	0 %	25 %	25 %	77404709
46	NC_007489	CCGA	2	8	19912	19919	25 %	0 %	25 %	50 %	77404709
47	NC_007489	GCCG	2	8	20766	20773	0 %	0 %	50 %	50 %	77404710
48	NC_007489	CTGC	2	8	21193	21200	0 %	25 %	25 %	50 %	77404711
49	NC_007489	ATCG	2	8	21822	21829	25 %	25 %	25 %	25 %	77404711
50	NC_007489	CGAG	2	8	21985	21992	25 %	0 %	50 %	25 %	77404712
51	NC_007489	CCGG	2	8	22664	22671	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
52	NC_007489	TGGA	2	8	22674	22681	25 %	25 %	50 %	0 %	77404712
53	NC_007489	ATGG	2	8	23637	23644	25 %	25 %	50 %	0 %	77404714
54	NC_007489	CGCC	2	8	23875	23882	0 %	0 %	25 %	75 %	77404714
55	NC_007489	GCTG	2	8	26125	26132	0 %	25 %	50 %	25 %	77404716
56	NC_007489	CCCG	2	8	26863	26870	0 %	0 %	25 %	75 %	77404717
57	NC_007489	ACTG	2	8	26984	26991	25 %	25 %	25 %	25 %	77404717
58	NC_007489	GATC	2	8	27227	27234	25 %	25 %	25 %	25 %	77404717
59	NC_007489	AGCC	2	8	27238	27245	25 %	0 %	25 %	50 %	77404717
60	NC_007489	CCCG	2	8	27557	27564	0 %	0 %	25 %	75 %	77404717
61	NC_007489	GCTG	2	8	27619	27626	0 %	25 %	50 %	25 %	77404718
62	NC_007489	GATG	2	8	27892	27899	25 %	25 %	50 %	0 %	77404718
63	NC_007489	CCGG	2	8	28203	28210	0 %	0 %	50 %	50 %	77404718
64	NC_007489	GGTC	2	8	28303	28310	0 %	25 %	50 %	25 %	77404718
65	NC_007489	GCCC	2	8	29376	29383	0 %	0 %	25 %	75 %	77404719
66	NC_007489	CATC	2	8	29848	29855	25 %	25 %	0 %	50 %	77404720
67	NC_007489	CGGC	2	8	30024	30031	0 %	0 %	50 %	50 %	77404720
68	NC_007489	GGAT	2	8	30084	30091	25 %	25 %	50 %	0 %	77404720
69	NC_007489	CTCC	2	8	30466	30473	0 %	25 %	0 %	75 %	77404721
70	NC_007489	GGCC	2	8	31047	31054	0 %	0 %	50 %	50 %	77404721
71	NC_007489	GCCC	2	8	31137	31144	0 %	0 %	25 %	75 %	77404721
72	NC_007489	GCAG	2	8	32121	32128	25 %	0 %	50 %	25 %	77404723
73	NC_007489	GCCT	2	8	32790	32797	0 %	25 %	25 %	50 %	77404724
74	NC_007489	ACGG	2	8	33121	33128	25 %	0 %	50 %	25 %	77404724
75	NC_007489	TCGA	2	8	33135	33142	25 %	25 %	25 %	25 %	77404724
76	NC_007489	GTCC	2	8	33263	33270	0 %	25 %	25 %	50 %	77404724
77	NC_007489	TCCT	2	8	34251	34258	0 %	50 %	0 %	50 %	77404724
78	NC_007489	GTCG	2	8	34550	34557	0 %	25 %	50 %	25 %	77404724
79	NC_007489	CCGA	2	8	34896	34903	25 %	0 %	25 %	50 %	77404724
80	NC_007489	GCCC	3	12	34917	34928	0 %	0 %	25 %	75 %	77404724
81	NC_007489	CATC	2	8	36197	36204	25 %	25 %	0 %	50 %	77404725
82	NC_007489	GCAG	2	8	36431	36438	25 %	0 %	50 %	25 %	77404725
83	NC_007489	CCGC	2	8	36731	36738	0 %	0 %	25 %	75 %	77404725
84	NC_007489	CTGC	2	8	37514	37521	0 %	25 %	25 %	50 %	77404725
85	NC_007489	GAAG	2	8	38062	38069	50 %	0 %	50 %	0 %	77404726
86	NC_007489	CGGC	2	8	38070	38077	0 %	0 %	50 %	50 %	77404726
87	NC_007489	CGTC	2	8	38982	38989	0 %	25 %	25 %	50 %	77404727
88	NC_007489	CAGC	2	8	40407	40414	25 %	0 %	25 %	50 %	77404728
89	NC_007489	GAAG	2	8	40473	40480	50 %	0 %	50 %	0 %	77404728
90	NC_007489	GCTC	2	8	40710	40717	0 %	25 %	25 %	50 %	77404728
91	NC_007489	CTGC	2	8	41941	41948	0 %	25 %	25 %	50 %	77404729
92	NC_007489	GCGG	2	8	42806	42813	0 %	0 %	75 %	25 %	77404730
93	NC_007489	GACG	2	8	42974	42981	25 %	0 %	50 %	25 %	77404730
94	NC_007489	AGCC	2	8	43161	43168	25 %	0 %	25 %	50 %	77404730
95	NC_007489	CGCC	2	8	43211	43218	0 %	0 %	25 %	75 %	77404730
