MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid B

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007488	CGGC	2	8	2071	2078	0 %	0 %	50 %	50 %	77404593
2	NC_007488	CGGG	2	8	2799	2806	0 %	0 %	75 %	25 %	552530712
3	NC_007488	ACGC	2	8	3254	3261	25 %	0 %	25 %	50 %	552530712
4	NC_007488	GACC	2	8	3348	3355	25 %	0 %	25 %	50 %	552530712
5	NC_007488	CGAG	2	8	3886	3893	25 %	0 %	50 %	25 %	77404595
6	NC_007488	CTGC	2	8	4310	4317	0 %	25 %	25 %	50 %	77404595
7	NC_007488	CGAA	2	8	4453	4460	50 %	0 %	25 %	25 %	77404595
8	NC_007488	ATCT	2	8	5151	5158	25 %	50 %	0 %	25 %	77404596
9	NC_007488	GCCC	2	8	5585	5592	0 %	0 %	25 %	75 %	77404596
10	NC_007488	CGGC	2	8	6063	6070	0 %	0 %	50 %	50 %	77404597
11	NC_007488	CGGA	2	8	6092	6099	25 %	0 %	50 %	25 %	77404597
12	NC_007488	GGCG	2	8	6298	6305	0 %	0 %	75 %	25 %	77404597
13	NC_007488	CCCG	2	8	7483	7490	0 %	0 %	25 %	75 %	77404598
14	NC_007488	GACC	2	8	7884	7891	25 %	0 %	25 %	50 %	77404599
15	NC_007488	CACC	2	8	8763	8770	25 %	0 %	0 %	75 %	77404599
16	NC_007488	ACCC	2	8	8856	8863	25 %	0 %	0 %	75 %	77404599
17	NC_007488	GCTC	2	8	9156	9163	0 %	25 %	25 %	50 %	77404600
18	NC_007488	GCCA	2	8	9466	9473	25 %	0 %	25 %	50 %	77404600
19	NC_007488	GGCG	2	8	9973	9980	0 %	0 %	75 %	25 %	77404600
20	NC_007488	CGGC	2	8	10007	10014	0 %	0 %	50 %	50 %	77404600
21	NC_007488	CGAC	2	8	10049	10056	25 %	0 %	25 %	50 %	77404600
22	NC_007488	GCGG	3	12	10791	10802	0 %	0 %	75 %	25 %	77404601
23	NC_007488	GACC	2	8	11111	11118	25 %	0 %	25 %	50 %	77404601
24	NC_007488	CAGC	2	8	11180	11187	25 %	0 %	25 %	50 %	77404601
25	NC_007488	CGGC	2	8	11305	11312	0 %	0 %	50 %	50 %	77404601
26	NC_007488	GGCG	2	8	11689	11696	0 %	0 %	75 %	25 %	77404602
27	NC_007488	GTGG	2	8	12124	12131	0 %	25 %	75 %	0 %	77404602
28	NC_007488	GGGC	2	8	12512	12519	0 %	0 %	75 %	25 %	77404603
29	NC_007488	CTCG	2	8	12641	12648	0 %	25 %	25 %	50 %	77404603
30	NC_007488	GGGC	2	8	12740	12747	0 %	0 %	75 %	25 %	77404603
31	NC_007488	GTCG	2	8	14010	14017	0 %	25 %	50 %	25 %	77404604
32	NC_007488	CTTC	2	8	14277	14284	0 %	50 %	0 %	50 %	77404604
33	NC_007488	GAGC	2	8	14295	14302	25 %	0 %	50 %	25 %	77404604
34	NC_007488	ATCT	2	8	14762	14769	25 %	50 %	0 %	25 %	77404605
35	NC_007488	CCCG	2	8	15068	15075	0 %	0 %	25 %	75 %	77404605
36	NC_007488	GGCT	2	8	15161	15168	0 %	25 %	50 %	25 %	77404605
37	NC_007488	GTCG	2	8	15328	15335	0 %	25 %	50 %	25 %	77404605
38	NC_007488	CGGC	2	8	15771	15778	0 %	0 %	50 %	50 %	77404605
39	NC_007488	GCTC	2	8	15969	15976	0 %	25 %	25 %	50 %	77404605
40	NC_007488	ATCT	2	8	16220	16227	25 %	50 %	0 %	25 %	77404605
41	NC_007488	CCGG	2	8	16377	16384	0 %	0 %	50 %	50 %	77404605
42	NC_007488	GACC	2	8	16438	16445	25 %	0 %	25 %	50 %	77404605
43	NC_007488	GCCC	2	8	16575	16582	0 %	0 %	25 %	75 %	77404605
44	NC_007488	CCAG	2	8	16980	16987	25 %	0 %	25 %	50 %	77404606
45	NC_007488	CAGC	2	8	17074	17081	25 %	0 %	25 %	50 %	77404606
46	NC_007488	AAGG	2	8	17386	17393	50 %	0 %	50 %	0 %	77404606
47	NC_007488	GGCC	2	8	17659	17666	0 %	0 %	50 %	50 %	77404606
48	NC_007488	GCCG	2	8	18323	18330	0 %	0 %	50 %	50 %	77404607
