MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid B

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007488	CGCGCT	2	12	5303	5314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404596
2	NC_007488	CCCGCT	2	12	5925	5936	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	77404597
3	NC_007488	GCCAGC	2	12	7166	7177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404598
4	NC_007488	CCGGCT	2	12	8739	8750	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404599
5	NC_007488	CGATGC	2	12	12836	12847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404603
6	NC_007488	ATCCGC	2	12	15212	15223	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404605
7	NC_007488	CGGCAT	2	12	16285	16296	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404605
8	NC_007488	AGCGGC	2	12	18283	18294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404607
9	NC_007488	AGGAAC	2	12	18382	18393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77404607
10	NC_007488	CCGATC	2	12	18835	18846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404607
11	NC_007488	GCCCTC	2	12	20123	20134	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	552530713
12	NC_007488	TCGATC	2	12	20923	20934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404609
13	NC_007488	GGTTTC	2	12	22201	22212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77404610
14	NC_007488	TGGCGG	2	12	27101	27112	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	77404612
15	NC_007488	CTGGAT	2	12	28027	28038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404613
16	NC_007488	GCGCCC	2	12	29132	29143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404614
17	NC_007488	CCGCGA	2	12	29951	29962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404614
18	NC_007488	GCCCTG	2	12	30343	30354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	552530716
19	NC_007488	ACGCTG	2	12	30610	30621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	552530716
20	NC_007488	TCTCGA	2	12	32474	32485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404617
21	NC_007488	TGGATG	2	12	33841	33852	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77404619
22	NC_007488	CATCGC	2	12	38027	38038	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404621
23	NC_007488	GCCACC	2	12	39805	39816	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77404623
24	NC_007488	ATCTGC	2	12	42135	42146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404625
25	NC_007488	TCGCTC	2	12	42287	42298	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77404625
26	NC_007488	GGCCGG	2	12	42405	42416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404625
27	NC_007488	CGAAGC	2	12	44048	44059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404627
28	NC_007488	TCACCG	2	12	44965	44976	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404628
29	NC_007488	GCTGTC	2	12	49857	49868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404632
30	NC_007488	GGCGAC	2	12	50373	50384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404633
31	NC_007488	CGACGG	2	12	50579	50590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404633
32	NC_007488	GCCACC	2	12	51325	51336	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77404634
33	NC_007488	CGGCCG	2	12	51665	51676	0 %	0 %	50 %	50 %	77404634
34	NC_007488	CACCTC	2	12	52050	52061	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	77404634
35	NC_007488	GCTGGC	2	12	57471	57482	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	552530718
36	NC_007488	GGTGCC	2	12	61443	61454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404642
37	NC_007488	TCGCGG	2	12	61919	61930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404642
38	NC_007488	TGCGGC	2	12	65628	65639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404645
39	NC_007488	CGAGGC	2	12	67078	67089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404646
40	NC_007488	TGCTGA	2	12	69582	69593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404647
41	NC_007488	AGAGCG	2	12	69918	69929	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77404647
42	NC_007488	GCCGAT	2	12	69950	69961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404647
43	NC_007488	GAGGTC	2	12	70129	70140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404648
44	NC_007488	CCCAGG	2	12	73379	73390	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404652
45	NC_007488	TGACCG	2	12	73562	73573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404652
46	NC_007488	GGTCTC	2	12	73722	73733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404652
47	NC_007488	ACGGTG	2	12	75505	75516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404654
48	NC_007488	AAGCTG	2	12	75592	75603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77404654
49	NC_007488	ACCTCG	2	12	76496	76507	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77404655
50	NC_007488	TGCCTC	2	12	76713	76724	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77404655
51	NC_007488	CGCCAG	2	12	77573	77584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	552530722
52	NC_007488	CGCTGG	2	12	77989	78000	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	552530722
53	NC_007488	GGCCTC	2	12	78708	78719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	552530722
54	NC_007488	GAAGCC	2	12	81647	81658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404659
55	NC_007488	GCGCCT	2	12	82511	82522	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404660
56	NC_007488	GCAGAG	2	12	82548	82559	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77404660
57	NC_007488	CTGCAT	2	12	84661	84672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404663
58	NC_007488	TTCGAG	2	12	85021	85032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404663
59	NC_007488	GCCACC	2	12	86145	86156	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77404664
60	NC_007488	GACCGA	2	12	86528	86539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404664
61	NC_007488	TGGCGG	2	12	87947	87958	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	77404666
62	NC_007488	CTCGCG	2	12	89148	89159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404667
63	NC_007488	GCTCCT	2	12	89883	89894	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77404668
64	NC_007488	CGGGCC	2	12	93720	93731	0 %	0 %	50 %	50 %	552530724
65	NC_007488	GACGCG	2	12	99042	99053	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404677
66	NC_007488	GCCGAA	2	12	99515	99526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404678
67	NC_007488	GAGCCC	2	12	99644	99655	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404678
68	NC_007488	CGAGGC	2	12	100185	100196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404679
69	NC_007488	GCCTCG	2	12	101910	101921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404681
70	NC_007488	CCCGAA	2	12	102138	102149	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77404681
71	NC_007488	TGGCCG	2	12	103877	103888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404683
72	NC_007488	TCTCGA	2	12	105461	105472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404685
73	NC_007488	TGCGGA	2	12	105479	105490	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404685
74	NC_007488	CAGCGC	2	12	106191	106202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404685
75	NC_007488	AGCGCC	2	12	106495	106506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404685
76	NC_007488	TCGGGG	2	12	107513	107524	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	77404686
77	NC_007488	GAAGCC	2	12	108429	108440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404687
78	NC_007488	CATGAC	2	12	109546	109557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77404689
79	NC_007488	CGGTCA	2	12	109581	109592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404689
80	NC_007488	CGAGCG	2	12	110627	110638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404690
81	NC_007488	GTCTTG	2	12	111379	111390	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77404690
82	NC_007488	CGGCCG	2	12	111806	111817	0 %	0 %	50 %	50 %	77404691
83	NC_007488	TAGCCG	2	12	113694	113705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404692

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.