MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	CG	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007483	CT	3	6	26	31	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007483	AT	3	6	1993	1998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007483	AT	3	6	2101	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007483	CT	3	6	2572	2577	0 %	50 %	0 %	50 %	77163521
6	NC_007483	CG	3	6	3014	3019	0 %	0 %	50 %	50 %	77163522
7	NC_007483	AC	3	6	3643	3648	50 %	0 %	0 %	50 %	77163522
8	NC_007483	GC	3	6	3900	3905	0 %	0 %	50 %	50 %	77163522
9	NC_007483	GA	3	6	4530	4535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007483	TA	3	6	6744	6749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007483	AG	3	6	6752	6757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007483	AG	3	6	6774	6779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007483	AG	3	6	7110	7115	50 %	0 %	50 %	0 %	77163526
14	NC_007483	AT	3	6	7303	7308	50 %	50 %	0 %	0 %	77163527
15	NC_007483	TC	3	6	8590	8595	0 %	50 %	0 %	50 %	77163528
16	NC_007483	CT	3	6	9940	9945	0 %	50 %	0 %	50 %	77163530
17	NC_007483	AC	3	6	10041	10046	50 %	0 %	0 %	50 %	77163530
18	NC_007483	TC	3	6	10317	10322	0 %	50 %	0 %	50 %	77163530
19	NC_007483	CT	4	8	11732	11739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007483	TA	3	6	12012	12017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007483	AC	3	6	13704	13709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007483	GC	3	6	14788	14793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007483	CG	3	6	17069	17074	0 %	0 %	50 %	50 %	77163537
24	NC_007483	TC	3	6	18981	18986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007483	AT	3	6	21105	21110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007483	TA	3	6	21125	21130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007483	GC	3	6	21892	21897	0 %	0 %	50 %	50 %	77163542
28	NC_007483	AT	3	6	21901	21906	50 %	50 %	0 %	0 %	77163542
29	NC_007483	CG	3	6	22610	22615	0 %	0 %	50 %	50 %	77163543
30	NC_007483	AG	3	6	23353	23358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007483	CT	3	6	23783	23788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007483	GT	3	6	23932	23937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007483	AT	3	6	25415	25420	50 %	50 %	0 %	0 %	77163545
34	NC_007483	GA	3	6	25458	25463	50 %	0 %	50 %	0 %	77163545
35	NC_007483	CT	3	6	25606	25611	0 %	50 %	0 %	50 %	77163545
36	NC_007483	AC	3	6	28410	28415	50 %	0 %	0 %	50 %	77163546
37	NC_007483	TC	3	6	28603	28608	0 %	50 %	0 %	50 %	77163546
38	NC_007483	GC	3	6	29168	29173	0 %	0 %	50 %	50 %	77163547
39	NC_007483	AC	3	6	30404	30409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007483	GT	3	6	30974	30979	0 %	50 %	50 %	0 %	77163548
41	NC_007483	TG	3	6	31326	31331	0 %	50 %	50 %	0 %	77163548
42	NC_007483	GC	3	6	31479	31484	0 %	0 %	50 %	50 %	77163548
43	NC_007483	TC	3	6	32485	32490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007483	CA	3	6	32559	32564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007483	GC	3	6	34221	34226	0 %	0 %	50 %	50 %	77163551
46	NC_007483	TA	3	6	34290	34295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007483	GC	3	6	36120	36125	0 %	0 %	50 %	50 %	77163554
48	NC_007483	GC	3	6	36548	36553	0 %	0 %	50 %	50 %	77163555
49	NC_007483	GA	3	6	36889	36894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007483	GA	3	6	36905	36910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007483	AG	3	6	36949	36954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007483	GC	3	6	37424	37429	0 %	0 %	50 %	50 %	77163556
53	NC_007483	AG	3	6	37625	37630	50 %	0 %	50 %	0 %	77163556
54	NC_007483	GT	3	6	37967	37972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007483	AC	3	6	38255	38260	50 %	0 %	0 %	50 %	77163557
56	NC_007483	AC	3	6	38365	38370	50 %	0 %	0 %	50 %	77163557
57	NC_007483	TA	3	6	39434	39439	50 %	50 %	0 %	0 %	77163559
58	NC_007483	GC	3	6	39802	39807	0 %	0 %	50 %	50 %	77163560
59	NC_007483	GC	3	6	39855	39860	0 %	0 %	50 %	50 %	77163560

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.