MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	TGCT	2	8	869	876	0 %	50 %	25 %	25 %	77163518
2	NC_007483	TCGG	2	8	886	893	0 %	25 %	50 %	25 %	77163518
3	NC_007483	ATAC	2	8	1421	1428	50 %	25 %	0 %	25 %	77163519
4	NC_007483	CAGC	2	8	1519	1526	25 %	0 %	25 %	50 %	77163519
5	NC_007483	TTCC	2	8	2419	2426	0 %	50 %	0 %	50 %	77163520
6	NC_007483	GCCA	2	8	2505	2512	25 %	0 %	25 %	50 %	77163520
7	NC_007483	GCCA	2	8	3351	3358	25 %	0 %	25 %	50 %	77163522
8	NC_007483	AGCG	2	8	3406	3413	25 %	0 %	50 %	25 %	77163522
9	NC_007483	AACA	2	8	3674	3681	75 %	0 %	0 %	25 %	77163522
10	NC_007483	GCAA	2	8	3963	3970	50 %	0 %	25 %	25 %	77163522
11	NC_007483	GGAG	2	8	5102	5109	25 %	0 %	75 %	0 %	77163524
12	NC_007483	AGCT	2	8	5900	5907	25 %	25 %	25 %	25 %	77163525
13	NC_007483	CGAT	2	8	5937	5944	25 %	25 %	25 %	25 %	77163525
14	NC_007483	CGGT	2	8	5972	5979	0 %	25 %	50 %	25 %	77163525
15	NC_007483	TCTG	2	8	6264	6271	0 %	50 %	25 %	25 %	77163525
16	NC_007483	GGCA	2	8	7387	7394	25 %	0 %	50 %	25 %	77163527
17	NC_007483	GCCG	2	8	8441	8448	0 %	0 %	50 %	50 %	77163528
18	NC_007483	ACCC	2	8	9084	9091	25 %	0 %	0 %	75 %	77163529
19	NC_007483	TCCT	2	8	10112	10119	0 %	50 %	0 %	50 %	77163530
20	NC_007483	TTGA	2	8	10958	10965	25 %	50 %	25 %	0 %	77163531
21	NC_007483	GTAA	2	8	11054	11061	50 %	25 %	25 %	0 %	77163531
22	NC_007483	AGAT	2	8	11424	11431	50 %	25 %	25 %	0 %	77163531
23	NC_007483	ATTA	2	8	11434	11441	50 %	50 %	0 %	0 %	77163531
24	NC_007483	GGCG	2	8	11462	11469	0 %	0 %	75 %	25 %	77163531
25	NC_007483	GGCA	2	8	12219	12226	25 %	0 %	50 %	25 %	77163532
26	NC_007483	GCTG	2	8	12318	12325	0 %	25 %	50 %	25 %	77163532
27	NC_007483	ATCT	2	8	12497	12504	25 %	50 %	0 %	25 %	77163532
28	NC_007483	GAAG	2	8	12550	12557	50 %	0 %	50 %	0 %	77163532
29	NC_007483	CGGG	2	8	12941	12948	0 %	0 %	75 %	25 %	77163532
30	NC_007483	TATC	2	8	13832	13839	25 %	50 %	0 %	25 %	77163534
31	NC_007483	GGGC	2	8	13964	13971	0 %	0 %	75 %	25 %	77163534
32	NC_007483	CTCG	2	8	14391	14398	0 %	25 %	25 %	50 %	77163534
33	NC_007483	GGGC	2	8	15566	15573	0 %	0 %	75 %	25 %	77163536
34	NC_007483	CATG	2	8	15718	15725	25 %	25 %	25 %	25 %	77163536
35	NC_007483	GATG	2	8	16429	16436	25 %	25 %	50 %	0 %	77163536
36	NC_007483	CCAG	2	8	17045	17052	25 %	0 %	25 %	50 %	77163537
37	NC_007483	CCTG	2	8	17085	17092	0 %	25 %	25 %	50 %	77163537
38	NC_007483	GCAC	2	8	17225	17232	25 %	0 %	25 %	50 %	77163537
39	NC_007483	GCAC	2	8	17510	17517	25 %	0 %	25 %	50 %	77163537
40	NC_007483	TTCG	2	8	17890	17897	0 %	50 %	25 %	25 %	77163537