49	NC_007488	CGCC	2	8	18731	18738	0 %	0 %	25 %	75 %	77404607
50	NC_007488	GCCC	2	8	18740	18747	0 %	0 %	25 %	75 %	77404607
51	NC_007488	CGCC	3	12	18778	18789	0 %	0 %	25 %	75 %	77404607
52	NC_007488	CGGT	2	8	18955	18962	0 %	25 %	50 %	25 %	77404607
53	NC_007488	ATCT	2	8	19784	19791	25 %	50 %	0 %	25 %	552530713
54	NC_007488	GGCT	2	8	20036	20043	0 %	25 %	50 %	25 %	552530713
55	NC_007488	ACCT	2	8	20784	20791	25 %	25 %	0 %	50 %	77404609
56	NC_007488	CGCC	2	8	22117	22124	0 %	0 %	25 %	75 %	77404610
57	NC_007488	GTCG	2	8	22171	22178	0 %	25 %	50 %	25 %	77404610
58	NC_007488	GCTG	2	8	22275	22282	0 %	25 %	50 %	25 %	77404610
59	NC_007488	CCGG	2	8	22989	22996	0 %	0 %	50 %	50 %	552530714
60	NC_007488	GTCG	2	8	25077	25084	0 %	25 %	50 %	25 %	552530715
61	NC_007488	CCGC	2	8	25457	25464	0 %	0 %	25 %	75 %	552530715
62	NC_007488	GGGC	2	8	25552	25559	0 %	0 %	75 %	25 %	552530715
63	NC_007488	CGGA	2	8	27124	27131	25 %	0 %	50 %	25 %	77404612
64	NC_007488	AGCG	2	8	28124	28131	25 %	0 %	50 %	25 %	77404613
65	NC_007488	GCTG	2	8	28212	28219	0 %	25 %	50 %	25 %	77404613
66	NC_007488	GCTG	2	8	28474	28481	0 %	25 %	50 %	25 %	77404613
67	NC_007488	GACG	2	8	28613	28620	25 %	0 %	50 %	25 %	77404613
68	NC_007488	TGCG	2	8	28625	28632	0 %	25 %	50 %	25 %	77404613
69	NC_007488	GCGG	2	8	29263	29270	0 %	0 %	75 %	25 %	77404614
70	NC_007488	GGGC	2	8	30088	30095	0 %	0 %	75 %	25 %	77404614
71	NC_007488	GCGG	2	8	30409	30416	0 %	0 %	75 %	25 %	552530716
72	NC_007488	CGGC	2	8	30675	30682	0 %	0 %	50 %	50 %	552530716
73	NC_007488	CTCG	2	8	31284	31291	0 %	25 %	25 %	50 %	552530716
74	NC_007488	GCCT	2	8	32227	32234	0 %	25 %	25 %	50 %	77404617
75	NC_007488	GGCG	2	8	32523	32530	0 %	0 %	75 %	25 %	77404617
76	NC_007488	TGGC	2	8	32800	32807	0 %	25 %	50 %	25 %	77404617
77	NC_007488	TCGA	2	8	33145	33152	25 %	25 %	25 %	25 %	77404617
78	NC_007488	GGCG	2	8	33395	33402	0 %	0 %	75 %	25 %	77404618
79	NC_007488	CCCG	2	8	33666	33673	0 %	0 %	25 %	75 %	77404618
80	NC_007488	GACA	2	8	33696	33703	50 %	0 %	25 %	25 %	77404619
81	NC_007488	CCGG	2	8	33704	33711	0 %	0 %	50 %	50 %	77404619
82	NC_007488	GCCC	2	8	33803	33810	0 %	0 %	25 %	75 %	77404619
83	NC_007488	GGCG	2	8	34163	34170	0 %	0 %	75 %	25 %	77404619
84	NC_007488	GCCG	2	8	36269	36276	0 %	0 %	50 %	50 %	77404620
85	NC_007488	CCGC	2	8	37351	37358	0 %	0 %	25 %	75 %	77404621
86	NC_007488	GTCG	2	8	37538	37545	0 %	25 %	50 %	25 %	77404621
87	NC_007488	GGGC	2	8	37762	37769	0 %	0 %	75 %	25 %	77404621
88	NC_007488	GGGC	2	8	37996	38003	0 %	0 %	75 %	25 %	77404621
89	NC_007488	CTCG	2	8	38057	38064	0 %	25 %	25 %	50 %	77404621
90	NC_007488	GCGG	2	8	38399	38406	0 %	0 %	75 %	25 %	77404622
91	NC_007488	GGGC	2	8	39005	39012	0 %	0 %	75 %	25 %	77404622
92	NC_007488	AGGC	2	8	39172	39179	25 %	0 %	50 %	25 %	77404622
93	NC_007488	GCGG	2	8	39335	39342	0 %	0 %	75 %	25 %	77404623
94	NC_007488	CGTC	2	8	40087	40094	0 %	25 %	25 %	50 %	77404623
95	NC_007488	CGGG	2	8	40558	40565	0 %	0 %	75 %	25 %	77404623
96	NC_007488	TCGA	2	8	40641	40648	25 %	25 %	25 %	25 %	77404623
