MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	CG	3	6	181	186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007489	CG	3	6	379	384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007489	CG	3	6	765	770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007489	TG	3	6	2285	2290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007489	TC	3	6	2520	2525	0 %	50 %	0 %	50 %	77404694
6	NC_007489	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	77404695
7	NC_007489	GC	3	6	3815	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
8	NC_007489	CG	5	10	4189	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
9	NC_007489	CG	3	6	4587	4592	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
10	NC_007489	GC	3	6	4717	4722	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
11	NC_007489	CG	3	6	4827	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
12	NC_007489	GC	4	8	4873	4880	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
13	NC_007489	CG	3	6	5441	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
14	NC_007489	CG	3	6	5480	5485	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
15	NC_007489	GA	3	6	6120	6125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007489	GC	3	6	6141	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007489	CG	3	6	6304	6309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007489	GC	3	6	7001	7006	0 %	0 %	50 %	50 %	77404697
19	NC_007489	GC	3	6	7083	7088	0 %	0 %	50 %	50 %	77404697
20	NC_007489	GC	3	6	8284	8289	0 %	0 %	50 %	50 %	77404698
21	NC_007489	GA	3	6	8563	8568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007489	CG	3	6	8593	8598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007489	CA	3	6	8638	8643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007489	AG	3	6	9037	9042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007489	CT	3	6	9697	9702	0 %	50 %	0 %	50 %	77404700
26	NC_007489	GA	3	6	10060	10065	50 %	0 %	50 %	0 %	77404700
27	NC_007489	GC	3	6	10962	10967	0 %	0 %	50 %	50 %	77404701
28	NC_007489	GC	3	6	12155	12160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007489	GA	3	6	12189	12194	50 %	0 %	50 %	0 %	77404703
30	NC_007489	GC	4	8	13220	13227	0 %	0 %	50 %	50 %	77404703
31	NC_007489	GC	3	6	13399	13404	0 %	0 %	50 %	50 %	77404703
32	NC_007489	CT	3	6	13669	13674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007489	GA	3	6	14172	14177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007489	CG	4	8	14984	14991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007489	CG	3	6	15670	15675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007489	CG	3	6	15680	15685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007489	CA	3	6	16043	16048	50 %	0 %	0 %	50 %	77404706
38	NC_007489	CG	5	10	16679	16688	0 %	0 %	50 %	50 %	77404706
39	NC_007489	GC	3	6	17364	17369	0 %	0 %	50 %	50 %	77404706
40	NC_007489	AG	3	6	18176	18181	50 %	0 %	50 %	0 %	77404707
41	NC_007489	GC	3	6	19074	19079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007489	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007489	GC	3	6	19976	19981	0 %	0 %	50 %	50 %	77404709
44	NC_007489	TC	3	6	20576	20581	0 %	50 %	0 %	50 %	77404710
45	NC_007489	GC	3	6	22327	22332	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
46	NC_007489	GC	3	6	22442	22447	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
47	NC_007489	CG	3	6	22567	22572	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
48	NC_007489	GC	3	6	22978	22983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007489	CG	3	6	23000	23005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007489	GC	3	6	23564	23569	0 %	0 %	50 %	50 %	77404713
51	NC_007489	GC	3	6	24749	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	77404715
52	NC_007489	CT	3	6	24892	24897	0 %	50 %	0 %	50 %	77404715
53	NC_007489	GC	3	6	25061	25066	0 %	0 %	50 %	50 %	77404715
54	NC_007489	GC	3	6	25195	25200	0 %	0 %	50 %	50 %	77404715
55	NC_007489	GA	3	6	26542	26547	50 %	0 %	50 %	0 %	77404717
56	NC_007489	AG	3	6	26714	26719	50 %	0 %	50 %	0 %	77404717
57	NC_007489	GC	3	6	27109	27114	0 %	0 %	50 %	50 %	77404717
58	NC_007489	CG	3	6	27654	27659	0 %	0 %	50 %	50 %	77404718
59	NC_007489	GC	3	6	28688	28693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007489	GC	3	6	29385	29390	0 %	0 %	50 %	50 %	77404719
61	NC_007489	AT	3	6	29567	29572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007489	CT	3	6	29683	29688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007489	TC	3	6	30311	30316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007489	GA	3	6	31082	31087	50 %	0 %	50 %	0 %	77404721
65	NC_007489	GC	3	6	31288	31293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007489	GC	3	6	31351	31356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007489	TA	3	6	31580	31585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007489	TA	3	6	31593	31598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007489	GC	3	6	32050	32055	0 %	0 %	50 %	50 %	77404723
70	NC_007489	CG	3	6	32169	32174	0 %	0 %	50 %	50 %	77404723
71	NC_007489	CG	3	6	32736	32741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007489	GC	3	6	32856	32861	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
73	NC_007489	GC	3	6	32886	32891	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
74	NC_007489	CG	3	6	32893	32898	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
75	NC_007489	GC	3	6	33222	33227	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
76	NC_007489	CG	3	6	33479	33484	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
