MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 8860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	GCAA	2	8	261	268	50 %	0 %	25 %	25 %	77163562
2	NC_007484	ATTG	2	8	316	323	25 %	50 %	25 %	0 %	77163562
3	NC_007484	AGGT	2	8	404	411	25 %	25 %	50 %	0 %	77163562
4	NC_007484	CAAT	2	8	558	565	50 %	25 %	0 %	25 %	77163562
5	NC_007484	ATGC	2	8	664	671	25 %	25 %	25 %	25 %	77163562
6	NC_007484	TAAT	2	8	1645	1652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007484	TTCA	2	8	2079	2086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007484	CTTG	2	8	2365	2372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007484	CTTC	2	8	2636	2643	0 %	50 %	0 %	50 %	77163563
10	NC_007484	ATTC	2	8	2687	2694	25 %	50 %	0 %	25 %	77163563
11	NC_007484	AGTA	2	8	3467	3474	50 %	25 %	25 %	0 %	77163563
12	NC_007484	GGAA	2	8	3533	3540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007484	TCGC	2	8	3658	3665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007484	CCAG	2	8	3673	3680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007484	CTTG	2	8	5539	5546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007484	AAAT	2	8	6008	6015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007484	CGGG	2	8	6111	6118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007484	AAGG	2	8	6555	6562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007484	GCTC	2	8	6616	6623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007484	ATAG	2	8	7081	7088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007484	TCCC	2	8	7313	7320	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_007484	TGGA	2	8	7742	7749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007484	TCAA	2	8	8088	8095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007484	ATTC	2	8	9327	9334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007484	GTTT	2	8	9443	9450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007484	TTCG	2	8	9725	9732	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007484	GCTC	2	8	9999	10006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007484	CGCT	2	8	10123	10130	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007484	GCCA	2	8	10791	10798	25 %	0 %	25 %	50 %	77163564
30	NC_007484	ACCC	2	8	10902	10909	25 %	0 %	0 %	75 %	77163564
31	NC_007484	GCTT	2	8	11010	11017	0 %	50 %	25 %	25 %	77163564
32	NC_007484	ATCT	2	8	11258	11265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007484	CATA	2	8	11275	11282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007484	ATTT	2	8	11448	11455	25 %	75 %	0 %	0 %	77163565
35	NC_007484	AATT	2	8	11488	11495	50 %	50 %	0 %	0 %	77163565
36	NC_007484	AACG	2	8	11782	11789	50 %	0 %	25 %	25 %	77163565
37	NC_007484	ACCA	2	8	11959	11966	50 %	0 %	0 %	50 %	77163565
38	NC_007484	TGGA	2	8	12109	12116	25 %	25 %	50 %	0 %	77163565
39	NC_007484	GTAT	2	8	12514	12521	25 %	50 %	25 %	0 %	77163566
40	NC_007484	ACGG	2	8	12664	12671	25 %	0 %	50 %	25 %	77163566
41	NC_007484	TGGC	2	8	13285	13292	0 %	25 %	50 %	25 %	77163566
42	NC_007484	GACT	2	8	13393	13400	25 %	25 %	25 %	25 %	77163566
43	NC_007484	GACG	2	8	13928	13935	25 %	0 %	50 %	25 %	77163566
44	NC_007484	ACGC	2	8	13958	13965	25 %	0 %	25 %	50 %	77163566
45	NC_007484	GCTA	2	8	14931	14938	25 %	25 %	25 %	25 %	77163567
46	NC_007484	GCTA	2	8	14959	14966	25 %	25 %	25 %	25 %	77163567
