MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 1035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	CAGCCT	2	12	424	435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163562
2	NC_007484	CTCGGC	2	12	1331	1342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77163562
3	NC_007484	TTGAAA	2	12	2541	2552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	77163563
4	NC_007484	AATAAA	2	12	13128	13139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	77163566
5	NC_007484	CGAGAA	2	12	19671	19682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77163570
6	NC_007484	AACTCG	2	12	23415	23426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77163573
7	NC_007484	CAATCT	2	12	26468	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163575
8	NC_007484	TATGGG	2	12	30624	30635	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77163578
9	NC_007484	CAGGAA	2	12	33874	33885	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77163581
10	NC_007484	CTAAAG	2	12	39496	39507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	77163588
11	NC_007484	TTAAAT	2	12	41268	41279	50 %	50 %	0 %	0 %	77163590
12	NC_007484	TCTTCG	2	12	47750	47761	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	77163596
13	NC_007484	TACGCT	2	12	47838	47849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77163596
14	NC_007484	ACGGAG	2	12	51411	51422	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77163600
15	NC_007484	GTCTTG	2	12	60101	60112	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77163606
16	NC_007484	CTATCA	2	12	60330	60341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163606
17	NC_007484	TTCGCG	2	12	66489	66500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163610
18	NC_007484	TTGGCT	2	12	71566	71577	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77163613
19	NC_007484	TCTTCG	2	12	73343	73354	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	77163615
20	NC_007484	TACGCT	2	12	73431	73442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77163615
21	NC_007484	CCTTGA	2	12	84989	85000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77163620
22	NC_007484	GAAAGC	2	12	87062	87073	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77163622
23	NC_007484	TAGAAA	2	12	91980	91991	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	77163629
24	NC_007484	CGGATT	2	12	95833	95844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77163632
25	NC_007484	CAGGAA	2	12	97748	97759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77163635
26	NC_007484	CGCCCG	2	12	102746	102757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163639
27	NC_007484	GCATCC	2	12	107987	107998	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163643
28	NC_007484	GGCGCG	2	12	109433	109444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163645
29	NC_007484	TATTGA	2	12	110605	110616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	77163646
30	NC_007484	GCGCTG	2	12	121379	121390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77163653
31	NC_007484	TTCTCT	2	12	124801	124812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163655
32	NC_007484	CAGTGC	2	12	127047	127058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77163656
33	NC_007484	TAAGCC	2	12	128209	128220	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77163657
34	NC_007484	GGAAAG	2	12	128582	128593	50 %	0 %	50 %	0 %	77163658
35	NC_007484	CCTTTG	2	12	131442	131453	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	77163661
36	NC_007484	ATGACC	2	12	133576	133587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77163664
37	NC_007484	CCCGTA	2	12	135023	135034	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163664
38	NC_007484	GGCTTT	2	12	141854	141865	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77163668
39	NC_007484	TGGGTA	2	12	146697	146708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77163673
40	NC_007484	CAAGGC	2	12	149599	149610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163674
41	NC_007484	GATTGA	2	12	150050	150061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163674
42	NC_007484	GTTTCG	2	12	150838	150849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77163675
43	NC_007484	ATTGGG	2	12	151714	151725	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77163677
44	NC_007484	GCCGAG	2	12	155110	155121	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77163682
45	NC_007484	TGCTTC	2	12	156620	156631	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	77163683
46	NC_007484	ATGATT	2	12	159037	159048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	77163686
47	NC_007484	TAGTCT	2	12	159243	159254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	77163687
48	NC_007484	TGGCGC	2	12	160486	160497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77163688
49	NC_007484	GCGCAG	2	12	161148	161159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77163688
50	NC_007484	TGCTAA	2	12	171018	171029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	77163696
51	NC_007484	ATTACC	2	12	171343	171354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163696
52	NC_007484	TGGCTT	2	12	175056	175067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77163698
53	NC_007484	GGAACC	2	12	180902	180913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163702
54	NC_007484	GCCCAA	2	12	189963	189974	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77163709
55	NC_007484	TGCCAA	2	12	192620	192631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77163711
56	NC_007484	TGCCAA	2	12	193343	193354	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77163711
57	NC_007484	GTGGAT	2	12	193458	193469	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77163711
58	NC_007484	GCCGTG	2	12	196251	196262	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77163714
59	NC_007484	GCTGGA	2	12	197717	197728	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77163715
60	NC_007484	AGAGCG	2	12	200887	200898	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77163718
61	NC_007484	ATTCTT	2	12	205757	205768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	77163725
