MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007486	TCCC	2	8	3148	3155	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_007486	AGGG	2	8	3288	3295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007486	ACCG	2	8	14473	14480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007486	CAAG	2	8	17702	17709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007486	CAAA	2	8	17841	17848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007486	CCGA	2	8	24400	24407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007486	GTAA	2	8	27709	27716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007486	AACG	2	8	27757	27764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007486	CGAC	2	8	27824	27831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007486	AGGT	2	8	49819	49826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007486	CGGG	2	8	50000	50007	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007486	ACCG	2	8	57480	57487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007486	GTTT	2	8	57580	57587	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007486	GTAC	2	8	57590	57597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007486	GCCC	2	8	59401	59408	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_007486	GCTA	2	8	59757	59764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007486	GACA	2	8	59765	59772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007486	CTCA	2	8	59835	59842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007486	CTGT	2	8	63657	63664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007486	GACG	2	8	63708	63715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007486	TTGA	2	8	63845	63852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007486	TTTC	2	8	63855	63862	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007486	CAAC	2	8	63901	63908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007486	AGGT	2	8	64004	64011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007486	GGTA	2	8	64041	64048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007486	CTAG	2	8	65258	65265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007486	CAAA	2	8	65307	65314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007486	GCGT	2	8	68540	68547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007486	TGAC	2	8	73554	73561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007486	GCCT	2	8	83244	83251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007486	ACAG	2	8	86364	86371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007486	ACTC	2	8	87117	87124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007486	GACC	2	8	87153	87160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007486	TGCC	2	8	87192	87199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007486	GTCC	2	8	87368	87375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007486	AAAC	2	8	89594	89601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007486	GGTT	2	8	90116	90123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007486	CAAC	2	8	92752	92759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007486	CGAA	2	8	93937	93944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007486	TCGT	2	8	98038	98045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007486	CAGC	2	8	98147	98154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007486	CCAT	2	8	100678	100685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007486	AACC	2	8	100797	100804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007486	ACGC	2	8	101304	101311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.