MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 44843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	CTT	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007484	ACC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163562
3	NC_007484	ACA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163562
4	NC_007484	TAT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163562
5	NC_007484	AGC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163562
6	NC_007484	CTT	2	6	397	402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
7	NC_007484	CTT	2	6	476	481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
8	NC_007484	AGT	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
9	NC_007484	GCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163562
10	NC_007484	CGA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163562
11	NC_007484	AAT	2	6	909	914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163562
12	NC_007484	TGA	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
13	NC_007484	ATC	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163562
14	NC_007484	GTA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
15	NC_007484	TTC	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
16	NC_007484	GGT	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163562
17	NC_007484	TAC	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163562
18	NC_007484	TCG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163562
19	NC_007484	ATG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007484	CTT	2	6	1819	1824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007484	CGG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007484	GGA	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007484	ATA	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007484	ATC	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007484	AGC	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007484	AAT	2	6	2290	2295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007484	AAT	2	6	2342	2347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007484	AGA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
29	NC_007484	GTA	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163563
30	NC_007484	ACG	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163563
31	NC_007484	AGA	2	6	2581	2586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
32	NC_007484	AAG	2	6	2670	2675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
33	NC_007484	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163563
34	NC_007484	ATT	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
35	NC_007484	TCA	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163563
36	NC_007484	TAT	2	6	2865	2870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
37	NC_007484	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
38	NC_007484	CTT	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163563
39	NC_007484	TTG	2	6	3165	3170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163563
40	NC_007484	CTG	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163563
41	NC_007484	TAA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163563
42	NC_007484	ATT	2	6	3386	3391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
43	NC_007484	AAG	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
44	NC_007484	TAG	3	9	3427	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163563
45	NC_007484	TGT	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163563
46	NC_007484	GAC	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163563
47	NC_007484	AAG	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007484	TCA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007484	ACG	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007484	CGA	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007484	GCT	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007484	TTA	2	6	3852	3857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007484	CTT	2	6	3953	3958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007484	CAG	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007484	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007484	GCC	2	6	4294	4299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007484	TCA	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007484	CAA	2	6	4476	4481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007484	GCC	2	6	4484	4489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_007484	CTT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007484	GGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007484	CTC	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007484	CTT	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007484	AGC	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007484	CTT	2	6	4933	4938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007484	ATC	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007484	ACC	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007484	GGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007484	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007484	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007484	ACT	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007484	CAA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007484	AAG	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007484	ATT	3	9	5359	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007484	GCA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007484	CAG	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007484	GGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007484	GGC	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007484	GGA	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007484	AAG	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007484	GCC	2	6	6126	6131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007484	TCA	2	6	6161	6166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007484	CAG	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007484	CTT	2	6	6270	6275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007484	TTC	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007484	GCT	2	6	6437	6442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007484	CCG	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007484	CAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007484	CTG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007484	GGC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007484	TCA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007484	GAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007484	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007484	CAG	2	6	6879	6884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007484	GCC	2	6	6956	6961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007484	GAT	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007484	CCG	2	6	7025	7030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007484	CAC	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007484	GGC	2	6	7118	7123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007484	AAG	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007484	GTG	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007484	CTT	2	6	7199	7204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007484	ACC	2	6	7212	7217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007484	GTT	2	6	7283	7288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007484	TTC	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007484	TAG	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007484	CAG	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007484	CTT	2	6	7455	7460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007484	GAA	2	6	7502	7507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007484	GCC	2	6	7512	7517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007484	GCT	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007484	GCC	2	6	7656	7661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_007484	CTT	2	6	7733	7738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007484	TCC	2	6	7837	7842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007484	TGC	2	6	7890	7895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007484	GCA	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007484	GAG	2	6	7943	7948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007484	TGG	2	6	8007	8012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007484	TGA	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007484	TCG	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007484	ATC	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007484	AAC	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007484	CCA	2	6	8224	8229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_007484	CGG	2	6	8301	8306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007484	CGG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007484	TTG	2	6	8339	8344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007484	GAT	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007484	ACC	2	6	8588	8593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007484	GCG	2	6	8642	8647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007484	CAT	2	6	8706	8711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007484	CTC	2	6	8805	8810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007484	AAC	2	6	9198	9203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007484	CCA	2	6	9269	9274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007484	TCT	2	6	9275	9280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007484	TAT	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007484	TCC	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007484	TGG	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007484	GAT	2	6	9404	9409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007484	AGA	2	6	9433	9438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007484	GCT	2	6	9533	9538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007484	GGC	2	6	9799	9804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_007484	CTT	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007484	TAA	2	6	10230	10235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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