MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	CTCA	2	8	485	492	25 %	25 %	0 %	50 %	76803368
2	NC_007427	AGGA	2	8	1279	1286	50 %	0 %	50 %	0 %	76803368
3	NC_007427	CGAC	2	8	1368	1375	25 %	0 %	25 %	50 %	76803368
4	NC_007427	CGAC	2	8	1445	1452	25 %	0 %	25 %	50 %	76803369
5	NC_007427	TGAA	2	8	1830	1837	50 %	25 %	25 %	0 %	76803370
6	NC_007427	TCCG	2	8	3076	3083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007427	CCGC	2	8	4319	4326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_007427	GCCG	2	8	5221	5228	0 %	0 %	50 %	50 %	76803373
9	NC_007427	TCCG	2	8	5495	5502	0 %	25 %	25 %	50 %	76803374
10	NC_007427	GCTG	2	8	5731	5738	0 %	25 %	50 %	25 %	76803375
11	NC_007427	CGTC	2	8	6282	6289	0 %	25 %	25 %	50 %	76803376
12	NC_007427	TTGT	2	8	6483	6490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007427	TGAA	2	8	6756	6763	50 %	25 %	25 %	0 %	76803377
14	NC_007427	GCTG	2	8	7248	7255	0 %	25 %	50 %	25 %	76803378
15	NC_007427	TGAC	2	8	8061	8068	25 %	25 %	25 %	25 %	76803378
16	NC_007427	CAAA	2	8	8237	8244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007427	GTCC	2	8	8488	8495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007427	CGCT	2	8	8616	8623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007427	CTGC	2	8	8680	8687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007427	CGCT	2	8	8725	8732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007427	TGAC	2	8	9074	9081	25 %	25 %	25 %	25 %	76803380
22	NC_007427	GCCC	2	8	9097	9104	0 %	0 %	25 %	75 %	76803380
23	NC_007427	CTAC	2	8	9276	9283	25 %	25 %	0 %	50 %	76803380
24	NC_007427	CGGG	2	8	9711	9718	0 %	0 %	75 %	25 %	76803380
25	NC_007427	GTCG	2	8	10212	10219	0 %	25 %	50 %	25 %	76803380
26	NC_007427	CCGA	2	8	10811	10818	25 %	0 %	25 %	50 %	76803380
27	NC_007427	CAGA	2	8	11022	11029	50 %	0 %	25 %	25 %	76803380
28	NC_007427	GACC	2	8	11237	11244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007427	TCAA	2	8	11669	11676	50 %	25 %	0 %	25 %	76803381
30	NC_007427	CGAG	2	8	12461	12468	25 %	0 %	50 %	25 %	76803382
31	NC_007427	TCCA	2	8	13047	13054	25 %	25 %	0 %	50 %	76803383
32	NC_007427	GTCC	2	8	13406	13413	0 %	25 %	25 %	50 %	76803383
33	NC_007427	GAAT	2	8	13432	13439	50 %	25 %	25 %	0 %	76803383
34	NC_007427	CGGT	2	8	13962	13969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007427	TCTG	2	8	14020	14027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007427	GGCG	2	8	14114	14121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007427	ATCA	2	8	14281	14288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007427	CCGT	2	8	14346	14353	0 %	25 %	25 %	50 %	76803384
39	NC_007427	CACG	2	8	15517	15524	25 %	0 %	25 %	50 %	76803384
40	NC_007427	TCAA	2	8	15723	15730	50 %	25 %	0 %	25 %	76803384
41	NC_007427	GGAA	2	8	15905	15912	50 %	0 %	50 %	0 %	76803385
42	NC_007427	GTCA	2	8	16972	16979	25 %	25 %	25 %	25 %	76803386
43	NC_007427	ATTT	2	8	17345	17352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007427	ATTC	2	8	17353	17360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007427	CAGC	2	8	17719	17726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007427	CGGT	2	8	18276	18283	0 %	25 %	50 %	25 %	76803387
47	NC_007427	TCAG	2	8	18669	18676	25 %	25 %	25 %	25 %	76803387
48	NC_007427	GGTC	2	8	18718	18725	0 %	25 %	50 %	25 %	76803387
49	NC_007427	GTCG	2	8	18739	18746	0 %	25 %	50 %	25 %	76803387
50	NC_007427	TCCA	2	8	18845	18852	25 %	25 %	0 %	50 %	76803387
51	NC_007427	TGAT	2	8	19731	19738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007427	ACTC	2	8	20451	20458	25 %	25 %	0 %	50 %	76803388
53	NC_007427	ATTT	2	8	21044	21051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007427	ACGG	2	8	23020	23027	25 %	0 %	50 %	25 %	76803391
