MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid B

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007488	GGCCG	2	10	1840	1849	0 %	0 %	60 %	40 %	77404593
2	NC_007488	GCCGC	2	10	3368	3377	0 %	0 %	40 %	60 %	552530712
3	NC_007488	TGCCG	2	10	3680	3689	0 %	20 %	40 %	40 %	77404595
4	NC_007488	CGCAG	2	10	3692	3701	20 %	0 %	40 %	40 %	77404595
5	NC_007488	GGCGA	2	10	3981	3990	20 %	0 %	60 %	20 %	77404595
6	NC_007488	GGGCC	2	10	4484	4493	0 %	0 %	60 %	40 %	77404595
7	NC_007488	CTCGC	2	10	5484	5493	0 %	20 %	20 %	60 %	77404596
8	NC_007488	CTCGG	2	10	5862	5871	0 %	20 %	40 %	40 %	77404596
9	NC_007488	TCTCG	2	10	8076	8085	0 %	40 %	20 %	40 %	77404599
10	NC_007488	GCCTG	2	10	9488	9497	0 %	20 %	40 %	40 %	77404600
11	NC_007488	CGCGG	2	10	11039	11048	0 %	0 %	60 %	40 %	77404601
12	NC_007488	TCGCC	2	10	12114	12123	0 %	20 %	20 %	60 %	77404602
13	NC_007488	CTCGC	2	10	13038	13047	0 %	20 %	20 %	60 %	77404603
14	NC_007488	GCGCC	2	10	14805	14814	0 %	0 %	40 %	60 %	77404605
15	NC_007488	ACGCG	2	10	14860	14869	20 %	0 %	40 %	40 %	77404605
16	NC_007488	GGCCC	2	10	16197	16206	0 %	0 %	40 %	60 %	77404605
17	NC_007488	ACGGC	2	10	16341	16350	20 %	0 %	40 %	40 %	77404605
18	NC_007488	CGGCG	2	10	17140	17149	0 %	0 %	60 %	40 %	77404606
19	NC_007488	GCACG	2	10	18687	18696	20 %	0 %	40 %	40 %	77404607
20	NC_007488	GCCGG	2	10	20792	20801	0 %	0 %	60 %	40 %	77404609
21	NC_007488	ATGTC	2	10	21307	21316	20 %	40 %	20 %	20 %	77404609
22	NC_007488	GCATG	2	10	23059	23068	20 %	20 %	40 %	20 %	552530714
23	NC_007488	GGCGC	2	10	23122	23131	0 %	0 %	60 %	40 %	552530714
24	NC_007488	CTCGC	2	10	23705	23714	0 %	20 %	20 %	60 %	552530714
25	NC_007488	TGCGC	2	10	28114	28123	0 %	20 %	40 %	40 %	77404613
26	NC_007488	CGCTG	2	10	28509	28518	0 %	20 %	40 %	40 %	77404613
27	NC_007488	CATCG	2	10	29451	29460	20 %	20 %	20 %	40 %	77404614
28	NC_007488	GGCGC	2	10	29487	29496	0 %	0 %	60 %	40 %	77404614
29	NC_007488	CGCGG	2	10	29846	29855	0 %	0 %	60 %	40 %	77404614
30	NC_007488	GCTGG	2	10	31726	31735	0 %	20 %	60 %	20 %	77404616
31	NC_007488	CGGGC	2	10	32322	32331	0 %	0 %	60 %	40 %	77404617
32	NC_007488	GCCGC	2	10	32584	32593	0 %	0 %	40 %	60 %	77404617
33	NC_007488	CCGCA	2	10	34256	34265	20 %	0 %	20 %	60 %	77404619
34	NC_007488	CCGCG	2	10	34349	34358	0 %	0 %	40 %	60 %	77404619
35	NC_007488	TGCGC	2	10	34730	34739	0 %	20 %	40 %	40 %	77404619
36	NC_007488	TCGTC	2	10	36283	36292	0 %	40 %	20 %	40 %	77404620
37	NC_007488	GGCGC	2	10	37164	37173	0 %	0 %	60 %	40 %	77404621
38	NC_007488	CTGAG	2	10	38157	38166	20 %	20 %	40 %	20 %	77404621
39	NC_007488	GACGG	2	10	38493	38502	20 %	0 %	60 %	20 %	77404622
