MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 2543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007429	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	76788712
2	NC_007429	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	76788712
3	NC_007429	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	76788712
4	NC_007429	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	76788712
5	NC_007429	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	76788712
6	NC_007429	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	76788712
7	NC_007429	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	76788712
8	NC_007429	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	76788713
9	NC_007429	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	76788714
10	NC_007429	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	76788714
11	NC_007429	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	76788715
12	NC_007429	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	76788715
13	NC_007429	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	76788715
14	NC_007429	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	76788716
15	NC_007429	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	76788716
16	NC_007429	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	76788716
17	NC_007429	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	76788716
18	NC_007429	TGGA	2	8	5917	5924	25 %	25 %	50 %	0 %	76788717
19	NC_007429	CTTT	2	8	6294	6301	0 %	75 %	0 %	25 %	76788717
20	NC_007429	GGGA	2	8	6809	6816	25 %	0 %	75 %	0 %	76788717
21	NC_007429	GGTG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	75 %	0 %	76788718
22	NC_007429	AAAT	2	8	7178	7185	75 %	25 %	0 %	0 %	76788718
23	NC_007429	AAGC	2	8	8416	8423	50 %	0 %	25 %	25 %	76788719
24	NC_007429	ATTG	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	76788720
25	NC_007429	AGCG	2	8	9281	9288	25 %	0 %	50 %	25 %	76788720
26	NC_007429	AAAG	2	8	9302	9309	75 %	0 %	25 %	0 %	76788720
27	NC_007429	CTTT	2	8	9642	9649	0 %	75 %	0 %	25 %	76788720
28	NC_007429	TTCG	2	8	10014	10021	0 %	50 %	25 %	25 %	76788721
29	NC_007429	AATT	2	8	10119	10126	50 %	50 %	0 %	0 %	76788721
30	NC_007429	ATGG	2	8	10178	10185	25 %	25 %	50 %	0 %	76788721
31	NC_007429	CTTT	2	8	10803	10810	0 %	75 %	0 %	25 %	76788722
32	NC_007429	GCAA	2	8	11020	11027	50 %	0 %	25 %	25 %	76788722
33	NC_007429	AGCC	2	8	11250	11257	25 %	0 %	25 %	50 %	76788722
34	NC_007429	GAAA	2	8	11393	11400	75 %	0 %	25 %	0 %	76788722
35	NC_007429	AATG	2	8	12135	12142	50 %	25 %	25 %	0 %	76788723
36	NC_007429	ATGC	2	8	13598	13605	25 %	25 %	25 %	25 %	76788724
37	NC_007429	TTGT	2	8	14634	14641	0 %	75 %	25 %	0 %	76788725
38	NC_007429	TTCT	2	8	14805	14812	0 %	75 %	0 %	25 %	76788725
39	NC_007429	ATTT	2	8	15011	15018	25 %	75 %	0 %	0 %	76788725
40	NC_007429	TTTC	2	8	15673	15680	0 %	75 %	0 %	25 %	76788726
41	NC_007429	AAAT	2	8	16155	16162	75 %	25 %	0 %	0 %	76788726
42	NC_007429	GTAA	2	8	16997	17004	50 %	25 %	25 %	0 %	76788727
43	NC_007429	CTAA	2	8	17190	17197	50 %	25 %	0 %	25 %	76788727
44	NC_007429	AGAA	2	8	17453	17460	75 %	0 %	25 %	0 %	76788727
