MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007486	CG	3	6	414	419	0 %	0 %	50 %	50 %	77404486
2	NC_007486	CT	3	6	1447	1452	0 %	50 %	0 %	50 %	77404489
3	NC_007486	GA	3	6	1661	1666	50 %	0 %	50 %	0 %	77404490
4	NC_007486	GA	3	6	1797	1802	50 %	0 %	50 %	0 %	77404490
5	NC_007486	TG	3	6	2639	2644	0 %	50 %	50 %	0 %	77404491
6	NC_007486	AC	3	6	2935	2940	50 %	0 %	0 %	50 %	77404492
7	NC_007486	TG	3	6	4042	4047	0 %	50 %	50 %	0 %	77404494
8	NC_007486	AT	3	6	4236	4241	50 %	50 %	0 %	0 %	77404494
9	NC_007486	TC	3	6	5042	5047	0 %	50 %	0 %	50 %	77404496
10	NC_007486	GC	3	6	6097	6102	0 %	0 %	50 %	50 %	77404497
11	NC_007486	GC	3	6	7602	7607	0 %	0 %	50 %	50 %	77404497
12	NC_007486	AC	3	6	7782	7787	50 %	0 %	0 %	50 %	77404497
13	NC_007486	CA	3	6	7894	7899	50 %	0 %	0 %	50 %	77404497
14	NC_007486	TC	3	6	8391	8396	0 %	50 %	0 %	50 %	77404497
15	NC_007486	GC	3	6	8614	8619	0 %	0 %	50 %	50 %	77404497
16	NC_007486	GC	3	6	8893	8898	0 %	0 %	50 %	50 %	77404497
17	NC_007486	GC	3	6	11824	11829	0 %	0 %	50 %	50 %	77404497
18	NC_007486	GA	3	6	13701	13706	50 %	0 %	50 %	0 %	77404497
19	NC_007486	CA	3	6	14372	14377	50 %	0 %	0 %	50 %	77404497
20	NC_007486	AG	3	6	14822	14827	50 %	0 %	50 %	0 %	77404498
21	NC_007486	GT	3	6	15153	15158	0 %	50 %	50 %	0 %	77404498
22	NC_007486	GA	3	6	15373	15378	50 %	0 %	50 %	0 %	77404498
23	NC_007486	GC	3	6	15586	15591	0 %	0 %	50 %	50 %	77404498
24	NC_007486	GC	3	6	15738	15743	0 %	0 %	50 %	50 %	77404498
25	NC_007486	GT	3	6	16926	16931	0 %	50 %	50 %	0 %	77404499
26	NC_007486	TG	3	6	17585	17590	0 %	50 %	50 %	0 %	77404500
27	NC_007486	GC	3	6	18101	18106	0 %	0 %	50 %	50 %	77404501
28	NC_007486	GC	3	6	18120	18125	0 %	0 %	50 %	50 %	77404501
29	NC_007486	GC	3	6	18281	18286	0 %	0 %	50 %	50 %	77404501
30	NC_007486	TC	3	6	18925	18930	0 %	50 %	0 %	50 %	77404501
31	NC_007486	TC	3	6	20903	20908	0 %	50 %	0 %	50 %	77404501
32	NC_007486	GC	3	6	20917	20922	0 %	0 %	50 %	50 %	77404501
33	NC_007486	CG	3	6	21433	21438	0 %	0 %	50 %	50 %	77404501
34	NC_007486	TC	3	6	21681	21686	0 %	50 %	0 %	50 %	77404501
35	NC_007486	CA	3	6	22061	22066	50 %	0 %	0 %	50 %	77404501
36	NC_007486	AC	3	6	22731	22736	50 %	0 %	0 %	50 %	77404502
37	NC_007486	CT	3	6	22849	22854	0 %	50 %	0 %	50 %	77404502
38	NC_007486	CG	3	6	23032	23037	0 %	0 %	50 %	50 %	77404502
39	NC_007486	GA	3	6	25145	25150	50 %	0 %	50 %	0 %	77404504
40	NC_007486	TC	3	6	25253	25258	0 %	50 %	0 %	50 %	77404504
41	NC_007486	GC	3	6	25547	25552	0 %	0 %	50 %	50 %	77404504
42	NC_007486	CG	3	6	25592	25597	0 %	0 %	50 %	50 %	77404504
43	NC_007486	GC	3	6	26312	26317	0 %	0 %	50 %	50 %	77404505
44	NC_007486	CT	3	6	26609	26614	0 %	50 %	0 %	50 %	77404505
45	NC_007486	AG	3	6	26686	26691	50 %	0 %	50 %	0 %	77404505
46	NC_007486	GC	3	6	27024	27029	0 %	0 %	50 %	50 %	77404505
47	NC_007486	CG	3	6	27371	27376	0 %	0 %	50 %	50 %	77404505
