MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	CTCGG	2	10	3088	3097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007427	TCCGC	2	10	6378	6387	0 %	20 %	20 %	60 %	76803376
3	NC_007427	CGGGT	2	10	6927	6936	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007427	CCGAA	2	10	8906	8915	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007427	GGGAC	2	10	9486	9495	20 %	0 %	60 %	20 %	76803380
6	NC_007427	GTTGC	2	10	13479	13488	0 %	40 %	40 %	20 %	76803383
7	NC_007427	TCCCA	2	10	15182	15191	20 %	20 %	0 %	60 %	76803384
8	NC_007427	GCGAG	2	10	15391	15400	20 %	0 %	60 %	20 %	76803384
9	NC_007427	AAGCC	2	10	15555	15564	40 %	0 %	20 %	40 %	76803384
10	NC_007427	CCCGG	2	10	21125	21134	0 %	0 %	40 %	60 %	76803389
11	NC_007427	TCCCA	2	10	23253	23262	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_007427	GGGCT	2	10	23822	23831	0 %	20 %	60 %	20 %	76803393
13	NC_007427	CGATT	2	10	24785	24794	20 %	40 %	20 %	20 %	76803393
14	NC_007427	GGACG	2	10	26803	26812	20 %	0 %	60 %	20 %	76803395
15	NC_007427	AGACG	2	10	27088	27097	40 %	0 %	40 %	20 %	76803395
16	NC_007427	GACCA	2	10	27191	27200	40 %	0 %	20 %	40 %	76803395
17	NC_007427	CCGGT	2	10	28263	28272	0 %	20 %	40 %	40 %	76803396
18	NC_007427	CTGAG	2	10	29906	29915	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007427	CCAGC	2	10	30464	30473	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007427	ATATA	2	10	30881	30890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007427	TGATT	2	10	31297	31306	20 %	60 %	20 %	0 %	76803400
22	NC_007427	TACAG	2	10	37244	37253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007427	CGCCC	2	10	39311	39320	0 %	0 %	20 %	80 %	76803408
24	NC_007427	CATCG	2	10	40215	40224	20 %	20 %	20 %	40 %	76803409
25	NC_007427	GTTTC	2	10	41341	41350	0 %	60 %	20 %	20 %	76803410
26	NC_007427	GCGGT	2	10	41661	41670	0 %	20 %	60 %	20 %	76803411
27	NC_007427	GTTTC	2	10	44714	44723	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007427	GTGCT	2	10	44910	44919	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007427	TGCCG	2	10	47299	47308	0 %	20 %	40 %	40 %	76803417
30	NC_007427	GCCGG	2	10	47861	47870	0 %	0 %	60 %	40 %	76803417
31	NC_007427	ATTTT	2	10	52732	52741	20 %	80 %	0 %	0 %	76803422
32	NC_007427	TCACG	2	10	52901	52910	20 %	20 %	20 %	40 %	76803422
33	NC_007427	CGGGA	2	10	57862	57871	20 %	0 %	60 %	20 %	76803426
34	NC_007427	CTCGC	2	10	58056	58065	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_007427	GAACG	2	10	58436	58445	40 %	0 %	40 %	20 %	76803427
36	NC_007427	CACGC	2	10	59869	59878	20 %	0 %	20 %	60 %	76803429
37	NC_007427	CCCAA	2	10	62062	62071	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_007427	CCAGT	2	10	66276	66285	20 %	20 %	20 %	40 %	76803436
39	NC_007427	TCGTC	2	10	68287	68296	0 %	40 %	20 %	40 %	76803439
40	NC_007427	ATCGA	2	10	69054	69063	40 %	20 %	20 %	20 %	76803441