47	NC_007484	GTCA	2	8	15772	15779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007484	GCTT	2	8	15958	15965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007484	CTAG	2	8	16104	16111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007484	GAAC	2	8	16123	16130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007484	GTTA	2	8	16131	16138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007484	ATTT	2	8	16315	16322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007484	GCCT	2	8	16498	16505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007484	AGTA	2	8	17384	17391	50 %	25 %	25 %	0 %	77163568
55	NC_007484	GGGT	2	8	17568	17575	0 %	25 %	75 %	0 %	77163568
56	NC_007484	AATT	2	8	18153	18160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007484	GCGG	2	8	18780	18787	0 %	0 %	75 %	25 %	77163569
58	NC_007484	CATA	2	8	19398	19405	50 %	25 %	0 %	25 %	77163570
59	NC_007484	CGTC	2	8	19970	19977	0 %	25 %	25 %	50 %	77163570
60	NC_007484	CCGG	2	8	20327	20334	0 %	0 %	50 %	50 %	77163571
61	NC_007484	GGAT	2	8	20608	20615	25 %	25 %	50 %	0 %	77163571
62	NC_007484	AAAG	2	8	20741	20748	75 %	0 %	25 %	0 %	77163571
63	NC_007484	CAGC	2	8	20821	20828	25 %	0 %	25 %	50 %	77163571
64	NC_007484	TGGC	2	8	20878	20885	0 %	25 %	50 %	25 %	77163571
65	NC_007484	TTGA	2	8	21252	21259	25 %	50 %	25 %	0 %	77163571
66	NC_007484	CTGG	2	8	21309	21316	0 %	25 %	50 %	25 %	77163571
67	NC_007484	ATCG	2	8	21669	21676	25 %	25 %	25 %	25 %	77163571
68	NC_007484	CATG	2	8	21797	21804	25 %	25 %	25 %	25 %	77163571
69	NC_007484	CCGC	2	8	22256	22263	0 %	0 %	25 %	75 %	77163572
70	NC_007484	GCTT	2	8	22392	22399	0 %	50 %	25 %	25 %	77163572
71	NC_007484	CTGC	2	8	22564	22571	0 %	25 %	25 %	50 %	77163572
72	NC_007484	GGAA	2	8	23290	23297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007484	GCCT	2	8	23535	23542	0 %	25 %	25 %	50 %	77163573
74	NC_007484	CAAA	2	8	24235	24242	75 %	0 %	0 %	25 %	77163574
75	NC_007484	AGGC	2	8	25403	25410	25 %	0 %	50 %	25 %	77163574
76	NC_007484	CGGC	2	8	25939	25946	0 %	0 %	50 %	50 %	77163575
77	NC_007484	GTCC	2	8	26236	26243	0 %	25 %	25 %	50 %	77163575
78	NC_007484	TGCC	2	8	26432	26439	0 %	25 %	25 %	50 %	77163575
79	NC_007484	TCCT	2	8	26994	27001	0 %	50 %	0 %	50 %	77163575
80	NC_007484	TAGA	2	8	27285	27292	50 %	25 %	25 %	0 %	77163575
81	NC_007484	GATA	2	8	27644	27651	50 %	25 %	25 %	0 %	77163575
82	NC_007484	TCAA	2	8	28171	28178	50 %	25 %	0 %	25 %	77163576
83	NC_007484	AGCA	2	8	28320	28327	50 %	0 %	25 %	25 %	77163576
84	NC_007484	CTTT	2	8	28847	28854	0 %	75 %	0 %	25 %	77163577
85	NC_007484	CAGA	2	8	30087	30094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007484	TTTG	2	8	30153	30160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007484	TAAT	2	8	30248	30255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007484	TCGC	2	8	30592	30599	0 %	25 %	25 %	50 %	77163578
89	NC_007484	GTAA	2	8	31578	31585	50 %	25 %	25 %	0 %	77163578
90	NC_007484	CATC	2	8	31976	31983	25 %	25 %	0 %	50 %	77163578
91	NC_007484	ATAG	2	8	32176	32183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007484	ACTT	2	8	32186	32193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007484	ACCA	2	8	32708	32715	50 %	0 %	0 %	50 %	77163579
94	NC_007484	TTGC	2	8	32747	32754	0 %	50 %	25 %	25 %	77163579
95	NC_007484	ATCA	2	8	32828	32835	50 %	25 %	0 %	25 %	77163579
96	NC_007484	GCTT	2	8	33676	33683	0 %	50 %	25 %	25 %	77163580
