MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007486	GTCCT	2	10	2707	2716	0 %	40 %	20 %	40 %	77404491
2	NC_007486	TCCGG	2	10	2860	2869	0 %	20 %	40 %	40 %	77404492
3	NC_007486	GCGCT	2	10	3751	3760	0 %	20 %	40 %	40 %	77404494
4	NC_007486	CGATC	2	10	5321	5330	20 %	20 %	20 %	40 %	77404496
5	NC_007486	CGCAG	2	10	6922	6931	20 %	0 %	40 %	40 %	77404497
6	NC_007486	CGGTC	2	10	7864	7873	0 %	20 %	40 %	40 %	77404497
7	NC_007486	TGCGG	2	10	8936	8945	0 %	20 %	60 %	20 %	77404497
8	NC_007486	AACGC	2	10	11877	11886	40 %	0 %	20 %	40 %	77404497
9	NC_007486	AGGAC	2	10	12247	12256	40 %	0 %	40 %	20 %	77404497
10	NC_007486	GCAAC	2	10	13090	13099	40 %	0 %	20 %	40 %	77404497
11	NC_007486	TCTCG	2	10	15494	15503	0 %	40 %	20 %	40 %	77404498
12	NC_007486	CACCG	2	10	18158	18167	20 %	0 %	20 %	60 %	77404501
13	NC_007486	CGGCA	2	10	18984	18993	20 %	0 %	40 %	40 %	77404501
14	NC_007486	TGAAC	2	10	20300	20309	40 %	20 %	20 %	20 %	77404501
15	NC_007486	ACGCG	2	10	22474	22483	20 %	0 %	40 %	40 %	77404502
16	NC_007486	ACCGG	2	10	22740	22749	20 %	0 %	40 %	40 %	77404502
17	NC_007486	CGCAC	2	10	22939	22948	20 %	0 %	20 %	60 %	77404502
18	NC_007486	AAAGC	2	10	23986	23995	60 %	0 %	20 %	20 %	77404502
19	NC_007486	GTGCG	2	10	26812	26821	0 %	20 %	60 %	20 %	77404505
20	NC_007486	CGAGC	2	10	26851	26860	20 %	0 %	40 %	40 %	77404505
21	NC_007486	CCTGA	2	10	28942	28951	20 %	20 %	20 %	40 %	77404507
22	NC_007486	CCCCA	2	10	29353	29362	20 %	0 %	0 %	80 %	77404508
23	NC_007486	CCTGC	2	10	29857	29866	0 %	20 %	20 %	60 %	77404508
24	NC_007486	CCCAG	2	10	32226	32235	20 %	0 %	20 %	60 %	77404509
25	NC_007486	GATTC	2	10	32911	32920	20 %	40 %	20 %	20 %	77404510
26	NC_007486	GTGGC	2	10	33422	33431	0 %	20 %	60 %	20 %	77404511
27	NC_007486	GCTGT	2	10	33445	33454	0 %	40 %	40 %	20 %	77404511
28	NC_007486	GTTGA	2	10	38635	38644	20 %	40 %	40 %	0 %	77404517
29	NC_007486	GTCGA	2	10	40342	40351	20 %	20 %	40 %	20 %	77404519
30	NC_007486	GGTGA	2	10	40898	40907	20 %	20 %	60 %	0 %	77404519
31	NC_007486	GCGTC	2	10	41170	41179	0 %	20 %	40 %	40 %	77404520
32	NC_007486	GCACC	2	10	41355	41364	20 %	0 %	20 %	60 %	77404520
33	NC_007486	TGACC	2	10	42697	42706	20 %	20 %	20 %	40 %	77404521
34	NC_007486	CGTCG	2	10	43622	43631	0 %	20 %	40 %	40 %	77404522
35	NC_007486	ATCCG	2	10	45046	45055	20 %	20 %	20 %	40 %	77404523
36	NC_007486	CGATC	2	10	45439	45448	20 %	20 %	20 %	40 %	77404523
37	NC_007486	TGCTG	2	10	48113	48122	0 %	40 %	40 %	20 %	77404526
38	NC_007486	CGCTG	2	10	48284	48293	0 %	20 %	40 %	40 %	77404527
39	NC_007486	AGGAC	2	10	49128	49137	40 %	0 %	40 %	20 %	77404528
40	NC_007486	CGCAA	2	10	50437	50446	40 %	0 %	20 %	40 %	77404530
