MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL23

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007428	GAAC	2	8	1004	1011	50 %	0 %	25 %	25 %	76803318
2	NC_007428	CAAG	2	8	1052	1059	50 %	0 %	25 %	25 %	76803318
3	NC_007428	CCCG	2	8	1174	1181	0 %	0 %	25 %	75 %	76803318
4	NC_007428	GCCG	2	8	2490	2497	0 %	0 %	50 %	50 %	76803320
5	NC_007428	TCGG	2	8	3590	3597	0 %	25 %	50 %	25 %	76803321
6	NC_007428	CTCC	2	8	3706	3713	0 %	25 %	0 %	75 %	76803322
7	NC_007428	ATTG	2	8	4443	4450	25 %	50 %	25 %	0 %	76803323
8	NC_007428	CCGT	2	8	4671	4678	0 %	25 %	25 %	50 %	76803324
9	NC_007428	GTTG	2	8	4840	4847	0 %	50 %	50 %	0 %	76803324
10	NC_007428	GCGA	2	8	4943	4950	25 %	0 %	50 %	25 %	76803325
11	NC_007428	CCGT	2	8	4986	4993	0 %	25 %	25 %	50 %	76803325
12	NC_007428	GCCG	2	8	6248	6255	0 %	0 %	50 %	50 %	76803328
13	NC_007428	TGGC	2	8	6514	6521	0 %	25 %	50 %	25 %	76803329
14	NC_007428	TGAC	2	8	6743	6750	25 %	25 %	25 %	25 %	76803329
15	NC_007428	GAAA	2	8	6833	6840	75 %	0 %	25 %	0 %	76803330
16	NC_007428	GCGA	2	8	6845	6852	25 %	0 %	50 %	25 %	76803330
17	NC_007428	CGGT	2	8	7010	7017	0 %	25 %	50 %	25 %	76803330
18	NC_007428	GGCT	2	8	7219	7226	0 %	25 %	50 %	25 %	76803330
19	NC_007428	CGGC	2	8	7316	7323	0 %	0 %	50 %	50 %	76803330
20	NC_007428	TTCT	2	8	7805	7812	0 %	75 %	0 %	25 %	76803331
21	NC_007428	TGAC	2	8	8317	8324	25 %	25 %	25 %	25 %	76803333
22	NC_007428	GCTG	2	8	8417	8424	0 %	25 %	50 %	25 %	76803334
23	NC_007428	TTTG	2	8	8525	8532	0 %	75 %	25 %	0 %	76803334
24	NC_007428	AGCA	2	8	8555	8562	50 %	0 %	25 %	25 %	76803334
25	NC_007428	GGGT	2	8	8841	8848	0 %	25 %	75 %	0 %	76803334
26	NC_007428	GAAC	2	8	9046	9053	50 %	0 %	25 %	25 %	76803335
27	NC_007428	CCGG	2	8	9101	9108	0 %	0 %	50 %	50 %	76803335
28	NC_007428	AAAC	2	8	9165	9172	75 %	0 %	0 %	25 %	76803335
29	NC_007428	GTCT	2	8	9325	9332	0 %	50 %	25 %	25 %	76803335
30	NC_007428	AACC	2	8	9658	9665	50 %	0 %	0 %	50 %	76803335
31	NC_007428	CGGT	2	8	10491	10498	0 %	25 %	50 %	25 %	76803335
32	NC_007428	GCTG	2	8	10513	10520	0 %	25 %	50 %	25 %	76803335
33	NC_007428	GGGA	2	8	11131	11138	25 %	0 %	75 %	0 %	76803336
34	NC_007428	CGGC	2	8	11251	11258	0 %	0 %	50 %	50 %	76803337
35	NC_007428	GCTG	2	8	11464	11471	0 %	25 %	50 %	25 %	76803337
36	NC_007428	GGCC	2	8	11707	11714	0 %	0 %	50 %	50 %	76803338
37	NC_007428	CTTC	2	8	11733	11740	0 %	50 %	0 %	50 %	76803338
38	NC_007428	GCTG	2	8	12035	12042	0 %	25 %	50 %	25 %	76803339
39	NC_007428	CCGC	2	8	12058	12065	0 %	0 %	25 %	75 %	76803339
40	NC_007428	GGCT	2	8	13106	13113	0 %	25 %	50 %	25 %	76803339
41	NC_007428	GACA	2	8	13612	13619	50 %	0 %	25 %	25 %	76803340
42	NC_007428	ACCG	2	8	13759	13766	25 %	0 %	25 %	50 %	76803340
43	NC_007428	CGGC	2	8	14157	14164	0 %	0 %	50 %	50 %	76803340
44	NC_007428	ACGG	2	8	14320	14327	25 %	0 %	50 %	25 %	76803340
45	NC_007428	CGTC	2	8	14764	14771	0 %	25 %	25 %	50 %	76803340
46	NC_007428	GACG	2	8	15388	15395	25 %	0 %	50 %	25 %	76803340
47	NC_007428	GACC	2	8	15397	15404	25 %	0 %	25 %	50 %	76803340
48	NC_007428	GATG	2	8	15661	15668	25 %	25 %	50 %	0 %	76803340
49	NC_007428	CCGG	2	8	15733	15740	0 %	0 %	50 %	50 %	76803340
50	NC_007428	CAGC	2	8	16142	16149	25 %	0 %	25 %	50 %	76803340
51	NC_007428	ACAG	2	8	17679	17686	50 %	0 %	25 %	25 %	76803344
52	NC_007428	GTCG	2	8	18077	18084	0 %	25 %	50 %	25 %	76803344
53	NC_007428	TCGT	2	8	18102	18109	0 %	50 %	25 %	25 %	76803344
54	NC_007428	GTCG	2	8	18613	18620	0 %	25 %	50 %	25 %	76803344
55	NC_007428	TTGC	2	8	18801	18808	0 %	50 %	25 %	25 %	76803344
56	NC_007428	GCCG	2	8	18897	18904	0 %	0 %	50 %	50 %	76803344
57	NC_007428	GAGC	2	8	19868	19875	25 %	0 %	50 %	25 %	76803346
58	NC_007428	CTCG	2	8	20781	20788	0 %	25 %	25 %	50 %	76803347
59	NC_007428	GGAC	2	8	20866	20873	25 %	0 %	50 %	25 %	76803347
60	NC_007428	GACG	2	8	21657	21664	25 %	0 %	50 %	25 %	76803347
61	NC_007428	AGCC	2	8	21749	21756	25 %	0 %	25 %	50 %	76803348
62	NC_007428	GGCT	2	8	22044	22051	0 %	25 %	50 %	25 %	76803349
63	NC_007428	GCTG	2	8	22256	22263	0 %	25 %	50 %	25 %	76803350
64	NC_007428	CATC	2	8	22603	22610	25 %	25 %	0 %	50 %	76803351
65	NC_007428	CCCG	2	8	22623	22630	0 %	0 %	25 %	75 %	76803352
66	NC_007428	CCGC	2	8	22887	22894	0 %	0 %	25 %	75 %	76803353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.