MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid C

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007489	TC	3	6	2520	2525	0 %	50 %	0 %	50 %	77404694
2	NC_007489	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	77404695
3	NC_007489	GC	3	6	3815	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
4	NC_007489	CG	5	10	4189	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	77404695
5	NC_007489	CG	3	6	4587	4592	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
6	NC_007489	GC	3	6	4717	4722	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
7	NC_007489	CG	3	6	4827	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
8	NC_007489	GC	4	8	4873	4880	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
9	NC_007489	CG	3	6	5441	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
10	NC_007489	CG	3	6	5480	5485	0 %	0 %	50 %	50 %	77404696
11	NC_007489	GC	3	6	7001	7006	0 %	0 %	50 %	50 %	77404697
12	NC_007489	GC	3	6	7083	7088	0 %	0 %	50 %	50 %	77404697
13	NC_007489	GC	3	6	8284	8289	0 %	0 %	50 %	50 %	77404698
14	NC_007489	CT	3	6	9697	9702	0 %	50 %	0 %	50 %	77404700
15	NC_007489	GA	3	6	10060	10065	50 %	0 %	50 %	0 %	77404700
16	NC_007489	GC	3	6	10962	10967	0 %	0 %	50 %	50 %	77404701
17	NC_007489	GA	3	6	12189	12194	50 %	0 %	50 %	0 %	77404703
18	NC_007489	GC	4	8	13220	13227	0 %	0 %	50 %	50 %	77404703
19	NC_007489	GC	3	6	13399	13404	0 %	0 %	50 %	50 %	77404703
20	NC_007489	CA	3	6	16043	16048	50 %	0 %	0 %	50 %	77404706
21	NC_007489	CG	5	10	16679	16688	0 %	0 %	50 %	50 %	77404706
22	NC_007489	GC	3	6	17364	17369	0 %	0 %	50 %	50 %	77404706
23	NC_007489	AG	3	6	18176	18181	50 %	0 %	50 %	0 %	77404707
24	NC_007489	GC	3	6	19976	19981	0 %	0 %	50 %	50 %	77404709
25	NC_007489	TC	3	6	20576	20581	0 %	50 %	0 %	50 %	77404710
26	NC_007489	GC	3	6	22327	22332	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
27	NC_007489	GC	3	6	22442	22447	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
28	NC_007489	CG	3	6	22567	22572	0 %	0 %	50 %	50 %	77404712
29	NC_007489	GC	3	6	23564	23569	0 %	0 %	50 %	50 %	77404713
30	NC_007489	GC	3	6	24749	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	77404715
31	NC_007489	CT	3	6	24892	24897	0 %	50 %	0 %	50 %	77404715
32	NC_007489	GC	3	6	25061	25066	0 %	0 %	50 %	50 %	77404715
33	NC_007489	GC	3	6	25195	25200	0 %	0 %	50 %	50 %	77404715
34	NC_007489	GA	3	6	26542	26547	50 %	0 %	50 %	0 %	77404717
35	NC_007489	AG	3	6	26714	26719	50 %	0 %	50 %	0 %	77404717
36	NC_007489	GC	3	6	27109	27114	0 %	0 %	50 %	50 %	77404717
37	NC_007489	CG	3	6	27654	27659	0 %	0 %	50 %	50 %	77404718
38	NC_007489	GC	3	6	29385	29390	0 %	0 %	50 %	50 %	77404719
39	NC_007489	GA	3	6	31082	31087	50 %	0 %	50 %	0 %	77404721
40	NC_007489	GC	3	6	32050	32055	0 %	0 %	50 %	50 %	77404723
41	NC_007489	CG	3	6	32169	32174	0 %	0 %	50 %	50 %	77404723
42	NC_007489	GC	3	6	32856	32861	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
43	NC_007489	GC	3	6	32886	32891	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
