MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 12977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007429	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788712
2	NC_007429	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788712
3	NC_007429	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788712
4	NC_007429	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788712
5	NC_007429	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788712
6	NC_007429	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788712
7	NC_007429	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788712
8	NC_007429	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788712
9	NC_007429	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788712
10	NC_007429	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76788712
11	NC_007429	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788712
12	NC_007429	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788712
13	NC_007429	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788712
14	NC_007429	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788712
15	NC_007429	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788712
16	NC_007429	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788712
17	NC_007429	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788712
18	NC_007429	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788712
19	NC_007429	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788712
20	NC_007429	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788712
21	NC_007429	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788712
22	NC_007429	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788712
23	NC_007429	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788712
24	NC_007429	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788712
25	NC_007429	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788712
26	NC_007429	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788712
27	NC_007429	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788712
28	NC_007429	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788713
29	NC_007429	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788713
30	NC_007429	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788713
31	NC_007429	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788713
32	NC_007429	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788713
33	NC_007429	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788713
34	NC_007429	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788713
35	NC_007429	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788713
36	NC_007429	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788713
37	NC_007429	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788713
38	NC_007429	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788714
39	NC_007429	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788714
40	NC_007429	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788714
41	NC_007429	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788714
42	NC_007429	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788714
43	NC_007429	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788714
44	NC_007429	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788714
45	NC_007429	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788715
46	NC_007429	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788715
47	NC_007429	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788715
48	NC_007429	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788715
49	NC_007429	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788715
50	NC_007429	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788715
51	NC_007429	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788715
52	NC_007429	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788715
53	NC_007429	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788715
54	NC_007429	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788715
55	NC_007429	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788715
56	NC_007429	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788715
57	NC_007429	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788715
58	NC_007429	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788715
59	NC_007429	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788715
60	NC_007429	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788715
61	NC_007429	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788715
62	NC_007429	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788715
63	NC_007429	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788715
64	NC_007429	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788715
65	NC_007429	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788715
66	NC_007429	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788716
67	NC_007429	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788716
68	NC_007429	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788716
69	NC_007429	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788716
70	NC_007429	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788716
71	NC_007429	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788716
72	NC_007429	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788716
73	NC_007429	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788716
74	NC_007429	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788716
75	NC_007429	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788716
76	NC_007429	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788716
77	NC_007429	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788716
78	NC_007429	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788716
79	NC_007429	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788716
80	NC_007429	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788716
81	NC_007429	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788717
82	NC_007429	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788717
83	NC_007429	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788717
84	NC_007429	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788717
85	NC_007429	ACG	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788717
86	NC_007429	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788717
87	NC_007429	AGA	3	9	5981	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788717
88	NC_007429	GCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788717
89	NC_007429	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788717
90	NC_007429	TGG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788717
91	NC_007429	AGA	3	9	6053	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788717
92	NC_007429	GGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788717
93	NC_007429	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788717
94	NC_007429	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788717
95	NC_007429	CTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788717
96	NC_007429	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788717
97	NC_007429	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788717
98	NC_007429	AGG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788718
99	NC_007429	GAA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788718
100	NC_007429	GCA	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788718
101	NC_007429	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788718
102	NC_007429	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788718
103	NC_007429	TCC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788719
104	NC_007429	GTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788719
105	NC_007429	TTA	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788719
106	NC_007429	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788719
107	NC_007429	GAA	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788720
108	NC_007429	ACC	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76788720
109	NC_007429	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788720
110	NC_007429	GAG	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788720
111	NC_007429	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788720
112	NC_007429	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788720
113	NC_007429	GAA	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788720
114	NC_007429	CAG	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788720
115	NC_007429	TGT	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788720
116	NC_007429	GAG	2	6	9482	9487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788720
117	NC_007429	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788720
118	NC_007429	GTT	2	6	9654	9659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788720
119	NC_007429	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788720
120	NC_007429	GAG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788720
121	NC_007429	TTA	2	6	9992	9997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788721
122	NC_007429	AGA	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788721
123	NC_007429	TGC	2	6	10257	10262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788721
124	NC_007429	GAA	2	6	10284	10289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788721
125	NC_007429	TCG	2	6	10344	10349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788721
126	NC_007429	TGG	2	6	10367	10372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788721
127	NC_007429	GTA	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788722
128	NC_007429	AGC	2	6	10578	10583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788722
129	NC_007429	CTT	2	6	10592	10597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788722
130	NC_007429	ATG	2	6	10753	10758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788722
131	NC_007429	CGT	2	6	10780	10785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788722
132	NC_007429	GAC	2	6	10950	10955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788722
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