MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13 plasmid pCTA

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007430	CAAT	2	8	468	475	50 %	25 %	0 %	25 %	76789624
2	NC_007430	TATC	2	8	1324	1331	25 %	50 %	0 %	25 %	76789625
3	NC_007430	GAAG	2	8	1359	1366	50 %	0 %	50 %	0 %	76789625
4	NC_007430	TTGG	2	8	1514	1521	0 %	50 %	50 %	0 %	76789625
5	NC_007430	AACT	2	8	1583	1590	50 %	25 %	0 %	25 %	76789625
6	NC_007430	GGAA	2	8	1841	1848	50 %	0 %	50 %	0 %	76789625
7	NC_007430	CCGA	2	8	2213	2220	25 %	0 %	25 %	50 %	76789626
8	NC_007430	AAAC	2	8	2276	2283	75 %	0 %	0 %	25 %	76789626
9	NC_007430	AATT	2	8	2284	2291	50 %	50 %	0 %	0 %	76789626
10	NC_007430	TGAT	2	8	2499	2506	25 %	50 %	25 %	0 %	76789626
11	NC_007430	GTTT	2	8	3130	3137	0 %	75 %	25 %	0 %	76789628
12	NC_007430	ATTA	2	8	3979	3986	50 %	50 %	0 %	0 %	76789629
13	NC_007430	TTTA	2	8	4052	4059	25 %	75 %	0 %	0 %	76789629
14	NC_007430	ATCC	2	8	4776	4783	25 %	25 %	0 %	50 %	76789629
15	NC_007430	GAAA	2	8	4896	4903	75 %	0 %	25 %	0 %	76789629
16	NC_007430	TTCC	2	8	5155	5162	0 %	50 %	0 %	50 %	76789630
17	NC_007430	AAAC	2	8	5276	5283	75 %	0 %	0 %	25 %	76789630
18	NC_007430	AAAG	2	8	5800	5807	75 %	0 %	25 %	0 %	76789630
19	NC_007430	TCCT	2	8	6981	6988	0 %	50 %	0 %	50 %	76789631
20	NC_007430	TTTC	2	8	7114	7121	0 %	75 %	0 %	25 %	76789631
21	NC_007430	CAGA	2	8	7140	7147	50 %	0 %	25 %	25 %	76789631

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.