40	NC_007488	GGCCG	2	10	38559	38568	0 %	0 %	60 %	40 %	77404622
41	NC_007488	GGGCG	2	10	38615	38624	0 %	0 %	80 %	20 %	77404622
42	NC_007488	GGGCG	2	10	39312	39321	0 %	0 %	80 %	20 %	77404623
43	NC_007488	CGGAG	2	10	39607	39616	20 %	0 %	60 %	20 %	77404623
44	NC_007488	TGCTC	2	10	40045	40054	0 %	40 %	20 %	40 %	77404623
45	NC_007488	GGGCG	2	10	40067	40076	0 %	0 %	80 %	20 %	77404623
46	NC_007488	TGCGC	2	10	41489	41498	0 %	20 %	40 %	40 %	77404624
47	NC_007488	GGGCC	2	10	41925	41934	0 %	0 %	60 %	40 %	77404624
48	NC_007488	CTCGC	2	10	42449	42458	0 %	20 %	20 %	60 %	77404625
49	NC_007488	CCTCG	2	10	42661	42670	0 %	20 %	20 %	60 %	77404625
50	NC_007488	GCCTC	2	10	42803	42812	0 %	20 %	20 %	60 %	77404626
51	NC_007488	GCGCG	2	10	42840	42849	0 %	0 %	60 %	40 %	77404626
52	NC_007488	TGCGG	2	10	44725	44734	0 %	20 %	60 %	20 %	77404627
53	NC_007488	GGCCG	2	10	46133	46142	0 %	0 %	60 %	40 %	77404628
54	NC_007488	TGCAC	2	10	46451	46460	20 %	20 %	20 %	40 %	77404629
55	NC_007488	ATCGC	2	10	47574	47583	20 %	20 %	20 %	40 %	552530717
56	NC_007488	CGGGC	2	10	47623	47632	0 %	0 %	60 %	40 %	552530717
57	NC_007488	CCGAC	2	10	48639	48648	20 %	0 %	20 %	60 %	77404631
58	NC_007488	CGCAC	2	10	52109	52118	20 %	0 %	20 %	60 %	77404634
59	NC_007488	GCCGG	2	10	53909	53918	0 %	0 %	60 %	40 %	77404637
60	NC_007488	GTCGA	2	10	54291	54300	20 %	20 %	40 %	20 %	77404637
61	NC_007488	TCCGC	2	10	55017	55026	0 %	20 %	20 %	60 %	77404637
62	NC_007488	CGCGC	2	10	57900	57909	0 %	0 %	40 %	60 %	77404639
63	NC_007488	CGCCC	2	10	59592	59601	0 %	0 %	20 %	80 %	77404640
64	NC_007488	GCCGG	2	10	59712	59721	0 %	0 %	60 %	40 %	77404640
65	NC_007488	CGGCC	2	10	60533	60542	0 %	0 %	40 %	60 %	77404641
66	NC_007488	GCGCG	2	10	61583	61592	0 %	0 %	60 %	40 %	77404642
67	NC_007488	GGGCC	2	10	62634	62643	0 %	0 %	60 %	40 %	552530719
68	NC_007488	GGCGG	2	10	62676	62685	0 %	0 %	80 %	20 %	552530719
69	NC_007488	GCGCG	2	10	63883	63892	0 %	0 %	60 %	40 %	552530720
70	NC_007488	TCGTC	2	10	64072	64081	0 %	40 %	20 %	40 %	552530720
71	NC_007488	GCGCG	2	10	64364	64373	0 %	0 %	60 %	40 %	552530720
72	NC_007488	CGCGC	2	10	65039	65048	0 %	0 %	40 %	60 %	552530720
73	NC_007488	CCTCG	2	10	66760	66769	0 %	20 %	20 %	60 %	77404646
74	NC_007488	CCGCG	2	10	67666	67675	0 %	0 %	40 %	60 %	77404646
75	NC_007488	GAAGA	2	10	68576	68585	60 %	0 %	40 %	0 %	77404647
76	NC_007488	CGATG	2	10	69082	69091	20 %	20 %	40 %	20 %	77404647
77	NC_007488	GGGCG	2	10	69727	69736	0 %	0 %	80 %	20 %	77404647
78	NC_007488	GCGCC	2	10	71851	71860	0 %	0 %	40 %	60 %	77404650
79	NC_007488	GCCGC	2	10	71955	71964	0 %	0 %	40 %	60 %	77404650
80	NC_007488	CGCGG	2	10	74206	74215	0 %	0 %	60 %	40 %	77404653