41	NC_007483	TCAA	2	8	18751	18758	50 %	25 %	0 %	25 %	77163538
42	NC_007483	TCAG	2	8	19424	19431	25 %	25 %	25 %	25 %	77163539
43	NC_007483	ATGA	2	8	19599	19606	50 %	25 %	25 %	0 %	77163540
44	NC_007483	ATCA	2	8	20448	20455	50 %	25 %	0 %	25 %	77163540
45	NC_007483	TGGG	2	8	20585	20592	0 %	25 %	75 %	0 %	77163541
46	NC_007483	ACCG	2	8	21491	21498	25 %	0 %	25 %	50 %	77163542
47	NC_007483	AATC	2	8	21649	21656	50 %	25 %	0 %	25 %	77163542
48	NC_007483	TATC	2	8	21704	21711	25 %	50 %	0 %	25 %	77163542
49	NC_007483	TGAT	2	8	22323	22330	25 %	50 %	25 %	0 %	77163543
50	NC_007483	TGAT	2	8	22737	22744	25 %	50 %	25 %	0 %	77163543
51	NC_007483	CCTT	2	8	22906	22913	0 %	50 %	0 %	50 %	77163543
52	NC_007483	GCGA	2	8	24705	24712	25 %	0 %	50 %	25 %	77163545
53	NC_007483	GGAT	2	8	25371	25378	25 %	25 %	50 %	0 %	77163545
54	NC_007483	GCTG	2	8	25747	25754	0 %	25 %	50 %	25 %	77163545
55	NC_007483	TGGT	2	8	26057	26064	0 %	50 %	50 %	0 %	77163545
56	NC_007483	CGAG	2	8	26107	26114	25 %	0 %	50 %	25 %	77163545
57	NC_007483	CAGT	2	8	26866	26873	25 %	25 %	25 %	25 %	77163546
58	NC_007483	CCGA	2	8	27131	27138	25 %	0 %	25 %	50 %	77163546
59	NC_007483	AAGG	2	8	27782	27789	50 %	0 %	50 %	0 %	77163546
60	NC_007483	CGAT	2	8	27836	27843	25 %	25 %	25 %	25 %	77163546
61	NC_007483	GCCG	2	8	28429	28436	0 %	0 %	50 %	50 %	77163546
62	NC_007483	ATCA	2	8	28565	28572	50 %	25 %	0 %	25 %	77163546
63	NC_007483	CGCT	2	8	29788	29795	0 %	25 %	25 %	50 %	77163547
64	NC_007483	GGAT	2	8	30125	30132	25 %	25 %	50 %	0 %	77163547
65	NC_007483	GGCG	2	8	31281	31288	0 %	0 %	75 %	25 %	77163548
66	NC_007483	TACA	2	8	32714	32721	50 %	25 %	0 %	25 %	77163549
67	NC_007483	AGCC	2	8	32913	32920	25 %	0 %	25 %	50 %	77163549
68	NC_007483	CAAT	2	8	33058	33065	50 %	25 %	0 %	25 %	77163549
69	NC_007483	AAGG	2	8	33500	33507	50 %	0 %	50 %	0 %	77163549
70	NC_007483	CGGC	2	8	33786	33793	0 %	0 %	50 %	50 %	77163550
71	NC_007483	TGAT	2	8	33942	33949	25 %	50 %	25 %	0 %	77163550
72	NC_007483	TGGG	2	8	34002	34009	0 %	25 %	75 %	0 %	77163550
73	NC_007483	CCAA	2	8	34808	34815	50 %	0 %	0 %	50 %	77163552
74	NC_007483	CGCC	2	8	35694	35701	0 %	0 %	25 %	75 %	77163553
75	NC_007483	GTCG	2	8	36447	36454	0 %	25 %	50 %	25 %	77163555
76	NC_007483	ACTT	2	8	37287	37294	25 %	50 %	0 %	25 %	77163556
77	NC_007483	TAAA	2	8	37308	37315	75 %	25 %	0 %	0 %	77163556
78	NC_007483	ATTT	2	8	38211	38218	25 %	75 %	0 %	0 %	77163557
79	NC_007483	GGGC	2	8	39251	39258	0 %	0 %	75 %	25 %	77163559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.