45	NC_007429	ATTT	2	8	17599	17606	25 %	75 %	0 %	0 %	76788727
46	NC_007429	GAAG	2	8	20105	20112	50 %	0 %	50 %	0 %	76788729
47	NC_007429	TTTG	2	8	20131	20138	0 %	75 %	25 %	0 %	76788729
48	NC_007429	TGTA	2	8	20823	20830	25 %	50 %	25 %	0 %	76788730
49	NC_007429	GATG	2	8	22239	22246	25 %	25 %	50 %	0 %	76788731
50	NC_007429	CATT	2	8	23298	23305	25 %	50 %	0 %	25 %	76788731
51	NC_007429	GCTT	2	8	23641	23648	0 %	50 %	25 %	25 %	76788731
52	NC_007429	GGTT	2	8	23689	23696	0 %	50 %	50 %	0 %	76788731
53	NC_007429	TTCT	2	8	24059	24066	0 %	75 %	0 %	25 %	76788731
54	NC_007429	TAAC	2	8	24161	24168	50 %	25 %	0 %	25 %	76788731
55	NC_007429	CATT	2	8	24284	24291	25 %	50 %	0 %	25 %	76788731
56	NC_007429	GGTA	2	8	24654	24661	25 %	25 %	50 %	0 %	76788731
57	NC_007429	TTGA	2	8	25651	25658	25 %	50 %	25 %	0 %	76788732
58	NC_007429	TTCG	2	8	25796	25803	0 %	50 %	25 %	25 %	76788732
59	NC_007429	TAGG	2	8	25875	25882	25 %	25 %	50 %	0 %	76788732
60	NC_007429	TTCC	2	8	25999	26006	0 %	50 %	0 %	50 %	76788732
61	NC_007429	TAGG	2	8	26113	26120	25 %	25 %	50 %	0 %	76788732
62	NC_007429	GCTT	2	8	26885	26892	0 %	50 %	25 %	25 %	76788732
63	NC_007429	GGAA	2	8	27468	27475	50 %	0 %	50 %	0 %	76788733
64	NC_007429	TTAA	2	8	27541	27548	50 %	50 %	0 %	0 %	76788733
65	NC_007429	AAAG	2	8	27591	27598	75 %	0 %	25 %	0 %	76788733
66	NC_007429	GGGC	2	8	27871	27878	0 %	0 %	75 %	25 %	76788733
67	NC_007429	CAGA	2	8	28176	28183	50 %	0 %	25 %	25 %	76788734
68	NC_007429	CTTT	2	8	30148	30155	0 %	75 %	0 %	25 %	76788736
69	NC_007429	TTTG	2	8	30163	30170	0 %	75 %	25 %	0 %	76788736
70	NC_007429	TTGT	2	8	30198	30205	0 %	75 %	25 %	0 %	76788736
71	NC_007429	TGGC	2	8	30361	30368	0 %	25 %	50 %	25 %	76788736
72	NC_007429	AAAG	2	8	30921	30928	75 %	0 %	25 %	0 %	76788737
73	NC_007429	AAAC	2	8	30991	30998	75 %	0 %	0 %	25 %	76788737
74	NC_007429	GATG	2	8	31134	31141	25 %	25 %	50 %	0 %	76788737
75	NC_007429	GATA	2	8	32243	32250	50 %	25 %	25 %	0 %	76788739
76	NC_007429	TGAT	2	8	34737	34744	25 %	50 %	25 %	0 %	76788742
77	NC_007429	AAGA	3	12	34865	34876	75 %	0 %	25 %	0 %	76788742
78	NC_007429	AAGC	2	8	35085	35092	50 %	0 %	25 %	25 %	76788743
79	NC_007429	GTTC	2	8	35118	35125	0 %	50 %	25 %	25 %	76788743
80	NC_007429	GGCA	2	8	35497	35504	25 %	0 %	50 %	25 %	76788744
81	NC_007429	TCGA	2	8	35754	35761	25 %	25 %	25 %	25 %	76788744
82	NC_007429	TGCT	2	8	35907	35914	0 %	50 %	25 %	25 %	76788744
83	NC_007429	TATG	2	8	36050	36057	25 %	50 %	25 %	0 %	76788744
84	NC_007429	TTGG	2	8	36139	36146	0 %	50 %	50 %	0 %	76788744
85	NC_007429	AGAT	2	8	36859	36866	50 %	25 %	25 %	0 %	76788744
86	NC_007429	CTTT	2	8	37232	37239	0 %	75 %	0 %	25 %	76788745
87	NC_007429	ATGA	2	8	37722	37729	50 %	25 %	25 %	0 %	76788745
88	NC_007429	TAGG	2	8	37881	37888	25 %	25 %	50 %	0 %	76788745
89	NC_007429	CAAT	2	8	38065	38072	50 %	25 %	0 %	25 %	76788745
90	NC_007429	AATG	2	8	38852	38859	50 %	25 %	25 %	0 %	76788745
91	NC_007429	AGAA	2	8	39689	39696	75 %	0 %	25 %	0 %	76788746
92	NC_007429	AAGA	2	8	39741	39748	75 %	0 %	25 %	0 %	76788746
93	NC_007429	ATCC	2	8	39749	39756	25 %	25 %	0 %	50 %	76788746
94	NC_007429	TAAT	2	8	39960	39967	50 %	50 %	0 %	0 %	76788746
