MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007432	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	76787564
2	NC_007432	TGCTTA	2	12	9003	9014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	76788164
3	NC_007432	AGAAAA	2	12	10766	10777	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	76786916
4	NC_007432	GTATTG	2	12	12229	12240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	76788050
5	NC_007432	GGCGGT	2	12	14405	14416	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	76787819
6	NC_007432	GAAAGA	2	12	15251	15262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787819
7	NC_007432	ATGAAG	2	12	15985	15996	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007432	TAAGGA	2	12	17949	17960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007432	ACTAAT	2	12	21101	21112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007432	TAAGGA	2	12	23781	23792	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007432	ACTAAT	2	12	26933	26944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007432	ATTAAT	2	12	28561	28572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007432	CTACAG	2	12	29736	29747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	76788285
14	NC_007432	AGGTCA	2	12	36905	36916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	76787165
15	NC_007432	GCAGAA	2	12	36952	36963	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	76787165
16	NC_007432	ACTGAG	2	12	37201	37212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	76787165
17	NC_007432	CAGGCG	2	12	37655	37666	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	76787165
18	NC_007432	TGATGC	2	12	45300	45311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76787816
19	NC_007432	AATGAA	2	12	47330	47341	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	76788047
20	NC_007432	CAAATA	2	12	48526	48537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	76788047
21	NC_007432	ATCAAA	2	12	49596	49607	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007432	TTTTTG	2	12	51110	51121	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	76786863
23	NC_007432	ATTTAG	2	12	52823	52834	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76787046
24	NC_007432	AGGTAG	2	12	53033	53044	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	76787046
25	NC_007432	ACCAAA	2	12	55981	55992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787295
26	NC_007432	CTTTGC	2	12	58389	58400	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	76788387
27	NC_007432	GAACTT	2	12	61980	61991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	76786991
28	NC_007432	ATATTT	2	12	64218	64229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788347
29	NC_007432	CGTACC	2	12	65869	65880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	76787346
30	NC_007432	GGTAAA	2	12	66704	66715	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	76788486
31	NC_007432	CAGTAT	2	12	74085	74096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	76787737
32	NC_007432	AAAGGT	2	12	76747	76758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	76786764
33	NC_007432	CGCAAT	2	12	79328	79339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	76787677
34	NC_007432	ATTGAA	2	12	79740	79751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	76787747
35	NC_007432	ACATCA	2	12	79876	79887	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	76787747
36	NC_007432	ATCGTT	2	12	82417	82428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	76787491
37	NC_007432	TAAAGG	2	12	83833	83844	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	76788281
38	NC_007432	ATAAAA	2	12	84016	84027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	76787371
39	NC_007432	TTTCTG	2	12	84847	84858	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	76786980
40	NC_007432	AAATTA	2	12	84891	84902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788098
41	NC_007432	ATTGAA	2	12	87820	87831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	76788620
42	NC_007432	GTAAAG	2	12	88505	88516	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	76788115
43	NC_007432	TAAGGA	2	12	92470	92481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007432	ACTAAT	2	12	95624	95635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007432	TTCGGG	2	12	96749	96760	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007432	TTTTCT	2	12	102594	102605	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	76788143
47	NC_007432	TTTTGA	2	12	103544	103555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	76787247
48	NC_007432	ACTGAA	2	12	104390	104401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	76788374
49	NC_007432	AACTCA	2	12	105793	105804	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	76787993
50	NC_007432	TTGTCA	2	12	105950	105961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	76787993
51	NC_007432	GATATT	2	12	109979	109990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76787537
52	NC_007432	TAACGA	2	12	113026	113037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	76788055
53	NC_007432	TGACCT	2	12	115817	115828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	76788516
54	NC_007432	CACCGT	2	12	116991	117002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	76788516
55	NC_007432	TAGCTG	2	12	120158	120169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76787306
56	NC_007432	GAGGAA	2	12	121795	121806	50 %	0 %	50 %	0 %	76787855
57	NC_007432	CAATGG	2	12	122426	122437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	76787855
58	NC_007432	GTGTTT	2	12	123982	123993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76786755
59	NC_007432	GCTTTT	2	12	126236	126247	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	76787221
60	NC_007432	TCAGGT	2	12	132896	132907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76786743
61	NC_007432	CAAAGA	2	12	132998	133009	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	76786743
62	NC_007432	TAGTAT	2	12	134348	134359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76788019
63	NC_007432	GTTAAC	2	12	138797	138808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	76788266
64	NC_007432	GTTCAT	2	12	141781	141792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	76787815
