MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007429	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007429	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007429	TA	3	6	11843	11848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007429	TA	3	6	13934	13939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007429	TA	4	8	14158	14165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007429	AG	3	6	18110	18115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007429	GA	3	6	18123	18128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007429	CT	3	6	19045	19050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007429	AG	3	6	21111	21116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007429	GA	3	6	21269	21274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007429	AG	3	6	21786	21791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007429	CT	3	6	21855	21860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007429	GA	3	6	27109	27114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007429	CT	3	6	27116	27121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007429	TC	3	6	28484	28489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007429	AG	3	6	28567	28572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007429	GA	3	6	36980	36985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007429	AT	3	6	37082	37087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007429	CT	3	6	39349	39354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007429	CT	3	6	40720	40725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007429	TC	3	6	44404	44409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007429	AG	3	6	48639	48644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007429	TG	4	8	51985	51992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007429	GA	3	6	56194	56199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007429	GA	3	6	61410	61415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007429	AG	4	8	65429	65436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007429	TA	3	6	69759	69764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007429	CT	3	6	72495	72500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007429	TA	3	6	85851	85856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007429	GA	3	6	91204	91209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007429	CT	3	6	93554	93559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007429	GA	3	6	94082	94087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007429	TC	3	6	100580	100585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007429	AT	3	6	100631	100636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007429	TA	3	6	107307	107312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007429	TG	3	6	116550	116555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007429	AG	4	8	119137	119144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007429	GA	3	6	120959	120964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007429	TA	3	6	123193	123198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007429	GT	3	6	124183	124188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007429	CT	3	6	128717	128722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007429	TC	3	6	131039	131044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007429	AG	3	6	131116	131121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007429	AG	3	6	131141	131146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007429	TG	3	6	133948	133953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007429	AG	3	6	138786	138791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007429	AT	3	6	143081	143086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007429	GA	3	6	152318	152323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007429	AG	3	6	153861	153866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007429	AG	3	6	157886	157891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007429	TC	3	6	172349	172354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007429	AG	3	6	172481	172486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007429	CT	3	6	172499	172504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007429	TG	3	6	178988	178993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007429	GA	3	6	185081	185086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007429	AT	3	6	194492	194497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007429	AG	3	6	198960	198965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007429	TC	3	6	201951	201956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007429	AG	3	6	203783	203788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007429	CT	3	6	203795	203800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007429	CT	3	6	205709	205714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007429	GA	4	8	208768	208775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007429	CT	4	8	208816	208823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007429	AG	4	8	220086	220093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007429	TA	3	6	221640	221645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007429	CT	3	6	223281	223286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007429	TC	3	6	226282	226287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007429	AG	3	6	226313	226318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007429	TC	3	6	240513	240518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007429	AG	3	6	240539	240544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007429	CA	3	6	245465	245470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007429	GT	3	6	245682	245687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007429	GA	3	6	252550	252555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007429	TG	3	6	252660	252665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007429	AG	3	6	253462	253467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007429	AG	3	6	254471	254476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007429	TA	3	6	256272	256277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007429	AG	3	6	258554	258559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007429	TC	3	6	258580	258585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007429	AG	3	6	260057	260062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007429	TA	3	6	266420	266425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007429	CA	3	6	268227	268232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007429	TC	3	6	270127	270132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007429	TA	3	6	275679	275684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007429	AT	4	8	286239	286246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007429	CT	3	6	287091	287096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007429	TC	4	8	287182	287189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007429	TC	3	6	288873	288878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007429	TC	3	6	288930	288935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007429	CT	3	6	289403	289408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007429	AT	3	6	301420	301425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007429	CA	3	6	303749	303754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007429	GA	3	6	308480	308485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007429	AG	3	6	317686	317691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007429	CT	3	6	349636	349641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007429	CT	3	6	352707	352712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007429	TC	3	6	356933	356938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007429	TC	3	6	360763	360768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007429	CT	3	6	360849	360854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007429	AC	3	6	364182	364187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007429	GA	3	6	366092	366097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007429	TC	3	6	366170	366175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007429	TA	3	6	366371	366376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007429	GT	3	6	369742	369747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007429	CT	4	8	383509	383516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007429	CG	3	6	393347	393352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007429	CA	3	6	394397	394402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007429	TC	3	6	396944	396949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007429	CT	3	6	397434	397439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007429	GA	3	6	397564	397569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007429	GA	3	6	397695	397700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007429	CT	3	6	405822	405827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007429	TC	3	6	405830	405835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007429	CT	3	6	412779	412784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007429	CT	3	6	430055	430060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007429	CT	3	6	431505	431510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007429	CT	3	6	432528	432533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007429	AG	3	6	432875	432880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007429	GA	3	6	434570	434575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007429	AC	3	6	438567	438572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007429	CT	3	6	442838	442843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007429	AC	3	6	442876	442881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007429	CA	3	6	445345	445350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007429	CT	3	6	446749	446754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007429	TC	3	6	456030	456035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007429	AG	3	6	462172	462177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007429	TC	3	6	468711	468716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007429	AT	3	6	468780	468785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007429	GA	4	8	470154	470161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007429	TA	3	6	470197	470202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007429	GA	3	6	470295	470300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007429	TC	3	6	482028	482033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007429	AC	3	6	487600	487605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007429	GA	4	8	487645	487652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007429	CA	3	6	487682	487687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007429	TC	3	6	487723	487728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007429	AC	3	6	492158	492163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007429	AG	3	6	492320	492325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007429	CT	3	6	492339	492344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007429	CT	3	6	495618	495623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007429	CT	3	6	496136	496141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007429	TG	3	6	496169	496174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007429	TA	3	6	496282	496287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007429	CT	4	8	501939	501946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007429	AG	3	6	505945	505950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007429	CA	3	6	510009	510014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007429	CT	3	6	510947	510952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007429	TA	3	6	516755	516760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007429	AG	3	6	518653	518658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007429	TC	3	6	519499	519504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007429	GA	3	6	519654	519659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007429	AG	3	6	519690	519695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007429	AT	3	6	525921	525926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007429	AC	3	6	537469	537474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.