95	NC_007429	GTGC	2	8	42049	42056	0 %	25 %	50 %	25 %	76788748
96	NC_007429	AGAA	2	8	42468	42475	75 %	0 %	25 %	0 %	76788748
97	NC_007429	GGAT	2	8	42620	42627	25 %	25 %	50 %	0 %	76788748
98	NC_007429	AAAC	2	8	43829	43836	75 %	0 %	0 %	25 %	76788751
99	NC_007429	CAAT	2	8	44033	44040	50 %	25 %	0 %	25 %	76788751
100	NC_007429	ATTT	2	8	44790	44797	25 %	75 %	0 %	0 %	76788753
101	NC_007429	GCTC	2	8	45098	45105	0 %	25 %	25 %	50 %	76788753
102	NC_007429	TTCT	2	8	45240	45247	0 %	75 %	0 %	25 %	76788753
103	NC_007429	TTGA	2	8	45840	45847	25 %	50 %	25 %	0 %	76788754
104	NC_007429	TGTT	2	8	46012	46019	0 %	75 %	25 %	0 %	76788754
105	NC_007429	CTAT	2	8	46042	46049	25 %	50 %	0 %	25 %	76788754
106	NC_007429	TGTT	2	8	46071	46078	0 %	75 %	25 %	0 %	76788754
107	NC_007429	CTAT	2	8	46367	46374	25 %	50 %	0 %	25 %	76788754
108	NC_007429	AAGA	2	8	46862	46869	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
109	NC_007429	AAGA	2	8	46919	46926	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
110	NC_007429	AAAG	2	8	46959	46966	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
111	NC_007429	AAGA	2	8	47074	47081	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
112	NC_007429	ACTT	2	8	47335	47342	25 %	50 %	0 %	25 %	76788755
113	NC_007429	ATGG	2	8	47961	47968	25 %	25 %	50 %	0 %	76788755
114	NC_007429	AGGA	2	8	47992	47999	50 %	0 %	50 %	0 %	76788755
115	NC_007429	GAAC	2	8	48539	48546	50 %	0 %	25 %	25 %	76788755
116	NC_007429	AACA	2	8	48783	48790	75 %	0 %	0 %	25 %	76788756
117	NC_007429	CTTT	2	8	48979	48986	0 %	75 %	0 %	25 %	76788756
118	NC_007429	CTTT	2	8	49863	49870	0 %	75 %	0 %	25 %	76788757
119	NC_007429	GTAG	2	8	49881	49888	25 %	25 %	50 %	0 %	76788757
120	NC_007429	GAAG	2	8	51309	51316	50 %	0 %	50 %	0 %	76788758
121	NC_007429	TTCA	2	8	51731	51738	25 %	50 %	0 %	25 %	76788758
122	NC_007429	GGAA	2	8	53004	53011	50 %	0 %	50 %	0 %	76788760
123	NC_007429	TTAA	2	8	53745	53752	50 %	50 %	0 %	0 %	76788760
124	NC_007429	CCTT	2	8	53952	53959	0 %	50 %	0 %	50 %	76788761
125	NC_007429	TTTA	2	8	54119	54126	25 %	75 %	0 %	0 %	76788761
126	NC_007429	AAAG	2	8	54343	54350	75 %	0 %	25 %	0 %	76788761
127	NC_007429	GATT	2	8	54480	54487	25 %	50 %	25 %	0 %	76788761
128	NC_007429	AATC	2	8	54535	54542	50 %	25 %	0 %	25 %	76788761
129	NC_007429	TATT	2	8	54596	54603	25 %	75 %	0 %	0 %	76788761
130	NC_007429	TCGA	2	8	54984	54991	25 %	25 %	25 %	25 %	76788762
131	NC_007429	CTTC	2	8	55078	55085	0 %	50 %	0 %	50 %	76788762
132	NC_007429	GAAT	2	8	55113	55120	50 %	25 %	25 %	0 %	76788762
133	NC_007429	TTGA	2	8	55183	55190	25 %	50 %	25 %	0 %	76788762
134	NC_007429	GGAA	2	8	55539	55546	50 %	0 %	50 %	0 %	76788762
135	NC_007429	TTGC	2	8	56578	56585	0 %	50 %	25 %	25 %	76788763
136	NC_007429	AGCT	2	8	57074	57081	25 %	25 %	25 %	25 %	76788763
137	NC_007429	TTTG	2	8	57398	57405	0 %	75 %	25 %	0 %	76788763
138	NC_007429	GGTT	2	8	57858	57865	0 %	50 %	50 %	0 %	76788763
139	NC_007429	GAAA	2	8	58726	58733	75 %	0 %	25 %	0 %	76788764
140	NC_007429	AGGT	2	8	58765	58772	25 %	25 %	50 %	0 %	76788764
141	NC_007429	GGAA	2	8	59313	59320	50 %	0 %	50 %	0 %	76788764
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