97	NC_007484	ATTT	2	8	33712	33719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007484	TCTT	2	8	33834	33841	0 %	75 %	0 %	25 %	77163581
99	NC_007484	TAAT	2	8	34250	34257	50 %	50 %	0 %	0 %	77163582
100	NC_007484	TTAC	2	8	34435	34442	25 %	50 %	0 %	25 %	77163582
101	NC_007484	GGAG	2	8	35128	35135	25 %	0 %	75 %	0 %	77163582
102	NC_007484	GGCA	2	8	35238	35245	25 %	0 %	50 %	25 %	77163582
103	NC_007484	GGCA	2	8	35446	35453	25 %	0 %	50 %	25 %	77163583
104	NC_007484	CGTC	2	8	35465	35472	0 %	25 %	25 %	50 %	77163583
105	NC_007484	GGTA	2	8	35492	35499	25 %	25 %	50 %	0 %	77163583
106	NC_007484	AATT	2	8	36746	36753	50 %	50 %	0 %	0 %	77163584
107	NC_007484	TGCT	2	8	37353	37360	0 %	50 %	25 %	25 %	77163584
108	NC_007484	TTTG	2	8	37485	37492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007484	TCAG	2	8	38159	38166	25 %	25 %	25 %	25 %	77163586
110	NC_007484	GCTG	2	8	38284	38291	0 %	25 %	50 %	25 %	77163586
111	NC_007484	AGAC	2	8	38327	38334	50 %	0 %	25 %	25 %	77163586
112	NC_007484	TAAA	2	8	38398	38405	75 %	25 %	0 %	0 %	77163586
113	NC_007484	TTGG	2	8	39318	39325	0 %	50 %	50 %	0 %	77163588
114	NC_007484	TGTT	2	8	39363	39370	0 %	75 %	25 %	0 %	77163588
115	NC_007484	ATTT	2	8	40764	40771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007484	AATT	2	8	41445	41452	50 %	50 %	0 %	0 %	77163591
117	NC_007484	AAGC	2	8	41475	41482	50 %	0 %	25 %	25 %	77163591
118	NC_007484	CCCT	2	8	41897	41904	0 %	25 %	0 %	75 %	77163591
119	NC_007484	GGCG	2	8	42327	42334	0 %	0 %	75 %	25 %	77163591
120	NC_007484	TGGA	2	8	42525	42532	25 %	25 %	50 %	0 %	77163591
121	NC_007484	GAAA	2	8	42669	42676	75 %	0 %	25 %	0 %	77163591
122	NC_007484	TGAC	2	8	42951	42958	25 %	25 %	25 %	25 %	77163591
123	NC_007484	CCTT	2	8	43046	43053	0 %	50 %	0 %	50 %	77163591
124	NC_007484	TTGC	2	8	43076	43083	0 %	50 %	25 %	25 %	77163591
125	NC_007484	AAAT	2	8	43097	43104	75 %	25 %	0 %	0 %	77163591
126	NC_007484	GTCA	2	8	43237	43244	25 %	25 %	25 %	25 %	77163592
127	NC_007484	TATC	2	8	43284	43291	25 %	50 %	0 %	25 %	77163592
128	NC_007484	GATC	2	8	43328	43335	25 %	25 %	25 %	25 %	77163592
129	NC_007484	TGGA	2	8	43486	43493	25 %	25 %	50 %	0 %	77163592
130	NC_007484	GTAT	2	8	43522	43529	25 %	50 %	25 %	0 %	77163592
131	NC_007484	TAGA	2	8	43825	43832	50 %	25 %	25 %	0 %	77163592
132	NC_007484	AACC	2	8	44096	44103	50 %	0 %	0 %	50 %	77163592
133	NC_007484	CTAT	2	8	44259	44266	25 %	50 %	0 %	25 %	77163592
134	NC_007484	GGCA	2	8	44473	44480	25 %	0 %	50 %	25 %	77163592
135	NC_007484	TTCT	3	12	45227	45238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007484	ATTG	2	8	45850	45857	25 %	50 %	25 %	0 %	77163593
137	NC_007484	CTTT	2	8	46123	46130	0 %	75 %	0 %	25 %	77163593
138	NC_007484	AAGC	2	8	46400	46407	50 %	0 %	25 %	25 %	77163593
139	NC_007484	CCGC	2	8	46560	46567	0 %	0 %	25 %	75 %	77163593
140	NC_007484	AAGC	2	8	47108	47115	50 %	0 %	25 %	25 %	77163594
141	NC_007484	ATTA	2	8	47151	47158	50 %	50 %	0 %	0 %	77163594
142	NC_007484	ATTC	2	8	47380	47387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007484	AAAG	2	8	47737	47744	75 %	0 %	25 %	0 %	77163596
144	NC_007484	ATCC	2	8	48343	48350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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146	NC_007484	ACTC	2	8	49278	49285	25 %	25 %	0 %	50 %	77163598
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