MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	AGAGG	2	10	84	93	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007483	GCTCT	2	10	1762	1771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007483	AATTT	2	10	2556	2565	40 %	60 %	0 %	0 %	77163520
4	NC_007483	TCTTA	2	10	2586	2595	20 %	60 %	0 %	20 %	77163521
5	NC_007483	CCAGA	2	10	2875	2884	40 %	0 %	20 %	40 %	77163522
6	NC_007483	GGCGA	2	10	3499	3508	20 %	0 %	60 %	20 %	77163522
7	NC_007483	CACGC	2	10	3724	3733	20 %	0 %	20 %	60 %	77163522
8	NC_007483	GAAAC	2	10	3795	3804	60 %	0 %	20 %	20 %	77163522
9	NC_007483	AGCAC	2	10	4149	4158	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007483	GCGCC	2	10	4220	4229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_007483	TACTC	2	10	5176	5185	20 %	40 %	0 %	40 %	77163524
12	NC_007483	GCTGA	2	10	7144	7153	20 %	20 %	40 %	20 %	77163526
13	NC_007483	GATTC	2	10	7583	7592	20 %	40 %	20 %	20 %	77163527
14	NC_007483	TGTTC	2	10	9096	9105	0 %	60 %	20 %	20 %	77163529
15	NC_007483	ATCCG	2	10	10831	10840	20 %	20 %	20 %	40 %	77163531
16	NC_007483	TTTGA	2	10	11971	11980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007483	CAGGG	2	10	12842	12851	20 %	0 %	60 %	20 %	77163532
18	NC_007483	TTAAT	2	10	13710	13719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007483	AACAA	2	10	13909	13918	80 %	0 %	0 %	20 %	77163534
20	NC_007483	AGAAC	2	10	16615	16624	60 %	0 %	20 %	20 %	77163536
21	NC_007483	GTTTC	2	10	19275	19284	0 %	60 %	20 %	20 %	77163539
22	NC_007483	TTCGA	2	10	19716	19725	20 %	40 %	20 %	20 %	77163540
23	NC_007483	CAGCT	2	10	19917	19926	20 %	20 %	20 %	40 %	77163540
24	NC_007483	AAGAG	2	10	20359	20368	60 %	0 %	40 %	0 %	77163540
25	NC_007483	GAAGA	2	10	20717	20726	60 %	0 %	40 %	0 %	77163541
26	NC_007483	CGGAG	2	10	21297	21306	20 %	0 %	60 %	20 %	77163542
27	NC_007483	CTCAA	2	10	23971	23980	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007483	AACGT	2	10	24150	24159	40 %	20 %	20 %	20 %	77163545
29	NC_007483	CACTG	2	10	24325	24334	20 %	20 %	20 %	40 %	77163545
30	NC_007483	CACGC	2	10	27158	27167	20 %	0 %	20 %	60 %	77163546
31	NC_007483	GGCGA	2	10	29044	29053	20 %	0 %	60 %	20 %	77163547
32	NC_007483	GCTCC	2	10	29469	29478	0 %	20 %	20 %	60 %	77163547
33	NC_007483	GGGCG	2	10	35806	35815	0 %	0 %	80 %	20 %	77163553
34	NC_007483	TATTC	2	10	37807	37816	20 %	60 %	0 %	20 %	77163556
35	NC_007483	TATTC	2	10	37856	37865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007483	AAGCC	2	10	38267	38276	40 %	0 %	20 %	40 %	77163557

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.