MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	GTG	2	6	371	376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163518
2	NC_007483	GCC	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
3	NC_007483	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
4	NC_007483	GCC	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
5	NC_007483	CAT	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163518
6	NC_007483	CCA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163518
7	NC_007483	GTA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163518
8	NC_007483	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
9	NC_007483	GCC	2	6	1180	1185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
10	NC_007483	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163519
11	NC_007483	TCA	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163519
12	NC_007483	CCT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
13	NC_007483	GCC	2	6	1468	1473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
14	NC_007483	CCT	3	9	1574	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
15	NC_007483	TTG	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
16	NC_007483	GTT	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
17	NC_007483	CCA	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163520
18	NC_007483	CCT	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163522
19	NC_007483	CGG	2	6	2925	2930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
20	NC_007483	AAC	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
21	NC_007483	ACC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
22	NC_007483	ACT	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163522
23	NC_007483	GAA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
24	NC_007483	ACC	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
25	NC_007483	ACC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
26	NC_007483	CGG	2	6	3234	3239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
27	NC_007483	GGC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
28	NC_007483	GCA	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
29	NC_007483	GCA	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
30	NC_007483	GCA	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
31	NC_007483	ACC	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
32	NC_007483	AGC	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
33	NC_007483	GGC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
34	NC_007483	ACC	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
35	NC_007483	GAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
36	NC_007483	AAC	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
37	NC_007483	AGG	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163522
38	NC_007483	CGG	2	6	3913	3918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
39	NC_007483	CGG	2	6	3927	3932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
40	NC_007483	GCC	2	6	3999	4004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163522
41	NC_007483	ACT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163523
42	NC_007483	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163523
43	NC_007483	CGC	2	6	4736	4741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163523
44	NC_007483	ATA	2	6	4913	4918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163524
45	NC_007483	TGC	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
46	NC_007483	CCT	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163524
47	NC_007483	AGC	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163524
48	NC_007483	CTG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
49	NC_007483	TGA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163524
50	NC_007483	GAG	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163524
51	NC_007483	CCG	2	6	5490	5495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
52	NC_007483	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163525
53	NC_007483	AAT	2	6	5768	5773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
54	NC_007483	CAC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
55	NC_007483	ACC	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
56	NC_007483	TCA	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163525
57	NC_007483	GCT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
58	NC_007483	TGC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
59	NC_007483	GCC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
60	NC_007483	CTT	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163525
61	NC_007483	CCT	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163525
62	NC_007483	CCG	2	6	6532	6537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
63	NC_007483	TAA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
64	NC_007483	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
65	NC_007483	AAC	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163526
66	NC_007483	CAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
67	NC_007483	CAG	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
68	NC_007483	GCT	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
69	NC_007483	GTC	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
70	NC_007483	CTC	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
71	NC_007483	CCT	3	9	7178	7186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
72	NC_007483	CGC	2	6	7197	7202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163526
73	NC_007483	TGA	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163526
74	NC_007483	TGG	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163527
75	NC_007483	TGA	2	6	7435	7440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163527
76	NC_007483	CGG	2	6	7640	7645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163527
77	NC_007483	GAA	2	6	7661	7666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163527
78	NC_007483	AGG	2	6	7669	7674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163527
79	NC_007483	ACG	2	6	7708	7713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163527
80	NC_007483	GTG	2	6	7796	7801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163527
81	NC_007483	GCT	2	6	7909	7914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163527
82	NC_007483	GGA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163527
83	NC_007483	TTA	2	6	8205	8210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163528
84	NC_007483	CTG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163528
85	NC_007483	CTT	2	6	8333	8338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163528
86	NC_007483	AGC	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163528
87	NC_007483	CCA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163528
88	NC_007483	AGT	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163528
89	NC_007483	CGG	2	6	8544	8549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163528
90	NC_007483	AGC	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163528
91	NC_007483	TTG	2	6	8618	8623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163528
92	NC_007483	GAA	2	6	8677	8682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163528
93	NC_007483	GGA	2	6	8857	8862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163528
94	NC_007483	ATT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163528
95	NC_007483	GAT	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163529
96	NC_007483	AAG	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163529
97	NC_007483	GCT	2	6	8991	8996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163529
98	NC_007483	CTT	2	6	9023	9028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163529
99	NC_007483	CTT	2	6	9062	9067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163529
100	NC_007483	ATA	2	6	9268	9273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163529
101	NC_007483	CGA	2	6	9524	9529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163529
