MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 1700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007432	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	76787564
2	NC_007432	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	76787564
3	NC_007432	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	76787564
4	NC_007432	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	76787013
5	NC_007432	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	76787013
6	NC_007432	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	76787923
7	NC_007432	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	76787923
8	NC_007432	TGGTA	2	10	4595	4604	20 %	40 %	40 %	0 %	76788043
9	NC_007432	TTTAT	2	10	5844	5853	20 %	80 %	0 %	0 %	76787164
10	NC_007432	TGGGT	2	10	10394	10403	0 %	40 %	60 %	0 %	76788554
11	NC_007432	ACTAT	2	10	12919	12928	40 %	40 %	0 %	20 %	76788050
12	NC_007432	GGATA	2	10	13148	13157	40 %	20 %	40 %	0 %	76788050
13	NC_007432	TCGTG	2	10	17475	17484	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007432	GTTAA	2	10	18230	18239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007432	GGGAG	2	10	18749	18758	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007432	AGGGA	2	10	20960	20969	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007432	TCGTG	2	10	23307	23316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007432	GTTAA	2	10	24062	24071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007432	GGGAG	2	10	24581	24590	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007432	AGGGA	2	10	26792	26801	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007432	ATTTT	2	10	32730	32739	20 %	80 %	0 %	0 %	76787396
22	NC_007432	TCAAT	2	10	33158	33167	40 %	40 %	0 %	20 %	76787396
23	NC_007432	CTTTT	2	10	33777	33786	0 %	80 %	0 %	20 %	76787992
24	NC_007432	AACGG	2	10	34875	34884	40 %	0 %	40 %	20 %	76786784
25	NC_007432	TGGTG	2	10	35898	35907	0 %	40 %	60 %	0 %	76788085
26	NC_007432	AGCGA	2	10	40336	40345	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007432	AGCAG	2	10	43252	43261	40 %	0 %	40 %	20 %	76788568
28	NC_007432	GGTCA	2	10	43616	43625	20 %	20 %	40 %	20 %	76788568
29	NC_007432	TTGGG	2	10	44617	44626	0 %	40 %	60 %	0 %	76787816
30	NC_007432	CTTTT	2	10	46151	46160	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007432	AATGC	2	10	48564	48573	40 %	20 %	20 %	20 %	76788047
32	NC_007432	GAAAA	2	10	49828	49837	80 %	0 %	20 %	0 %	76787512
33	NC_007432	GTCAT	2	10	51458	51467	20 %	40 %	20 %	20 %	76786863
34	NC_007432	AATCA	2	10	52919	52928	60 %	20 %	0 %	20 %	76787046
35	NC_007432	AGTCT	2	10	53763	53772	20 %	40 %	20 %	20 %	76787835
36	NC_007432	GATGG	2	10	55401	55410	20 %	20 %	60 %	0 %	76788207
37	NC_007432	TCCTC	2	10	57529	57538	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_007432	GCAGG	2	10	58972	58981	20 %	0 %	60 %	20 %	76788387
39	NC_007432	CTGCC	2	10	59938	59947	0 %	20 %	20 %	60 %	76787880
40	NC_007432	TTGAC	2	10	60219	60228	20 %	40 %	20 %	20 %	76787880
41	NC_007432	CTCAG	2	10	60331	60340	20 %	20 %	20 %	40 %	76787880
42	NC_007432	GAATA	2	10	60971	60980	60 %	20 %	20 %	0 %	76786991
43	NC_007432	TGATT	2	10	61865	61874	20 %	60 %	20 %	0 %	76786991
44	NC_007432	TATTT	2	10	61886	61895	20 %	80 %	0 %	0 %	76786991
45	NC_007432	TTTAT	2	10	62107	62116	20 %	80 %	0 %	0 %	76786991
46	NC_007432	TTGAT	2	10	64116	64125	20 %	60 %	20 %	0 %	76788347
47	NC_007432	TGAAA	2	10	65532	65541	60 %	20 %	20 %	0 %	76787346
