MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL23

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007428	CGA	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803318
2	NC_007428	GAG	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803318
3	NC_007428	CGC	2	6	1114	1119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803318
4	NC_007428	CTG	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803318
5	NC_007428	TGC	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803318
6	NC_007428	AGC	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803318
7	NC_007428	GTC	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803319
8	NC_007428	TGC	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803319
9	NC_007428	CCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803319
10	NC_007428	ACT	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803320
11	NC_007428	CGT	2	6	2465	2470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803320
12	NC_007428	CCT	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
13	NC_007428	CGT	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
14	NC_007428	GTC	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
15	NC_007428	GTA	2	6	3091	3096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803321
16	NC_007428	TGG	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803321
17	NC_007428	CTT	2	6	3124	3129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803321
18	NC_007428	AGT	2	6	3168	3173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803321
19	NC_007428	TCC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
20	NC_007428	CGG	2	6	3299	3304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803321
21	NC_007428	TCC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
22	NC_007428	TCG	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
23	NC_007428	GTC	2	6	3392	3397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
24	NC_007428	CAG	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803321
25	NC_007428	GAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803321
26	NC_007428	GCT	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
27	NC_007428	CGG	2	6	3627	3632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803321
28	NC_007428	CAT	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
29	NC_007428	ATC	2	6	3783	3788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
30	NC_007428	GCG	2	6	3791	3796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803322
31	NC_007428	CTT	2	6	3828	3833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803322
32	NC_007428	TCG	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
33	NC_007428	CGT	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
34	NC_007428	TCG	2	6	4021	4026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
35	NC_007428	CGT	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
36	NC_007428	GGC	3	9	4062	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803322
37	NC_007428	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
38	NC_007428	TCG	3	9	4195	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
39	NC_007428	GTC	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803323
40	NC_007428	GCC	2	6	4261	4266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803323
41	NC_007428	GCT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803323
42	NC_007428	CGG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803323
43	NC_007428	CGG	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803324
44	NC_007428	GAT	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803324
45	NC_007428	AGG	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803324
46	NC_007428	GTC	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
47	NC_007428	TGC	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
48	NC_007428	GCT	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
49	NC_007428	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
50	NC_007428	CTT	2	6	4870	4875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803324
51	NC_007428	CGT	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
52	NC_007428	CGG	2	6	4999	5004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803325
53	NC_007428	GAT	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803325
54	NC_007428	GGT	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803325
55	NC_007428	GCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803325
56	NC_007428	GCT	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
57	NC_007428	TCG	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
58	NC_007428	CTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803325
59	NC_007428	CGT	3	9	5298	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
60	NC_007428	TGC	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
61	NC_007428	CAT	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803326
62	NC_007428	TCG	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
63	NC_007428	GGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803326
64	NC_007428	GCT	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
65	NC_007428	GCG	2	6	5538	5543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803327
66	NC_007428	TCG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
67	NC_007428	GTG	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803327
68	NC_007428	CGT	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
69	NC_007428	CGC	2	6	5663	5668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803327
70	NC_007428	CCG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803327
71	NC_007428	CGA	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803327
72	NC_007428	AGC	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803328
73	NC_007428	CAG	2	6	5863	5868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803328
74	NC_007428	GCT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803328
75	NC_007428	CAA	2	6	6069	6074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803328
76	NC_007428	GCT	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803328
77	NC_007428	GGC	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803328
78	NC_007428	TCC	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803328
79	NC_007428	GAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803328
80	NC_007428	GCC	2	6	6275	6280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803328
81	NC_007428	CGC	2	6	6300	6305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803328
82	NC_007428	GAA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803328
83	NC_007428	CCG	2	6	6436	6441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803329
84	NC_007428	GGT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803329
85	NC_007428	TGC	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803329
86	NC_007428	CTG	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803329
87	NC_007428	GAC	3	9	6748	6756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803329
88	NC_007428	CGA	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
89	NC_007428	CGA	3	9	6777	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
90	NC_007428	CGG	2	6	6888	6893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
91	NC_007428	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803330
92	NC_007428	CGG	2	6	6999	7004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
93	NC_007428	TCG	2	6	7019	7024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
94	NC_007428	AGG	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803330
95	NC_007428	GAG	2	6	7075	7080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803330
96	NC_007428	CGA	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
97	NC_007428	CGA	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
98	NC_007428	ACT	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803330
99	NC_007428	GGT	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803330
100	NC_007428	ACA	2	6	7409	7414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803330
101	NC_007428	ACG	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
102	NC_007428	CAA	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803330
103	NC_007428	GAC	3	9	7491	7499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
104	NC_007428	GGA	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803330
105	NC_007428	CGA	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
106	NC_007428	TGC	3	9	7583	7591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
107	NC_007428	GCC	2	6	7597	7602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803330
108	NC_007428	ATC	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803330
109	NC_007428	CGG	2	6	7650	7655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
110	NC_007428	CGG	2	6	7662	7667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
111	NC_007428	GTC	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
112	NC_007428	GCT	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
113	NC_007428	CGC	2	6	7777	7782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803331
114	NC_007428	CGG	2	6	7857	7862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803331
115	NC_007428	CTG	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803331
116	NC_007428	TGA	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803331
117	NC_007428	GCG	2	6	7904	7909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803331
118	NC_007428	TGG	2	6	7911	7916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803331
119	NC_007428	CGT	2	6	7924	7929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803331
120	NC_007428	CAG	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803332
121	NC_007428	TCG	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803332
122	NC_007428	AGG	2	6	8196	8201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803332
123	NC_007428	CGA	2	6	8215	8220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803333
124	NC_007428	GCA	2	6	8288	8293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803333
125	NC_007428	GAA	2	6	8331	8336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803334
126	NC_007428	CGG	2	6	8397	8402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803334
127	NC_007428	GCG	2	6	8475	8480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803334
128	NC_007428	AGG	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803334
129	NC_007428	TTA	2	6	8815	8820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76803334
130	NC_007428	AAC	2	6	8923	8928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803334
131	NC_007428	GGT	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803334
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255	NC_007428	CGA	2	6	15156	15161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803340
256	NC_007428	GCG	2	6	15165	15170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803340
257	NC_007428	CGC	2	6	15205	15210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803340
258	NC_007428	CGT	2	6	15221	15226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803340
259	NC_007428	GAC	2	6	15370	15375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803340
260	NC_007428	CGA	2	6	15460	15465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803340
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361	NC_007428	CCT	2	6	22827	22832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803352
362	NC_007428	TCT	2	6	22839	22844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803352
363	NC_007428	GTC	2	6	22923	22928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803353
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.