MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007486	GGCAGA	2	12	2169	2180	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77404490
2	NC_007486	CGAACC	2	12	8107	8118	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77404497
3	NC_007486	GAAGCG	3	18	8201	8218	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77404497
4	NC_007486	CCACAG	2	12	8510	8521	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77404497
5	NC_007486	GGCGAT	2	12	10429	10440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404497
6	NC_007486	GGGAGT	2	12	10560	10571	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	77404497
7	NC_007486	CGTCGA	2	12	10690	10701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404497
8	NC_007486	TGACGA	2	12	11289	11300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77404497
9	NC_007486	CACAAC	2	12	12641	12652	50 %	0 %	0 %	50 %	77404497
10	NC_007486	GCCAAA	2	12	12662	12673	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	77404497
11	NC_007486	GAGCAA	2	12	14216	14227	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77404497
12	NC_007486	CGCAGG	2	12	15012	15023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404498
13	NC_007486	AGAACG	2	12	24283	24294	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77404502
14	NC_007486	CGAGCA	2	12	33026	33037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404510
15	NC_007486	TTCGAC	2	12	35504	35515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404514
16	NC_007486	CGTTGT	2	12	37366	37377	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77404515
17	NC_007486	ACCAGG	2	12	41075	41086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404519
18	NC_007486	TCGCTT	2	12	42862	42873	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	77404521
19	NC_007486	CACCGA	2	12	43790	43801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77404522
20	NC_007486	CCACAA	2	12	46245	46256	50 %	0 %	0 %	50 %	77404523
21	NC_007486	CGTTGA	2	12	50517	50528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404530
22	NC_007486	GATGCC	2	12	50644	50655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404531
23	NC_007486	CGCGAG	2	12	55091	55102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404535
24	NC_007486	CTCGGC	2	12	57759	57770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404537
25	NC_007486	ACCGAC	2	12	68079	68090	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77404547
26	NC_007486	GTAGCC	2	12	73696	73707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404554
27	NC_007486	TCTCCG	2	12	74163	74174	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77404554
28	NC_007486	CGCCGG	2	12	75368	75379	0 %	0 %	50 %	50 %	77404555
29	NC_007486	GGCGCG	2	12	78548	78559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404558
30	NC_007486	TTCGGG	2	12	80951	80962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	77404560
31	NC_007486	CCTGCG	2	12	84042	84053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404561
32	NC_007486	GAGAAA	2	12	84583	84594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404562
33	NC_007486	TGGTCA	2	12	89710	89721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77404570
34	NC_007486	TATCGC	2	12	89816	89827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404570
35	NC_007486	CGGCGA	2	12	91937	91948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77404573
36	NC_007486	ACTTCG	2	12	96026	96037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404579
37	NC_007486	CCGCGG	2	12	96131	96142	0 %	0 %	50 %	50 %	77404579

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.