48	NC_007432	TGTTT	2	10	66104	66113	0 %	80 %	20 %	0 %	76787627
49	NC_007432	TTTAC	2	10	66963	66972	20 %	60 %	0 %	20 %	76787884
50	NC_007432	TTTTA	2	10	67956	67965	20 %	80 %	0 %	0 %	76787884
51	NC_007432	GGTAT	2	10	69711	69720	20 %	40 %	40 %	0 %	76787506
52	NC_007432	AAATA	2	10	76381	76390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007432	GAAAA	2	10	79005	79014	80 %	0 %	20 %	0 %	76787652
54	NC_007432	TTTGG	2	10	79419	79428	0 %	60 %	40 %	0 %	76787677
55	NC_007432	TTCAC	2	10	79775	79784	20 %	40 %	0 %	40 %	76787747
56	NC_007432	GAAAT	2	10	80856	80865	60 %	20 %	20 %	0 %	76787939
57	NC_007432	AAGGA	2	10	81937	81946	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007432	TTCCA	2	10	86218	86227	20 %	40 %	0 %	40 %	76787809
59	NC_007432	TCCAA	2	10	86377	86386	40 %	20 %	0 %	40 %	76787809
60	NC_007432	GAATA	2	10	86948	86957	60 %	20 %	20 %	0 %	76787809
61	NC_007432	TCGTG	2	10	91996	92005	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007432	GTTAA	2	10	92753	92762	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007432	GGGAG	2	10	93272	93281	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007432	AGGGA	2	10	95483	95492	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007432	ATTTT	2	10	98446	98455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007432	TTTAA	2	10	98538	98547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007432	TAAAG	2	10	100535	100544	60 %	20 %	20 %	0 %	76786945
68	NC_007432	TATAA	2	10	101077	101086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007432	ATTTG	2	10	101486	101495	20 %	60 %	20 %	0 %	76787906
70	NC_007432	GTTTG	2	10	102820	102829	0 %	60 %	40 %	0 %	76788143
71	NC_007432	ATCAA	2	10	105254	105263	60 %	20 %	0 %	20 %	76787993
72	NC_007432	TATGG	2	10	105512	105521	20 %	40 %	40 %	0 %	76787993
73	NC_007432	CATTA	2	10	109187	109196	40 %	40 %	0 %	20 %	76787885
74	NC_007432	TATTG	2	10	111284	111293	20 %	60 %	20 %	0 %	76787611
75	NC_007432	AATAG	2	10	112885	112894	60 %	20 %	20 %	0 %	76788055
76	NC_007432	TAAAC	2	10	113251	113260	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007432	AATAT	2	10	114462	114471	60 %	40 %	0 %	0 %	76788439
78	NC_007432	ATTTA	2	10	115593	115602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007432	AAAAC	2	10	116175	116184	80 %	0 %	0 %	20 %	76788516
80	NC_007432	ATTTT	2	10	117247	117256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007432	CTTTT	2	10	117291	117300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007432	AAAAT	2	10	118888	118897	80 %	20 %	0 %	0 %	76788466
83	NC_007432	CAAGT	2	10	119882	119891	40 %	20 %	20 %	20 %	76787306
84	NC_007432	TGCCA	2	10	122295	122304	20 %	20 %	20 %	40 %	76787855
85	NC_007432	TCATG	2	10	124902	124911	20 %	40 %	20 %	20 %	76787836
86	NC_007432	TGGAT	2	10	125255	125264	20 %	40 %	40 %	0 %	76787836
87	NC_007432	TATAA	2	10	125735	125744	60 %	40 %	0 %	0 %	76787836
88	NC_007432	GTGAT	2	10	127051	127060	20 %	40 %	40 %	0 %	76788382
89	NC_007432	GCTTG	2	10	128257	128266	0 %	40 %	40 %	20 %	76787500
90	NC_007432	TTTGG	2	10	129933	129942	0 %	60 %	40 %	0 %	76787877
91	NC_007432	GAAAA	2	10	131985	131994	80 %	0 %	20 %	0 %	76788108
92	NC_007432	AGTCA	2	10	132546	132555	40 %	20 %	20 %	20 %	76788108
93	NC_007432	GGGTA	2	10	134130	134139	20 %	20 %	60 %	0 %	76786780
94	NC_007432	CTAAG	2	10	134155	134164	40 %	20 %	20 %	20 %	76786780
95	NC_007432	GAAAA	2	10	135379	135388	80 %	0 %	20 %	0 %	76788242