97	NC_007488	CTGG	2	8	41840	41847	0 %	25 %	50 %	25 %	77404624
98	NC_007488	CGCC	2	8	42896	42903	0 %	0 %	25 %	75 %	77404626
99	NC_007488	CGGG	2	8	42928	42935	0 %	0 %	75 %	25 %	77404626
100	NC_007488	CATC	2	8	43323	43330	25 %	25 %	0 %	50 %	77404626
101	NC_007488	TTCC	2	8	43491	43498	0 %	50 %	0 %	50 %	77404626
102	NC_007488	GCCC	2	8	43737	43744	0 %	0 %	25 %	75 %	77404627
103	NC_007488	CTCG	2	8	43833	43840	0 %	25 %	25 %	50 %	77404627
104	NC_007488	GCCG	2	8	44036	44043	0 %	0 %	50 %	50 %	77404627
105	NC_007488	CGCT	2	8	44320	44327	0 %	25 %	25 %	50 %	77404627
106	NC_007488	CGGC	2	8	44599	44606	0 %	0 %	50 %	50 %	77404627
107	NC_007488	GCCC	2	8	44676	44683	0 %	0 %	25 %	75 %	77404627
108	NC_007488	GATC	2	8	44839	44846	25 %	25 %	25 %	25 %	77404628
109	NC_007488	CGCC	2	8	44898	44905	0 %	0 %	25 %	75 %	77404628
110	NC_007488	GCCC	2	8	44978	44985	0 %	0 %	25 %	75 %	77404628
111	NC_007488	CGGT	2	8	45153	45160	0 %	25 %	50 %	25 %	77404628
112	NC_007488	GCCG	2	8	45604	45611	0 %	0 %	50 %	50 %	77404628
113	NC_007488	CGCC	2	8	45670	45677	0 %	0 %	25 %	75 %	77404628
114	NC_007488	CGGC	2	8	45724	45731	0 %	0 %	50 %	50 %	77404628
115	NC_007488	TCGG	2	8	46873	46880	0 %	25 %	50 %	25 %	77404629
116	NC_007488	CGCC	2	8	47761	47768	0 %	0 %	25 %	75 %	552530717
117	NC_007488	GCCG	2	8	48862	48869	0 %	0 %	50 %	50 %	77404631
118	NC_007488	ACGG	2	8	48971	48978	25 %	0 %	50 %	25 %	77404631
119	NC_007488	TCGC	2	8	49465	49472	0 %	25 %	25 %	50 %	77404632
120	NC_007488	CTCG	2	8	49716	49723	0 %	25 %	25 %	50 %	77404632
121	NC_007488	GTCG	2	8	50180	50187	0 %	25 %	50 %	25 %	77404633
122	NC_007488	CTTC	2	8	50930	50937	0 %	50 %	0 %	50 %	77404633
123	NC_007488	GCTG	2	8	51097	51104	0 %	25 %	50 %	25 %	77404633
124	NC_007488	CTTC	2	8	51204	51211	0 %	50 %	0 %	50 %	77404634
125	NC_007488	TCCT	2	8	51454	51461	0 %	50 %	0 %	50 %	77404634
126	NC_007488	GGCG	2	8	52131	52138	0 %	0 %	75 %	25 %	77404634
127	NC_007488	GATG	2	8	52323	52330	25 %	25 %	50 %	0 %	77404635
128	NC_007488	CGGG	2	8	52706	52713	0 %	0 %	75 %	25 %	77404635
129	NC_007488	CCCG	2	8	53267	53274	0 %	0 %	25 %	75 %	77404636
130	NC_007488	CGGG	2	8	53926	53933	0 %	0 %	75 %	25 %	77404637
131	NC_007488	TCGA	2	8	54354	54361	25 %	25 %	25 %	25 %	77404637
132	NC_007488	CCCG	2	8	54469	54476	0 %	0 %	25 %	75 %	77404637
133	NC_007488	TCGA	2	8	54567	54574	25 %	25 %	25 %	25 %	77404637
134	NC_007488	CGCC	2	8	55473	55480	0 %	0 %	25 %	75 %	77404637
135	NC_007488	ACGA	2	8	56406	56413	50 %	0 %	25 %	25 %	77404637
136	NC_007488	TCCA	2	8	56544	56551	25 %	25 %	0 %	50 %	77404637
137	NC_007488	CACC	2	8	56801	56808	25 %	0 %	0 %	75 %	77404637
138	NC_007488	CTGC	2	8	57492	57499	0 %	25 %	25 %	50 %	552530718
139	NC_007488	GACG	2	8	57699	57706	25 %	0 %	50 %	25 %	552530718
140	NC_007488	ATCT	2	8	58002	58009	25 %	50 %	0 %	25 %	77404639
141	NC_007488	GCGG	2	8	58091	58098	0 %	0 %	75 %	25 %	77404639
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143	NC_007488	GGCG	2	8	58223	58230	0 %	0 %	75 %	25 %	77404639
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.