96	NC_007489	GGCC	2	8	43313	43320	0 %	0 %	50 %	50 %	77404730
97	NC_007489	GCCC	2	8	43615	43622	0 %	0 %	25 %	75 %	77404730
98	NC_007489	TTGC	2	8	44277	44284	0 %	50 %	25 %	25 %	77404730
99	NC_007489	GCCA	2	8	44848	44855	25 %	0 %	25 %	50 %	77404730
100	NC_007489	GTCC	2	8	45135	45142	0 %	25 %	25 %	50 %	77404731
101	NC_007489	CGAG	2	8	45256	45263	25 %	0 %	50 %	25 %	77404731
102	NC_007489	CGAG	2	8	45733	45740	25 %	0 %	50 %	25 %	77404732
103	NC_007489	CGGC	2	8	46345	46352	0 %	0 %	50 %	50 %	77404732
104	NC_007489	TCGT	2	8	48320	48327	0 %	50 %	25 %	25 %	77404733
105	NC_007489	TCCA	2	8	50199	50206	25 %	25 %	0 %	50 %	77404734
106	NC_007489	GCGA	2	8	50949	50956	25 %	0 %	50 %	25 %	77404734
107	NC_007489	GTGA	2	8	51064	51071	25 %	25 %	50 %	0 %	77404734
108	NC_007489	ATAG	2	8	51803	51810	50 %	25 %	25 %	0 %	77404735
109	NC_007489	AATA	2	8	52011	52018	75 %	25 %	0 %	0 %	77404735
110	NC_007489	ACAA	2	8	52054	52061	75 %	0 %	0 %	25 %	77404735
111	NC_007489	TAAA	2	8	52385	52392	75 %	25 %	0 %	0 %	77404735
112	NC_007489	TCTG	2	8	52470	52477	0 %	50 %	25 %	25 %	77404735
113	NC_007489	TTTA	2	8	53125	53132	25 %	75 %	0 %	0 %	77404736
114	NC_007489	ACGC	2	8	53379	53386	25 %	0 %	25 %	50 %	77404737
115	NC_007489	GAAC	2	8	53788	53795	50 %	0 %	25 %	25 %	77404737
116	NC_007489	CGGA	2	8	53964	53971	25 %	0 %	50 %	25 %	77404737
117	NC_007489	AGAT	2	8	54709	54716	50 %	25 %	25 %	0 %	77404738
118	NC_007489	TCCA	2	8	55154	55161	25 %	25 %	0 %	50 %	77404738
119	NC_007489	GGCC	2	8	57564	57571	0 %	0 %	50 %	50 %	77404739
120	NC_007489	TTCG	2	8	57792	57799	0 %	50 %	25 %	25 %	77404739
121	NC_007489	GTTC	2	8	57995	58002	0 %	50 %	25 %	25 %	77404740
122	NC_007489	CTGA	2	8	58039	58046	25 %	25 %	25 %	25 %	77404740
123	NC_007489	CTGG	2	8	58314	58321	0 %	25 %	50 %	25 %	77404740
124	NC_007489	GGCC	2	8	59067	59074	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
125	NC_007489	CTCC	2	8	59212	59219	0 %	25 %	0 %	75 %	77404740
126	NC_007489	CGGG	2	8	59379	59386	0 %	0 %	75 %	25 %	77404740
127	NC_007489	GCCC	2	8	59960	59967	0 %	0 %	25 %	75 %	77404741
128	NC_007489	CGAC	2	8	60207	60214	25 %	0 %	25 %	50 %	77404741
129	NC_007489	CGGC	2	8	60432	60439	0 %	0 %	50 %	50 %	77404741
130	NC_007489	GAAC	2	8	60607	60614	50 %	0 %	25 %	25 %	77404742
131	NC_007489	GGCT	2	8	60947	60954	0 %	25 %	50 %	25 %	77404742
132	NC_007489	CCTG	2	8	61362	61369	0 %	25 %	25 %	50 %	77404743
133	NC_007489	CGAT	2	8	61442	61449	25 %	25 %	25 %	25 %	77404743
134	NC_007489	AGCG	2	8	61650	61657	25 %	0 %	50 %	25 %	77404743
135	NC_007489	GCCG	2	8	61689	61696	0 %	0 %	50 %	50 %	77404743
136	NC_007489	CCAT	2	8	62025	62032	25 %	25 %	0 %	50 %	77404744
137	NC_007489	CCGG	2	8	62149	62156	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
138	NC_007489	CGGC	2	8	62596	62603	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
139	NC_007489	CACC	2	8	62761	62768	25 %	0 %	0 %	75 %	77404744
140	NC_007489	CCGG	2	8	62945	62952	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
141	NC_007489	CGGG	2	8	63234	63241	0 %	0 %	75 %	25 %	77404744
142	NC_007489	TCGA	2	8	63366	63373	25 %	25 %	25 %	25 %	77404744
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.