102	NC_007483	GGT	2	6	9918	9923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163530
103	NC_007483	CAG	2	6	9946	9951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
104	NC_007483	AGC	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
105	NC_007483	GGT	2	6	10072	10077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163530
106	NC_007483	GCT	2	6	10254	10259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163530
107	NC_007483	TAC	2	6	10275	10280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163530
108	NC_007483	GAC	2	6	10367	10372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
109	NC_007483	ATC	2	6	10393	10398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163530
110	NC_007483	GCA	2	6	10508	10513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
111	NC_007483	CTC	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163530
112	NC_007483	GCG	2	6	10576	10581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163530
113	NC_007483	ATC	2	6	10604	10609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163530
114	NC_007483	CAT	2	6	10699	10704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163531
115	NC_007483	GCC	2	6	10784	10789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163531
116	NC_007483	TGG	3	9	10860	10868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163531
117	NC_007483	TGA	2	6	10945	10950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163531
118	NC_007483	GAA	2	6	10997	11002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163531
119	NC_007483	GCC	2	6	11028	11033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163531
120	NC_007483	GAA	2	6	11231	11236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163531
121	NC_007483	CTT	2	6	11304	11309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163531
122	NC_007483	CTG	2	6	11331	11336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163531
123	NC_007483	CTC	2	6	11370	11375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163531
124	NC_007483	GAA	2	6	11453	11458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163531
125	NC_007483	CGC	2	6	12428	12433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163532
126	NC_007483	GAA	2	6	12469	12474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163532
127	NC_007483	TGG	2	6	12480	12485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163532
128	NC_007483	CAA	2	6	12560	12565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163532
129	NC_007483	ATG	2	6	12657	12662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163532
130	NC_007483	TGA	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163532
131	NC_007483	ATC	2	6	12767	12772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163532
132	NC_007483	GCG	2	6	12908	12913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163532
133	NC_007483	GCG	2	6	12925	12930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163532
134	NC_007483	CTA	2	6	13001	13006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163532
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137	NC_007483	GAG	2	6	13091	13096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163532
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253	NC_007483	TGG	2	6	24300	24305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163545
254	NC_007483	GAA	2	6	24440	24445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163545
255	NC_007483	GCC	3	9	24461	24469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163545
256	NC_007483	GGC	2	6	24477	24482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163545
257	NC_007483	AGC	2	6	24525	24530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163545
258	NC_007483	CTA	2	6	24665	24670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163545
259	NC_007483	AGC	2	6	24672	24677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163545
260	NC_007483	CGG	2	6	24714	24719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163545
261	NC_007483	CGG	2	6	24757	24762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163545
262	NC_007483	ACA	2	6	24774	24779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163545
263	NC_007483	GAT	3	9	24814	24822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163545
264	NC_007483	GTA	2	6	24887	24892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163545
265	NC_007483	CAT	2	6	24943	24948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163545
266	NC_007483	ACT	2	6	25030	25035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163545
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271	NC_007483	CGA	2	6	25474	25479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163545
272	NC_007483	CTG	2	6	25537	25542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163545
273	NC_007483	CGC	2	6	25585	25590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163545
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275	NC_007483	GTT	2	6	25645	25650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163545
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280	NC_007483	TGT	2	6	25855	25860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163545
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285	NC_007483	TAA	2	6	26200	26205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163545
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287	NC_007483	CTA	2	6	26292	26297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163545
288	NC_007483	TGG	2	6	26379	26384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163545
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291	NC_007483	CCA	2	6	26584	26589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163545
292	NC_007483	CTG	2	6	26663	26668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163545
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300	NC_007483	CGC	2	6	27346	27351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163546
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383	NC_007483	TGA	2	6	35018	35023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163552
384	NC_007483	CCG	2	6	35186	35191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163553
385	NC_007483	TCC	2	6	35314	35319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163553
386	NC_007483	CCT	2	6	35469	35474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163553
387	NC_007483	GCT	2	6	35493	35498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163553
388	NC_007483	TCC	2	6	35627	35632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163553
389	NC_007483	GTA	2	6	35702	35707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163553
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391	NC_007483	CAG	2	6	35785	35790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163553
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398	NC_007483	TCT	2	6	36265	36270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163555
399	NC_007483	GGC	2	6	36339	36344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163555
400	NC_007483	TCT	2	6	36350	36355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163555
401	NC_007483	CTA	2	6	36366	36371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163555
402	NC_007483	AGG	2	6	36422	36427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163555
403	NC_007483	GAA	2	6	36434	36439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163555
404	NC_007483	GGC	2	6	36514	36519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163555
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413	NC_007483	TGG	2	6	37247	37252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163556
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418	NC_007483	TAA	2	6	37655	37660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163556
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420	NC_007483	ACC	2	6	37765	37770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163556
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.