77	NC_007489	CG	3	6	33873	33878	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
78	NC_007489	GC	3	6	34090	34095	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
79	NC_007489	GC	3	6	34598	34603	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
80	NC_007489	CG	3	6	34933	34938	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
81	NC_007489	GC	3	6	35485	35490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007489	CG	3	6	35789	35794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007489	TG	3	6	36087	36092	0 %	50 %	50 %	0 %	77404725
84	NC_007489	GC	3	6	36557	36562	0 %	0 %	50 %	50 %	77404725
85	NC_007489	GC	3	6	37096	37101	0 %	0 %	50 %	50 %	77404725
86	NC_007489	GC	3	6	38107	38112	0 %	0 %	50 %	50 %	77404726
87	NC_007489	CG	3	6	38966	38971	0 %	0 %	50 %	50 %	77404727
88	NC_007489	CG	3	6	39174	39179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007489	CA	3	6	39409	39414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007489	AG	3	6	40085	40090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007489	GT	3	6	41680	41685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007489	GC	3	6	41827	41832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007489	GA	3	6	42428	42433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007489	GA	4	8	42720	42727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007489	GA	3	6	42739	42744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007489	CT	3	6	42788	42793	0 %	50 %	0 %	50 %	77404730
97	NC_007489	GC	3	6	44739	44744	0 %	0 %	50 %	50 %	77404730
98	NC_007489	TC	3	6	44979	44984	0 %	50 %	0 %	50 %	77404730
99	NC_007489	GC	3	6	46508	46513	0 %	0 %	50 %	50 %	77404732
100	NC_007489	AG	3	6	47270	47275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007489	GC	3	6	47754	47759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007489	GC	3	6	47872	47877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007489	GC	3	6	49008	49013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007489	GC	3	6	49537	49542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007489	CG	3	6	49701	49706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007489	GC	3	6	49998	50003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007489	TG	3	6	50537	50542	0 %	50 %	50 %	0 %	77404734
108	NC_007489	GC	3	6	50585	50590	0 %	0 %	50 %	50 %	77404734
109	NC_007489	TG	3	6	53486	53491	0 %	50 %	50 %	0 %	77404737
110	NC_007489	AC	3	6	53815	53820	50 %	0 %	0 %	50 %	77404737
111	NC_007489	TG	3	6	54440	54445	0 %	50 %	50 %	0 %	77404737
112	NC_007489	TA	3	6	54865	54870	50 %	50 %	0 %	0 %	77404738
113	NC_007489	TG	3	6	54879	54884	0 %	50 %	50 %	0 %	77404738
114	NC_007489	AG	5	10	55035	55044	50 %	0 %	50 %	0 %	77404738
115	NC_007489	CG	3	6	56377	56382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007489	GA	3	6	57675	57680	50 %	0 %	50 %	0 %	77404739
117	NC_007489	CG	3	6	57828	57833	0 %	0 %	50 %	50 %	77404739
118	NC_007489	GC	3	6	58116	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
119	NC_007489	CG	3	6	58180	58185	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
120	NC_007489	CG	3	6	59112	59117	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
121	NC_007489	GC	3	6	59663	59668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007489	GC	3	6	59801	59806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007489	CG	4	8	60342	60349	0 %	0 %	50 %	50 %	77404741
124	NC_007489	CG	3	6	60497	60502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007489	CG	4	8	61045	61052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007489	AC	4	8	61468	61475	50 %	0 %	0 %	50 %	77404743
127	NC_007489	GC	3	6	61592	61597	0 %	0 %	50 %	50 %	77404743
128	NC_007489	CG	3	6	61846	61851	0 %	0 %	50 %	50 %	77404743
129	NC_007489	CG	3	6	61942	61947	0 %	0 %	50 %	50 %	77404743
130	NC_007489	CG	3	6	62112	62117	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
131	NC_007489	CG	3	6	62174	62179	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
132	NC_007489	CG	3	6	62812	62817	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
133	NC_007489	CG	4	8	63057	63064	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
134	NC_007489	CG	3	6	63224	63229	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
135	NC_007489	CG	3	6	63260	63265	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
136	NC_007489	CG	3	6	63329	63334	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
137	NC_007489	GA	3	6	63423	63428	50 %	0 %	50 %	0 %	77404744
138	NC_007489	GC	3	6	64021	64026	0 %	0 %	50 %	50 %	77404745
139	NC_007489	CG	3	6	64571	64576	0 %	0 %	50 %	50 %	77404745
140	NC_007489	CG	3	6	66122	66127	0 %	0 %	50 %	50 %	77404747
141	NC_007489	CG	3	6	66463	66468	0 %	0 %	50 %	50 %	77404747
142	NC_007489	CG	3	6	66601	66606	0 %	0 %	50 %	50 %	77404747
143	NC_007489	GA	3	6	66614	66619	50 %	0 %	50 %	0 %	77404747
144	NC_007489	GA	3	6	67124	67129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007489	CT	3	6	67242	67247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007489	GC	3	6	67590	67595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007489	AC	3	6	67703	67708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007489	GC	3	6	67771	67776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007489	GC	3	6	68080	68085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007489	GC	3	6	68600	68605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007489	CG	3	6	68992	68997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.