48	NC_007486	GC	3	6	27534	27539	0 %	0 %	50 %	50 %	77404505
49	NC_007486	CG	3	6	27612	27617	0 %	0 %	50 %	50 %	77404505
50	NC_007486	CG	3	6	29974	29979	0 %	0 %	50 %	50 %	77404508
51	NC_007486	GC	3	6	30342	30347	0 %	0 %	50 %	50 %	77404509
52	NC_007486	GC	3	6	30603	30608	0 %	0 %	50 %	50 %	77404509
53	NC_007486	TC	3	6	30823	30828	0 %	50 %	0 %	50 %	77404509
54	NC_007486	GC	4	8	33043	33050	0 %	0 %	50 %	50 %	77404510
55	NC_007486	CA	3	6	33069	33074	50 %	0 %	0 %	50 %	77404510
56	NC_007486	GC	3	6	33161	33166	0 %	0 %	50 %	50 %	77404510
57	NC_007486	CG	3	6	33276	33281	0 %	0 %	50 %	50 %	77404510
58	NC_007486	GA	3	6	33788	33793	50 %	0 %	50 %	0 %	77404511
59	NC_007486	AG	3	6	34091	34096	50 %	0 %	50 %	0 %	77404512
60	NC_007486	GC	3	6	36059	36064	0 %	0 %	50 %	50 %	77404514
61	NC_007486	AG	3	6	36466	36471	50 %	0 %	50 %	0 %	77404514
62	NC_007486	TC	4	8	36793	36800	0 %	50 %	0 %	50 %	77404514
63	NC_007486	CT	3	6	39547	39552	0 %	50 %	0 %	50 %	77404519
64	NC_007486	GC	3	6	40322	40327	0 %	0 %	50 %	50 %	77404519
65	NC_007486	CG	4	8	43531	43538	0 %	0 %	50 %	50 %	77404522
66	NC_007486	TC	4	8	44589	44596	0 %	50 %	0 %	50 %	77404522
67	NC_007486	CG	3	6	46463	46468	0 %	0 %	50 %	50 %	77404524
68	NC_007486	AC	3	6	47803	47808	50 %	0 %	0 %	50 %	77404525
69	NC_007486	GT	3	6	48024	48029	0 %	50 %	50 %	0 %	77404526
70	NC_007486	CA	3	6	48346	48351	50 %	0 %	0 %	50 %	77404527
71	NC_007486	GC	3	6	48646	48651	0 %	0 %	50 %	50 %	77404527
72	NC_007486	GC	3	6	49396	49401	0 %	0 %	50 %	50 %	77404528
73	NC_007486	GA	3	6	51380	51385	50 %	0 %	50 %	0 %	77404532
74	NC_007486	GC	3	6	51474	51479	0 %	0 %	50 %	50 %	77404532
75	NC_007486	GC	3	6	52017	52022	0 %	0 %	50 %	50 %	77404533
76	NC_007486	TG	3	6	52642	52647	0 %	50 %	50 %	0 %	77404533
77	NC_007486	GC	3	6	55513	55518	0 %	0 %	50 %	50 %	77404535
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79	NC_007486	TC	3	6	57034	57039	0 %	50 %	0 %	50 %	77404536
80	NC_007486	CG	3	6	57306	57311	0 %	0 %	50 %	50 %	77404536
81	NC_007486	GA	3	6	57778	57783	50 %	0 %	50 %	0 %	77404537
82	NC_007486	TC	3	6	57807	57812	0 %	50 %	0 %	50 %	77404537
83	NC_007486	AC	3	6	58734	58739	50 %	0 %	0 %	50 %	77404538
84	NC_007486	GC	3	6	58744	58749	0 %	0 %	50 %	50 %	77404538
85	NC_007486	AG	3	6	60652	60657	50 %	0 %	50 %	0 %	77404539
86	NC_007486	AC	3	6	60810	60815	50 %	0 %	0 %	50 %	77404539
87	NC_007486	TC	3	6	61331	61336	0 %	50 %	0 %	50 %	77404540
88	NC_007486	CT	3	6	63040	63045	0 %	50 %	0 %	50 %	77404541
89	NC_007486	CG	4	8	64214	64221	0 %	0 %	50 %	50 %	77404542
90	NC_007486	CA	3	6	65834	65839	50 %	0 %	0 %	50 %	77404544
91	NC_007486	AC	3	6	66026	66031	50 %	0 %	0 %	50 %	77404544
92	NC_007486	CA	3	6	66055	66060	50 %	0 %	0 %	50 %	77404544
93	NC_007486	CG	3	6	67874	67879	0 %	0 %	50 %	50 %	77404547
94	NC_007486	AC	3	6	68261	68266	50 %	0 %	0 %	50 %	77404547
