MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13 plasmid pCTA

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007430	AC	4	8	82	89	50 %	0 %	0 %	50 %	76789624
2	NC_007430	GA	3	6	101	106	50 %	0 %	50 %	0 %	76789624
3	NC_007430	AT	3	6	626	631	50 %	50 %	0 %	0 %	76789624
4	NC_007430	TC	4	8	1115	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007430	TA	5	10	1146	1155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007430	AT	5	10	1160	1169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007430	AT	3	6	1467	1472	50 %	50 %	0 %	0 %	76789625
8	NC_007430	GA	3	6	2068	2073	50 %	0 %	50 %	0 %	76789626
9	NC_007430	TA	3	6	2134	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	76789626
10	NC_007430	AG	3	6	4079	4084	50 %	0 %	50 %	0 %	76789629
11	NC_007430	AT	3	6	4221	4226	50 %	50 %	0 %	0 %	76789629
12	NC_007430	AT	3	6	5328	5333	50 %	50 %	0 %	0 %	76789630
13	NC_007430	AG	3	6	5542	5547	50 %	0 %	50 %	0 %	76789630
14	NC_007430	AT	3	6	5880	5885	50 %	50 %	0 %	0 %	76789630
15	NC_007430	AC	3	6	6055	6060	50 %	0 %	0 %	50 %	76789630
16	NC_007430	TA	3	6	6397	6402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007430	TC	3	6	7279	7284	0 %	50 %	0 %	50 %	76789631

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.