MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	TCTT	2	8	37	44	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007483	AAAG	2	8	1706	1713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007483	ATTA	2	8	1789	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007483	AAGA	2	8	2055	2062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007483	AATC	2	8	2134	2141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007483	ATTT	2	8	4468	4475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007483	GGAA	2	8	9603	9610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007483	GTTG	2	8	16766	16773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007483	AGCA	2	8	19070	19077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007483	AAAC	2	8	19102	19109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007483	AGCC	2	8	23649	23656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007483	ACGG	2	8	23711	23718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007483	GCTT	2	8	30419	30426	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007483	TCAG	2	8	30487	30494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007483	TTGG	2	8	30506	30513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007483	CGGA	2	8	31963	31970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007483	AAAG	2	8	32048	32055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007483	TTGC	2	8	32177	32184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007483	CGGC	2	8	32265	32272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007483	TTTA	2	8	36616	36623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007483	CCTT	2	8	36993	37000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007483	AGGA	2	8	37031	37038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.