MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid B

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007488	TGCC	2	8	928	935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007488	CGGA	2	8	1123	1130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007488	CGGC	2	8	1295	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007488	GCGG	2	8	1376	1383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007488	CCGG	2	8	1591	1598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007488	CCTC	2	8	2174	2181	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_007488	CACG	2	8	2235	2242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007488	GGCC	2	8	3597	3604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007488	AGGG	2	8	3631	3638	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007488	GCCG	2	8	5002	5009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007488	CGGC	2	8	8901	8908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007488	GCCC	2	8	13363	13370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_007488	GCCG	2	8	17776	17783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007488	CGCC	2	8	19238	19245	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_007488	CATT	2	8	20425	20432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007488	GGAC	2	8	24335	24342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007488	CGAC	2	8	24390	24397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007488	GGCG	2	8	24802	24809	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007488	CGGG	2	8	24906	24913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007488	GCGG	2	8	25703	25710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007488	CGGG	2	8	25993	26000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007488	CGGG	2	8	26023	26030	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007488	CGGT	2	8	26156	26163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007488	TTAA	2	8	26186	26193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007488	CATT	2	8	26196	26203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007488	GAGG	2	8	26286	26293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007488	GGCC	2	8	36879	36886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007488	CCCG	2	8	36906	36913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_007488	CTGC	2	8	36925	36932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007488	CGGG	2	8	36933	36940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007488	CTGC	2	8	37000	37007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007488	CGCC	2	8	37052	37059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_007488	CCAG	2	8	50120	50127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007488	GCCG	2	8	53446	53453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007488	AGGC	2	8	53458	53465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007488	CTGA	2	8	56852	56859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007488	GGCT	2	8	56861	56868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007488	TGCC	2	8	58925	58932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007488	TCCG	2	8	61145	61152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007488	CTCC	2	8	66476	66483	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_007488	ATCG	2	8	66556	66563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007488	CCTC	2	8	72040	72047	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_007488	GGCC	2	8	85473	85480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007488	GGGC	2	8	93639	93646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007488	GGTC	2	8	100560	100567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007488	GTCT	2	8	102305	102312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007488	CGCC	2	8	114097	114104	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.