41	NC_007486	GTCGA	2	10	51754	51763	20 %	20 %	40 %	20 %	77404532
42	NC_007486	TGCGT	2	10	51982	51991	0 %	40 %	40 %	20 %	77404533
43	NC_007486	CAGCT	2	10	52541	52550	20 %	20 %	20 %	40 %	77404533
44	NC_007486	CGGTG	2	10	54112	54121	0 %	20 %	60 %	20 %	77404534
45	NC_007486	GCCGC	2	10	56965	56974	0 %	0 %	40 %	60 %	77404536
46	NC_007486	CATCG	2	10	58283	58292	20 %	20 %	20 %	40 %	77404537
47	NC_007486	CACCC	2	10	60608	60617	20 %	0 %	0 %	80 %	77404539
48	NC_007486	CGCAC	2	10	60984	60993	20 %	0 %	20 %	60 %	77404539
49	NC_007486	GTGTC	2	10	61619	61628	0 %	40 %	40 %	20 %	77404540
50	NC_007486	CTCGG	2	10	61761	61770	0 %	20 %	40 %	40 %	77404540
51	NC_007486	AGGAA	2	10	62065	62074	60 %	0 %	40 %	0 %	77404540
52	NC_007486	AGTGA	2	10	64934	64943	40 %	20 %	40 %	0 %	77404542
53	NC_007486	GAAAG	2	10	65366	65375	60 %	0 %	40 %	0 %	77404544
54	NC_007486	ACCTG	2	10	65545	65554	20 %	20 %	20 %	40 %	77404544
55	NC_007486	GACGC	2	10	67488	67497	20 %	0 %	40 %	40 %	77404546
56	NC_007486	GGCCG	2	10	70994	71003	0 %	0 %	60 %	40 %	77404550
57	NC_007486	AGCCG	2	10	71070	71079	20 %	0 %	40 %	40 %	77404551
58	NC_007486	GGTGT	2	10	71573	71582	0 %	40 %	60 %	0 %	77404551
59	NC_007486	TCGTC	2	10	71760	71769	0 %	40 %	20 %	40 %	77404551
60	NC_007486	GCGCG	2	10	75574	75583	0 %	0 %	60 %	40 %	77404556
61	NC_007486	GCCCG	2	10	76994	77003	0 %	0 %	40 %	60 %	77404556
62	NC_007486	GTTGA	2	10	77153	77162	20 %	40 %	40 %	0 %	77404556
63	NC_007486	GACCG	2	10	77763	77772	20 %	0 %	40 %	40 %	77404557
64	NC_007486	TCGAC	2	10	78035	78044	20 %	20 %	20 %	40 %	77404557
65	NC_007486	TGGCC	2	10	80496	80505	0 %	20 %	40 %	40 %	77404560
66	NC_007486	CGGCG	2	10	81520	81529	0 %	0 %	60 %	40 %	77404560
67	NC_007486	TGCGT	2	10	82135	82144	0 %	40 %	40 %	20 %	77404560
68	NC_007486	ACTGG	2	10	83667	83676	20 %	20 %	40 %	20 %	77404561
69	NC_007486	CGACA	2	10	89325	89334	40 %	0 %	20 %	40 %	77404569
70	NC_007486	GCGCT	2	10	91607	91616	0 %	20 %	40 %	40 %	77404573
71	NC_007486	CGCGG	2	10	91645	91654	0 %	0 %	60 %	40 %	77404573
72	NC_007486	ATCCG	2	10	92943	92952	20 %	20 %	20 %	40 %	77404576
73	NC_007486	GTCGG	2	10	93549	93558	0 %	20 %	60 %	20 %	77404576
74	NC_007486	CCGAC	2	10	96098	96107	20 %	0 %	20 %	60 %	77404579
75	NC_007486	GGGCT	2	10	96598	96607	0 %	20 %	60 %	20 %	77404579
76	NC_007486	TGCGG	2	10	98758	98767	0 %	20 %	60 %	20 %	77404582
77	NC_007486	GCACA	2	10	100822	100831	40 %	0 %	20 %	40 %	77404584
78	NC_007486	GCTCT	2	10	101090	101099	0 %	40 %	20 %	40 %	77404584
79	NC_007486	GCGAA	2	10	101124	101133	40 %	0 %	40 %	20 %	77404584

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.