65	NC_007432	GTTGAA	2	12	141898	141909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787815
66	NC_007432	ACAAAA	2	12	142951	142962	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	76786719
67	NC_007432	CAGAAG	2	12	143339	143350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	76786719
68	NC_007432	TCTAAT	2	12	148730	148741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	76787028
69	NC_007432	CAACAT	2	12	149537	149548	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	76786756
70	NC_007432	TGTTAT	2	12	151938	151949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007432	TTAAAA	2	12	153309	153320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007432	TTGATA	2	12	154475	154486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76788643
73	NC_007432	TTTGAT	2	12	159306	159317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	76788324
74	NC_007432	TTTAGA	2	12	163428	163439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76788148
75	NC_007432	TTTCTA	2	12	164124	164135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	76788148
76	NC_007432	TTAAAT	2	12	164711	164722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007432	TTTGGT	2	12	166387	166398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787492
78	NC_007432	TCTGTT	2	12	167111	167122	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	76787492
79	NC_007432	AAATCA	2	12	174204	174215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	76788337
80	NC_007432	GACAAC	2	12	174304	174315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	76788337
81	NC_007432	TAAGGA	2	12	176715	176726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007432	ACTAAT	2	12	179869	179880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007432	ATAATG	2	12	180495	180506	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	76787631
84	NC_007432	TATTGC	2	12	182942	182953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	76788538
85	NC_007432	TAAACC	2	12	184445	184456	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	76787832
86	NC_007432	CTTGTT	2	12	189123	189134	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007432	TACGGT	2	12	193390	193401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76787132
88	NC_007432	GTGAAG	2	12	194435	194446	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	76787132
89	NC_007432	TTATTT	2	12	199029	199040	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	76787546
90	NC_007432	GTGTAT	2	12	202408	202419	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	76787553
91	NC_007432	TATTAG	2	12	203665	203676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76787807
92	NC_007432	GCTTGT	2	12	205889	205900	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	76786747
93	NC_007432	CAGTTT	2	12	208898	208909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	76788097
94	NC_007432	GCTTTG	2	12	210654	210665	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	76786750
95	NC_007432	TGGTAG	2	12	213757	213768	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	76787634
96	NC_007432	TCAAAA	2	12	214913	214924	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	76786926
97	NC_007432	AGCTAA	2	12	215876	215887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	76786926
98	NC_007432	GTCATG	2	12	216406	216417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76786926
99	NC_007432	AAGGTA	2	12	220212	220223	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	76788255
100	NC_007432	GTTGAA	2	12	226320	226331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788289
101	NC_007432	AAATCA	2	12	227124	227135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	76787609
102	NC_007432	ATTGAT	2	12	233532	233543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76788173
103	NC_007432	AAATAA	2	12	238591	238602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007432	GCACAA	2	12	240829	240840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	76786886
105	NC_007432	AAAATG	2	12	245146	245157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007432	AGACTA	2	12	246078	246089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	76788061
107	NC_007432	AGCTAA	2	12	251837	251848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	76787353
108	NC_007432	ATGTGA	2	12	254166	254177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787889
109	NC_007432	AGGATT	2	12	255876	255887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787142
110	NC_007432	TTCCAA	2	12	257958	257969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787109
111	NC_007432	TAAGGA	2	12	261304	261315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007432	ACTAAT	2	12	264456	264467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007432	TTCGGG	2	12	265341	265352	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007432	AGCAGA	2	12	269411	269422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	76787594
115	NC_007432	TTCTTT	2	12	274915	274926	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	76788000
116	NC_007432	TTTTCC	2	12	275733	275744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788000
117	NC_007432	TTAAAT	2	12	278364	278375	50 %	50 %	0 %	0 %	76787642
118	NC_007432	CATAAG	2	12	280507	280518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	76788063
119	NC_007432	CAGAAG	2	12	291306	291317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	76788279
120	NC_007432	TTAGAC	2	12	294225	294236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	76787740
121	NC_007432	GTTCAG	2	12	305767	305778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76787444
122	NC_007432	ATTTTA	2	12	308673	308684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787716
123	NC_007432	AACGTA	2	12	309498	309509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	76787716
124	NC_007432	TATTGA	2	12	309574	309585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	76787716
125	NC_007432	GAAAAA	3	18	309862	309879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	76787716
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152	NC_007432	AATTTA	2	12	371766	371777	50 %	50 %	0 %	0 %	76787402
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499	NC_007432	CAATAA	2	12	1202482	1202493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	76787156
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