81	NC_007488	GATCG	2	10	77181	77190	20 %	20 %	40 %	20 %	77404656
82	NC_007488	CGGCG	2	10	78066	78075	0 %	0 %	60 %	40 %	552530722
83	NC_007488	GCGCC	2	10	78164	78173	0 %	0 %	40 %	60 %	552530722
84	NC_007488	GCGCA	2	10	78249	78258	20 %	0 %	40 %	40 %	552530722
85	NC_007488	TGCGC	2	10	78551	78560	0 %	20 %	40 %	40 %	552530722
86	NC_007488	TCGCC	2	10	78766	78775	0 %	20 %	20 %	60 %	552530722
87	NC_007488	CCATG	2	10	79220	79229	20 %	20 %	20 %	40 %	77404658
88	NC_007488	CGGCG	2	10	80471	80480	0 %	0 %	60 %	40 %	77404658
89	NC_007488	CCGCG	2	10	80987	80996	0 %	0 %	40 %	60 %	77404658
90	NC_007488	CTGGC	2	10	81195	81204	0 %	20 %	40 %	40 %	77404658
91	NC_007488	CAGAC	2	10	81384	81393	40 %	0 %	20 %	40 %	77404659
92	NC_007488	GCCTC	2	10	84191	84200	0 %	20 %	20 %	60 %	77404662
93	NC_007488	GCGCT	2	10	84238	84247	0 %	20 %	40 %	40 %	77404662
94	NC_007488	CCGCG	2	10	86513	86522	0 %	0 %	40 %	60 %	77404664
95	NC_007488	GCACC	2	10	87256	87265	20 %	0 %	20 %	60 %	77404665
96	NC_007488	CGCCC	2	10	91106	91115	0 %	0 %	20 %	80 %	77404670
97	NC_007488	TGCGC	2	10	93033	93042	0 %	20 %	40 %	40 %	552530723
98	NC_007488	GGCGC	2	10	93449	93458	0 %	0 %	60 %	40 %	552530723
99	NC_007488	CGGGC	2	10	94040	94049	0 %	0 %	60 %	40 %	552530724
100	NC_007488	CGAGC	2	10	94727	94736	20 %	0 %	40 %	40 %	552530724
101	NC_007488	CGGGT	2	10	94881	94890	0 %	20 %	60 %	20 %	77404673
102	NC_007488	CGGCG	2	10	94921	94930	0 %	0 %	60 %	40 %	77404673
103	NC_007488	CGGCG	2	10	95258	95267	0 %	0 %	60 %	40 %	77404673
104	NC_007488	GGGCA	2	10	98955	98964	20 %	0 %	60 %	20 %	77404677
105	NC_007488	AGGGC	2	10	100115	100124	20 %	0 %	60 %	20 %	77404679
106	NC_007488	CGGCC	2	10	100886	100895	0 %	0 %	40 %	60 %	77404680
107	NC_007488	GAGGC	2	10	101434	101443	20 %	0 %	60 %	20 %	77404680
108	NC_007488	GCCGC	2	10	103403	103412	0 %	0 %	40 %	60 %	77404682
109	NC_007488	CCGCC	2	10	104711	104720	0 %	0 %	20 %	80 %	77404684
110	NC_007488	GGCGC	2	10	105492	105501	0 %	0 %	60 %	40 %	77404685
111	NC_007488	CCAGC	2	10	105966	105975	20 %	0 %	20 %	60 %	77404685
112	NC_007488	TGGCA	2	10	106484	106493	20 %	20 %	40 %	20 %	77404685
113	NC_007488	CGGCG	2	10	106959	106968	0 %	0 %	60 %	40 %	77404686
114	NC_007488	AGCCC	2	10	107364	107373	20 %	0 %	20 %	60 %	77404686
115	NC_007488	CCGCG	2	10	109675	109684	0 %	0 %	40 %	60 %	77404689
116	NC_007488	CAGCG	2	10	110219	110228	20 %	0 %	40 %	40 %	77404689
117	NC_007488	GTCCG	2	10	111264	111273	0 %	20 %	40 %	40 %	77404690
118	NC_007488	GCGGG	2	10	111704	111713	0 %	0 %	80 %	20 %	77404691
119	NC_007488	AGCGC	2	10	112999	113008	20 %	0 %	40 %	40 %	77404692

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.