62	NC_007484	AAGGCC	2	12	212808	212819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163732
63	NC_007484	GCCAGG	2	12	218621	218632	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77163736
64	NC_007484	CGGTAC	2	12	224265	224276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77163740
65	NC_007484	ATGATT	2	12	242538	242549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	77163753
66	NC_007484	GGATGA	2	12	244415	244426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	77163755
67	NC_007484	GCGGGC	2	12	246375	246386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163758
68	NC_007484	GATCGA	2	12	250592	250603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77163761
69	NC_007484	TAGGCT	2	12	255231	255242	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77163765
70	NC_007484	GATCCC	2	12	259998	260009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163770
71	NC_007484	AGGCAA	2	12	261340	261351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	77163772
72	NC_007484	CTATTG	2	12	264833	264844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	77163775
73	NC_007484	TATCGA	2	12	268938	268949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	77163779
74	NC_007484	GAAAAA	2	12	274472	274483	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	77163783
75	NC_007484	AAAAGG	2	12	276841	276852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163786
76	NC_007484	AGTTGG	2	12	277129	277140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77163786
77	NC_007484	CGGAAC	2	12	288692	288703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163796
78	NC_007484	GTGCTA	2	12	297981	297992	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77163804
79	NC_007484	ATGTTG	2	12	298329	298340	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	77163804
80	NC_007484	TGGACA	2	12	301781	301792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77163807
81	NC_007484	AGAGGA	2	12	304830	304841	50 %	0 %	50 %	0 %	77163810
82	NC_007484	CGGGAA	2	12	314678	314689	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77163821
83	NC_007484	CCTGGG	2	12	315806	315817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77163822
84	NC_007484	GGGCGC	2	12	320067	320078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163826
85	NC_007484	ACCAGC	2	12	328172	328183	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77163832
86	NC_007484	CGCTGG	2	12	335540	335551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77163842
87	NC_007484	AATCCA	2	12	339601	339612	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	77163845
88	NC_007484	CCTGAG	2	12	341483	341494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77163848
89	NC_007484	TGGATT	2	12	346317	346328	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	77163852
90	NC_007484	TATCAA	2	12	348249	348260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	77163854
91	NC_007484	TACGCT	2	12	353476	353487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77163857
92	NC_007484	GGCGGG	2	12	356179	356190	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	77163859
93	NC_007484	TCTGGT	2	12	362525	362536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	77163866
94	NC_007484	GCATCC	2	12	369609	369620	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163870
95	NC_007484	CCAGGG	2	12	375283	375294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77163874
96	NC_007484	TTGGCA	2	12	379530	379541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77163878
97	NC_007484	TCAGCA	2	12	382289	382300	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77163879
98	NC_007484	AAATTA	2	12	382810	382821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163880
99	NC_007484	AGTATA	2	12	384692	384703	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	77163881
100	NC_007484	ATTACC	2	12	385939	385950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163883
101	NC_007484	ATGCGG	2	12	386774	386785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77163883
102	NC_007484	GTGGAT	2	12	392205	392216	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77163889
103	NC_007484	TCAATG	2	12	393936	393947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	77163890
104	NC_007484	CGCCCA	2	12	396546	396557	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77163893
105	NC_007484	CAATGG	2	12	397719	397730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77163895
106	NC_007484	ATCCCG	2	12	398009	398020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163895
107	NC_007484	GCTGCC	2	12	404292	404303	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77163901
108	NC_007484	ATGTGG	2	12	406248	406259	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77163902
109	NC_007484	GGTGAC	2	12	407308	407319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77163902
110	NC_007484	AGGAAA	2	12	407511	407522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163902
111	NC_007484	AATGGG	2	12	408065	408076	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	77163902
112	NC_007484	GTTAAG	2	12	415747	415758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163908
113	NC_007484	AATCAG	2	12	417134	417145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	77163909
114	NC_007484	GCGGTG	2	12	417749	417760	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	77163909
115	NC_007484	CGCTTG	2	12	421448	421459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163911
116	NC_007484	GCCTTC	2	12	425299	425310	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77163914
117	NC_007484	CAACGC	3	18	426170	426187	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77163915
118	NC_007484	AGCGTA	2	12	427169	427180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77163916
119	NC_007484	TTAAAA	2	12	430159	430170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163920
120	NC_007484	TCCCCT	2	12	431481	431492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163921
121	NC_007484	ACTTTG	2	12	436207	436218	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	77163925
122	NC_007484	AATAAA	2	12	438784	438795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	77163926