44	NC_007489	CG	3	6	32893	32898	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
45	NC_007489	GC	3	6	33222	33227	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
46	NC_007489	CG	3	6	33479	33484	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
47	NC_007489	CG	3	6	33873	33878	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
48	NC_007489	GC	3	6	34090	34095	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
49	NC_007489	GC	3	6	34598	34603	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
50	NC_007489	CG	3	6	34933	34938	0 %	0 %	50 %	50 %	77404724
51	NC_007489	TG	3	6	36087	36092	0 %	50 %	50 %	0 %	77404725
52	NC_007489	GC	3	6	36557	36562	0 %	0 %	50 %	50 %	77404725
53	NC_007489	GC	3	6	37096	37101	0 %	0 %	50 %	50 %	77404725
54	NC_007489	GC	3	6	38107	38112	0 %	0 %	50 %	50 %	77404726
55	NC_007489	CG	3	6	38966	38971	0 %	0 %	50 %	50 %	77404727
56	NC_007489	CT	3	6	42788	42793	0 %	50 %	0 %	50 %	77404730
57	NC_007489	GC	3	6	44739	44744	0 %	0 %	50 %	50 %	77404730
58	NC_007489	TC	3	6	44979	44984	0 %	50 %	0 %	50 %	77404730
59	NC_007489	GC	3	6	46508	46513	0 %	0 %	50 %	50 %	77404732
60	NC_007489	TG	3	6	50537	50542	0 %	50 %	50 %	0 %	77404734
61	NC_007489	GC	3	6	50585	50590	0 %	0 %	50 %	50 %	77404734
62	NC_007489	TG	3	6	53486	53491	0 %	50 %	50 %	0 %	77404737
63	NC_007489	AC	3	6	53815	53820	50 %	0 %	0 %	50 %	77404737
64	NC_007489	TG	3	6	54440	54445	0 %	50 %	50 %	0 %	77404737
65	NC_007489	TA	3	6	54865	54870	50 %	50 %	0 %	0 %	77404738
66	NC_007489	TG	3	6	54879	54884	0 %	50 %	50 %	0 %	77404738
67	NC_007489	AG	5	10	55035	55044	50 %	0 %	50 %	0 %	77404738
68	NC_007489	GA	3	6	57675	57680	50 %	0 %	50 %	0 %	77404739
69	NC_007489	CG	3	6	57828	57833	0 %	0 %	50 %	50 %	77404739
70	NC_007489	GC	3	6	58116	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
71	NC_007489	CG	3	6	58180	58185	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
72	NC_007489	CG	3	6	59112	59117	0 %	0 %	50 %	50 %	77404740
73	NC_007489	CG	4	8	60342	60349	0 %	0 %	50 %	50 %	77404741
74	NC_007489	AC	4	8	61468	61475	50 %	0 %	0 %	50 %	77404743
75	NC_007489	GC	3	6	61592	61597	0 %	0 %	50 %	50 %	77404743
76	NC_007489	CG	3	6	61846	61851	0 %	0 %	50 %	50 %	77404743
77	NC_007489	CG	3	6	61942	61947	0 %	0 %	50 %	50 %	77404743
78	NC_007489	CG	3	6	62112	62117	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
79	NC_007489	CG	3	6	62174	62179	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
80	NC_007489	CG	3	6	62812	62817	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
81	NC_007489	CG	4	8	63057	63064	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
82	NC_007489	CG	3	6	63224	63229	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
83	NC_007489	CG	3	6	63260	63265	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
84	NC_007489	CG	3	6	63329	63334	0 %	0 %	50 %	50 %	77404744
85	NC_007489	GA	3	6	63423	63428	50 %	0 %	50 %	0 %	77404744
86	NC_007489	GC	3	6	64021	64026	0 %	0 %	50 %	50 %	77404745