95	NC_007486	TC	3	6	68368	68373	0 %	50 %	0 %	50 %	77404548
96	NC_007486	CG	3	6	68836	68841	0 %	0 %	50 %	50 %	77404549
97	NC_007486	GC	3	6	70462	70467	0 %	0 %	50 %	50 %	77404550
98	NC_007486	CG	3	6	70914	70919	0 %	0 %	50 %	50 %	77404550
99	NC_007486	GC	3	6	71585	71590	0 %	0 %	50 %	50 %	77404551
100	NC_007486	GT	3	6	72641	72646	0 %	50 %	50 %	0 %	77404552
101	NC_007486	GT	3	6	72699	72704	0 %	50 %	50 %	0 %	77404552
102	NC_007486	GC	3	6	73285	73290	0 %	0 %	50 %	50 %	77404553
103	NC_007486	GC	3	6	74782	74787	0 %	0 %	50 %	50 %	77404555
104	NC_007486	AG	3	6	74878	74883	50 %	0 %	50 %	0 %	77404555
105	NC_007486	CG	4	8	76287	76294	0 %	0 %	50 %	50 %	77404556
106	NC_007486	CG	3	6	77043	77048	0 %	0 %	50 %	50 %	77404556
107	NC_007486	GC	3	6	77123	77128	0 %	0 %	50 %	50 %	77404556
108	NC_007486	GC	3	6	77567	77572	0 %	0 %	50 %	50 %	77404557
109	NC_007486	CG	3	6	77966	77971	0 %	0 %	50 %	50 %	77404557
110	NC_007486	CG	3	6	78484	78489	0 %	0 %	50 %	50 %	77404558
111	NC_007486	GC	3	6	78783	78788	0 %	0 %	50 %	50 %	77404558
112	NC_007486	CG	3	6	79021	79026	0 %	0 %	50 %	50 %	77404558
113	NC_007486	CG	3	6	79179	79184	0 %	0 %	50 %	50 %	77404558
114	NC_007486	GC	3	6	79464	79469	0 %	0 %	50 %	50 %	77404559
115	NC_007486	GC	3	6	79689	79694	0 %	0 %	50 %	50 %	77404559
116	NC_007486	AG	3	6	79753	79758	50 %	0 %	50 %	0 %	77404559
117	NC_007486	TG	3	6	79877	79882	0 %	50 %	50 %	0 %	77404559
118	NC_007486	GC	3	6	80171	80176	0 %	0 %	50 %	50 %	77404560
119	NC_007486	GC	3	6	80374	80379	0 %	0 %	50 %	50 %	77404560
120	NC_007486	CG	3	6	80640	80645	0 %	0 %	50 %	50 %	77404560
121	NC_007486	GC	3	6	82257	82262	0 %	0 %	50 %	50 %	77404560
122	NC_007486	TC	3	6	84548	84553	0 %	50 %	0 %	50 %	77404562
123	NC_007486	GC	3	6	89869	89874	0 %	0 %	50 %	50 %	77404570
124	NC_007486	AG	3	6	90668	90673	50 %	0 %	50 %	0 %	77404571
125	NC_007486	GA	4	8	91392	91399	50 %	0 %	50 %	0 %	77404572
126	NC_007486	TG	3	6	93365	93370	0 %	50 %	50 %	0 %	77404576
127	NC_007486	CT	3	6	94105	94110	0 %	50 %	0 %	50 %	77404577
128	NC_007486	AG	3	6	94618	94623	50 %	0 %	50 %	0 %	77404578
129	NC_007486	AC	3	6	95081	95086	50 %	0 %	0 %	50 %	77404578
130	NC_007486	CA	3	6	95335	95340	50 %	0 %	0 %	50 %	77404578
131	NC_007486	GC	3	6	96260	96265	0 %	0 %	50 %	50 %	77404579
132	NC_007486	CG	3	6	97243	97248	0 %	0 %	50 %	50 %	77404580
133	NC_007486	AC	3	6	97251	97256	50 %	0 %	0 %	50 %	77404580
134	NC_007486	CG	3	6	97559	97564	0 %	0 %	50 %	50 %	77404581
135	NC_007486	AT	3	6	98244	98249	50 %	50 %	0 %	0 %	77404582
136	NC_007486	CG	5	10	98417	98426	0 %	0 %	50 %	50 %	77404582
137	NC_007486	GC	3	6	98527	98532	0 %	0 %	50 %	50 %	77404582
138	NC_007486	GC	3	6	98624	98629	0 %	0 %	50 %	50 %	77404582
139	NC_007486	GC	3	6	103323	103328	0 %	0 %	50 %	50 %	77404587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.