41	NC_007427	ACTGG	2	10	69388	69397	20 %	20 %	40 %	20 %	76803441
42	NC_007427	CGGTT	2	10	70622	70631	0 %	40 %	40 %	20 %	76803442
43	NC_007427	AGTGA	2	10	71200	71209	40 %	20 %	40 %	0 %	76803442
44	NC_007427	CGGGA	2	10	71868	71877	20 %	0 %	60 %	20 %	76803443
45	NC_007427	CGGGC	2	10	74914	74923	0 %	0 %	60 %	40 %	76803446
46	NC_007427	TGATT	2	10	76045	76054	20 %	60 %	20 %	0 %	76803446
47	NC_007427	ATGTC	2	10	76230	76239	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007427	CCAAC	2	10	79150	79159	40 %	0 %	0 %	60 %	76803449
49	NC_007427	CGATT	2	10	81302	81311	20 %	40 %	20 %	20 %	76803450
50	NC_007427	CGGGC	2	10	82122	82131	0 %	0 %	60 %	40 %	76803451
51	NC_007427	TTCCT	2	10	85780	85789	0 %	60 %	0 %	40 %	76803454
52	NC_007427	CTGAC	2	10	87503	87512	20 %	20 %	20 %	40 %	76803456
53	NC_007427	CGAAG	2	10	87687	87696	40 %	0 %	40 %	20 %	76803456
54	NC_007427	CGCTG	2	10	87900	87909	0 %	20 %	40 %	40 %	76803456
55	NC_007427	CCGAG	2	10	89712	89721	20 %	0 %	40 %	40 %	76803458
56	NC_007427	GTATC	2	10	97500	97509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007427	ACTTA	2	10	97729	97738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007427	GACGG	2	10	99670	99679	20 %	0 %	60 %	20 %	76803462
59	NC_007427	TCGCA	2	10	99967	99976	20 %	20 %	20 %	40 %	76803463
60	NC_007427	GGTCT	2	10	100417	100426	0 %	40 %	40 %	20 %	76803463
61	NC_007427	GTATC	2	10	103113	103122	20 %	40 %	20 %	20 %	76803465
62	NC_007427	GTCGT	2	10	103665	103674	0 %	40 %	40 %	20 %	76803466
63	NC_007427	TCGAG	2	10	107617	107626	20 %	20 %	40 %	20 %	76803469
64	NC_007427	ACAGC	2	10	109275	109284	40 %	0 %	20 %	40 %	76803472
65	NC_007427	CAACT	2	10	109343	109352	40 %	20 %	0 %	40 %	76803472
66	NC_007427	GACGA	2	10	110097	110106	40 %	0 %	40 %	20 %	76803473
67	NC_007427	CTTCC	2	10	111161	111170	0 %	40 %	0 %	60 %	76803474
68	NC_007427	GGTCG	2	10	111490	111499	0 %	20 %	60 %	20 %	76803474
69	NC_007427	GTGAA	2	10	111994	112003	40 %	20 %	40 %	0 %	76803475
70	NC_007427	TGACG	2	10	113837	113846	20 %	20 %	40 %	20 %	76803478
71	NC_007427	TTGGT	2	10	114059	114068	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007427	CCCGG	2	10	114864	114873	0 %	0 %	40 %	60 %	76803479
73	NC_007427	GCAAC	2	10	116088	116097	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007427	TCGAG	2	10	120212	120221	20 %	20 %	40 %	20 %	76803485
75	NC_007427	GCTGT	2	10	120240	120249	0 %	40 %	40 %	20 %	76803485
76	NC_007427	GTGTC	2	10	121148	121157	0 %	40 %	40 %	20 %	76803486
77	NC_007427	TCCCA	2	10	121345	121354	20 %	20 %	0 %	60 %	76803486
78	NC_007427	TGGGA	2	10	123322	123331	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007427	CGTTC	2	10	123864	123873	0 %	40 %	20 %	40 %	76803487
80	NC_007427	CTTGC	2	10	125760	125769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007427	ACGAT	2	10	126257	126266	40 %	20 %	20 %	20 %	76803489

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.