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89	NC_007489	CG	3	6	66463	66468	0 %	0 %	50 %	50 %	77404747
90	NC_007489	CG	3	6	66601	66606	0 %	0 %	50 %	50 %	77404747
91	NC_007489	GA	3	6	66614	66619	50 %	0 %	50 %	0 %	77404747
92	NC_007489	GC	3	6	70450	70455	0 %	0 %	50 %	50 %	77404749
93	NC_007489	CG	3	6	70891	70896	0 %	0 %	50 %	50 %	77404749
94	NC_007489	GC	3	6	71719	71724	0 %	0 %	50 %	50 %	77404750
95	NC_007489	AC	3	6	71855	71860	50 %	0 %	0 %	50 %	77404750
96	NC_007489	CG	3	6	72166	72171	0 %	0 %	50 %	50 %	77404750
97	NC_007489	GA	3	6	72812	72817	50 %	0 %	50 %	0 %	77404751
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102	NC_007489	GC	3	6	74201	74206	0 %	0 %	50 %	50 %	77404752
103	NC_007489	GC	3	6	74429	74434	0 %	0 %	50 %	50 %	77404752
104	NC_007489	CG	3	6	74588	74593	0 %	0 %	50 %	50 %	77404752
105	NC_007489	GC	3	6	74627	74632	0 %	0 %	50 %	50 %	77404752
106	NC_007489	GC	3	6	74854	74859	0 %	0 %	50 %	50 %	77404752
107	NC_007489	CG	3	6	76529	76534	0 %	0 %	50 %	50 %	77404754
108	NC_007489	CG	5	10	77036	77045	0 %	0 %	50 %	50 %	77404754
109	NC_007489	CG	3	6	77815	77820	0 %	0 %	50 %	50 %	77404754
110	NC_007489	GC	4	8	77890	77897	0 %	0 %	50 %	50 %	77404754
111	NC_007489	CG	3	6	77951	77956	0 %	0 %	50 %	50 %	77404754
112	NC_007489	AG	3	6	78542	78547	50 %	0 %	50 %	0 %	77404754
113	NC_007489	CG	3	6	78675	78680	0 %	0 %	50 %	50 %	77404754
114	NC_007489	CG	3	6	79131	79136	0 %	0 %	50 %	50 %	77404754
115	NC_007489	CG	3	6	80079	80084	0 %	0 %	50 %	50 %	77404757
116	NC_007489	CG	3	6	80925	80930	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
117	NC_007489	CG	3	6	81274	81279	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
118	NC_007489	TC	3	6	81854	81859	0 %	50 %	0 %	50 %	77404759
119	NC_007489	CG	4	8	82000	82007	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
120	NC_007489	CG	3	6	82067	82072	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
121	NC_007489	GC	3	6	82415	82420	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
122	NC_007489	CG	3	6	82829	82834	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
123	NC_007489	GC	3	6	83009	83014	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
124	NC_007489	CG	3	6	83109	83114	0 %	0 %	50 %	50 %	77404759
125	NC_007489	GC	3	6	83947	83952	0 %	0 %	50 %	50 %	77404761
126	NC_007489	CG	3	6	83998	84003	0 %	0 %	50 %	50 %	77404761
127	NC_007489	CG	3	6	84188	84193	0 %	0 %	50 %	50 %	77404761
128	NC_007489	GC	3	6	84322	84327	0 %	0 %	50 %	50 %	77404761
129	NC_007489	CG	3	6	84625	84630	0 %	0 %	50 %	50 %	77404762
130	NC_007489	GC	3	6	85113	85118	0 %	0 %	50 %	50 %	77404763
131	NC_007489	CG	3	6	86027	86032	0 %	0 %	50 %	50 %	77404763
132	NC_007489	GC	3	6	87202	87207	0 %	0 %	50 %	50 %	77404764
133	NC_007489	GC	4	8	87257	87264	0 %	0 %	50 %	50 %	77404764
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141	NC_007489	GC	3	6	89588	89593	0 %	0 %	50 %	50 %	77404765
142	NC_007489	CG	3	6	89819	89824	0 %	0 %	50 %	50 %	77404765
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.