123	NC_007484	GCCTTC	2	12	443286	443297	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77163931
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125	NC_007484	GCAATG	2	12	468865	468876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77163956
126	NC_007484	CCAGGG	2	12	469753	469764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77163957
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137	NC_007484	GCTATA	2	12	493016	493027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	77163986
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221	NC_007484	GAGAAG	2	12	762992	763003	50 %	0 %	50 %	0 %	77164226
222	NC_007484	GAAAGG	2	12	764404	764415	50 %	0 %	50 %	0 %	77164226
223	NC_007484	GAGAGC	2	12	766033	766044	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	77164226
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227	NC_007484	CTGGAT	2	12	785844	785855	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77164244
228	NC_007484	AATGGC	2	12	786315	786326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77164244
229	NC_007484	GATGGG	2	12	788261	788272	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	77164246
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231	NC_007484	TGGTAG	2	12	794145	794156	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77164251
232	NC_007484	ATATTT	2	12	796500	796511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77164253
233	NC_007484	AAAATT	2	12	808287	808298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77164263
234	NC_007484	AAGGTG	2	12	810192	810203	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	77164264
235	NC_007484	CACCGA	2	12	810707	810718	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77164264
236	NC_007484	TATCCT	2	12	816582	816593	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	77164267
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260	NC_007484	GCCTGA	2	12	885129	885140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77164330
261	NC_007484	TGGTGC	2	12	885687	885698	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	77164331
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263	NC_007484	CCTGTT	2	12	888528	888539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	77164333
264	NC_007484	GAACTG	2	12	889369	889380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77164334
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328	NC_007484	TCCTGG	2	12	1155373	1155384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77164561
329	NC_007484	ACCGCT	2	12	1158112	1158123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77164563
330	NC_007484	CCTCCC	2	12	1159062	1159073	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	77164564
331	NC_007484	AGATTA	2	12	1160473	1160484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	77164566
332	NC_007484	ATGAAG	2	12	1165938	1165949	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	77164573
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334	NC_007484	TTTTTG	2	12	1169210	1169221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	77164576
335	NC_007484	AATCAG	2	12	1173730	1173741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	77164578
336	NC_007484	TGAAGT	2	12	1175822	1175833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77164580
337	NC_007484	GCGTGG	2	12	1180453	1180464	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	77164583
338	NC_007484	GAAAAG	2	12	1180545	1180556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77164583
339	NC_007484	CGGTGG	2	12	1180788	1180799	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	77164583
340	NC_007484	TAGGCT	2	12	1181537	1181548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	77164585
341	NC_007484	GCCAGT	2	12	1182857	1182868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77164586
342	NC_007484	ACCACA	2	12	1185511	1185522	50 %	0 %	0 %	50 %	77164590
343	NC_007484	TGGTGA	2	12	1188810	1188821	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	77164593
344	NC_007484	TGACCA	2	12	1188909	1188920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77164593
345	NC_007484	GTTTTT	2	12	1189046	1189057	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	77164593
346	NC_007484	CAAGCG	2	12	1199818	1199829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77164603
347	NC_007484	TTGAAG	2	12	1200602	1200613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77164603
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459	NC_007484	TCCCTT	2	12	1536934	1536945	0 %	50 %	0 %	50 %	77164885
460	NC_007484	GGCGTT	2	12	1540800	1540811	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	77164888
461	NC_007484	CAGGTG	2	12	1547852	1547863	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77164894
462	NC_007484	GGTGTT	2	12	1551966	1551977	0 %	50 %	50 %	0 %	77164896
463	NC_007484	GCATGG	2	12	1557387	1557398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77164899
464	NC_007484	GGCGAT	2	12	1563695	1563706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77164902
465	NC_007484	AATAGC	2	12	1565839	1565850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	77164904
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467	NC_007484	CTGGCC	2	12	1579602	1579613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77164917
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481	NC_007484	AAAGTC	2	12	1635646	1635657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	77164966
482	NC_007484	GATGAC	2	12	1644552	1644563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77164975
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489	NC_007484	AGGGCC	2	12	1660012	1660023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77164988
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493	NC_007484	TTGAAG	2	12	1665949	1665960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77164992
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497	NC_007484	GCTCAA	2	12	1685744	1685755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	77165010
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