96	NC_007432	GATTT	2	10	136083	136092	20 %	60 %	20 %	0 %	76788242
97	NC_007432	AGTTA	2	10	136388	136397	40 %	40 %	20 %	0 %	76788242
98	NC_007432	TATGA	2	10	136689	136698	40 %	40 %	20 %	0 %	76787571
99	NC_007432	AAACC	2	10	140322	140331	60 %	0 %	0 %	40 %	76788045
100	NC_007432	ATAGA	2	10	140517	140526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007432	ATAAA	2	10	142588	142597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007432	GATTC	2	10	143419	143428	20 %	40 %	20 %	20 %	76786719
103	NC_007432	ACTTG	2	10	145074	145083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007432	TAGAT	2	10	145762	145771	40 %	40 %	20 %	0 %	76787028
105	NC_007432	TGGAT	2	10	147388	147397	20 %	40 %	40 %	0 %	76787028
106	NC_007432	GTTAA	2	10	152978	152987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007432	ATTTT	2	10	153508	153517	20 %	80 %	0 %	0 %	76787442
108	NC_007432	TTGAT	2	10	155315	155324	20 %	60 %	20 %	0 %	76788643
109	NC_007432	TTTTG	2	10	155557	155566	0 %	80 %	20 %	0 %	76788643
110	NC_007432	AAGCA	2	10	155773	155782	60 %	0 %	20 %	20 %	76788643
111	NC_007432	ACTTT	2	10	158441	158450	20 %	60 %	0 %	20 %	76788658
112	NC_007432	GCTTT	2	10	160543	160552	0 %	60 %	20 %	20 %	76787388
113	NC_007432	AATAT	2	10	160817	160826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007432	ATTAC	2	10	161533	161542	40 %	40 %	0 %	20 %	76786975
115	NC_007432	AAATT	2	10	162346	162355	60 %	40 %	0 %	0 %	76788150
116	NC_007432	ATCCT	2	10	162748	162757	20 %	40 %	0 %	40 %	76788150
117	NC_007432	AGTTT	2	10	163894	163903	20 %	60 %	20 %	0 %	76788148
118	NC_007432	ATACC	2	10	165921	165930	40 %	20 %	0 %	40 %	76788577
119	NC_007432	AGGTT	2	10	167917	167926	20 %	40 %	40 %	0 %	76787943
120	NC_007432	ATTTT	2	10	168259	168268	20 %	80 %	0 %	0 %	76787943
121	NC_007432	AATAG	2	10	168778	168787	60 %	20 %	20 %	0 %	76787943
122	NC_007432	AAGAC	2	10	169284	169293	60 %	0 %	20 %	20 %	76787081
123	NC_007432	AAAAC	2	10	170363	170372	80 %	0 %	0 %	20 %	76787081
124	NC_007432	TGGGG	2	10	170394	170403	0 %	20 %	80 %	0 %	76787081
125	NC_007432	AATTA	2	10	170701	170710	60 %	40 %	0 %	0 %	76787081
126	NC_007432	ATGAT	2	10	170816	170825	40 %	40 %	20 %	0 %	76788112
127	NC_007432	CAATC	2	10	174563	174572	40 %	20 %	0 %	40 %	76788337
128	NC_007432	TCGTG	2	10	176241	176250	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007432	GTTAA	2	10	176998	177007	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007432	GGGAG	2	10	177517	177526	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007432	AGGGA	2	10	179728	179737	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007432	TGTTA	2	10	180262	180271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007432	ATTGT	2	10	180453	180462	20 %	60 %	20 %	0 %	76787631
134	NC_007432	ATTAG	2	10	180566	180575	40 %	40 %	20 %	0 %	76787631
135	NC_007432	TTTTA	2	10	182822	182831	20 %	80 %	0 %	0 %	76788538
136	NC_007432	ATCTA	2	10	183960	183969	40 %	40 %	0 %	20 %	76787832
137	NC_007432	TTATT	2	10	184637	184646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007432	GATTG	2	10	188257	188266	20 %	40 %	40 %	0 %	76788029
139	NC_007432	GTCCT	2	10	196265	196274	0 %	40 %	20 %	40 %	76787132
140	NC_007432	ATTTT	2	10	197172	197181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_007432	ATTCT	2	10	349489	349498	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_007432	GGTTT	2	10	350431	350440	0 %	60 %	40 %	0 %	76787533
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