55	NC_007427	TCAA	2	8	23178	23185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007427	CGAA	2	8	24383	24390	50 %	0 %	25 %	25 %	76803393
57	NC_007427	TTGC	2	8	24746	24753	0 %	50 %	25 %	25 %	76803393
58	NC_007427	GGCT	2	8	24796	24803	0 %	25 %	50 %	25 %	76803393
59	NC_007427	CCGA	2	8	24916	24923	25 %	0 %	25 %	50 %	76803394
60	NC_007427	CCCG	2	8	25624	25631	0 %	0 %	25 %	75 %	76803394
61	NC_007427	AGTG	2	8	26063	26070	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007427	GTGC	2	8	26114	26121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007427	GACA	2	8	26142	26149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007427	CGGT	2	8	26177	26184	0 %	25 %	50 %	25 %	76803395
65	NC_007427	CCGG	2	8	26218	26225	0 %	0 %	50 %	50 %	76803395
66	NC_007427	ATCG	2	8	26422	26429	25 %	25 %	25 %	25 %	76803395
67	NC_007427	CAAA	2	8	27161	27168	75 %	0 %	0 %	25 %	76803395
68	NC_007427	AACG	2	8	27211	27218	50 %	0 %	25 %	25 %	76803395
69	NC_007427	TCCG	2	8	27456	27463	0 %	25 %	25 %	50 %	76803395
70	NC_007427	CGAG	2	8	28373	28380	25 %	0 %	50 %	25 %	76803396
71	NC_007427	GGTT	2	8	28481	28488	0 %	50 %	50 %	0 %	76803396
72	NC_007427	GCCA	2	8	29069	29076	25 %	0 %	25 %	50 %	76803397
73	NC_007427	GCTG	2	8	30010	30017	0 %	25 %	50 %	25 %	76803399
74	NC_007427	AACC	2	8	30350	30357	50 %	0 %	0 %	50 %	76803399
75	NC_007427	TGGA	2	8	30498	30505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007427	ACTC	2	8	31146	31153	25 %	25 %	0 %	50 %	76803400
77	NC_007427	CTAT	2	8	31271	31278	25 %	50 %	0 %	25 %	76803400
78	NC_007427	CGAC	2	8	31869	31876	25 %	0 %	25 %	50 %	76803400
79	NC_007427	GCTG	2	8	32148	32155	0 %	25 %	50 %	25 %	76803400
80	NC_007427	CCTA	2	8	33062	33069	25 %	25 %	0 %	50 %	76803401
81	NC_007427	GAGC	2	8	33398	33405	25 %	0 %	50 %	25 %	76803402
82	NC_007427	CATT	2	8	33699	33706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007427	CCGA	2	8	34698	34705	25 %	0 %	25 %	50 %	76803403
84	NC_007427	CAAC	2	8	35857	35864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007427	GGAC	2	8	35935	35942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007427	GCAC	2	8	36212	36219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007427	GCTG	2	8	36369	36376	0 %	25 %	50 %	25 %	76803404
88	NC_007427	GCCC	2	8	36681	36688	0 %	0 %	25 %	75 %	76803404
89	NC_007427	ACGA	2	8	36909	36916	50 %	0 %	25 %	25 %	76803404
90	NC_007427	ATCC	2	8	37036	37043	25 %	25 %	0 %	50 %	76803404
91	NC_007427	CCGT	2	8	37368	37375	0 %	25 %	25 %	50 %	76803405
92	NC_007427	TCGT	2	8	37465	37472	0 %	50 %	25 %	25 %	76803405
93	NC_007427	GTGG	2	8	38053	38060	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007427	TCGC	2	8	38473	38480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007427	GTTT	2	8	38848	38855	0 %	75 %	25 %	0 %	76803407
96	NC_007427	TCGG	2	8	39937	39944	0 %	25 %	50 %	25 %	76803408
97	NC_007427	TTCG	2	8	40334	40341	0 %	50 %	25 %	25 %	76803409
98	NC_007427	GCGG	2	8	40742	40749	0 %	0 %	75 %	25 %	76803410
99	NC_007427	GTTG	2	8	40954	40961	0 %	50 %	50 %	0 %	76803410
100	NC_007427	GTCT	2	8	41390	41397	0 %	50 %	25 %	25 %	76803410
101	NC_007427	GTCG	2	8	41402	41409	0 %	25 %	50 %	25 %	76803410
102	NC_007427	TGAG	2	8	41413	41420	25 %	25 %	50 %	0 %	76803410
103	NC_007427	GATG	2	8	41541	41548	25 %	25 %	50 %	0 %	76803411
104	NC_007427	CACC	2	8	41646	41653	25 %	0 %	0 %	75 %	76803411
105	NC_007427	CCGC	2	8	41808	41815	0 %	0 %	25 %	75 %	76803411
106	NC_007427	CGGC	2	8	42342	42349	0 %	0 %	50 %	50 %	76803411
107	NC_007427	TGAC	2	8	42662	42669	25 %	25 %	25 %	25 %	76803412
108	NC_007427	ATAG	2	8	43030	43037	50 %	25 %	25 %	0 %	76803412
109	NC_007427	GCTC	2	8	43392	43399	0 %	25 %	25 %	50 %	76803413
110	NC_007427	TCGT	2	8	43498	43505	0 %	50 %	25 %	25 %	76803413
111	NC_007427	TCGT	2	8	43762	43769	0 %	50 %	25 %	25 %	76803413
112	NC_007427	CGCC	2	8	44201	44208	0 %	0 %	25 %	75 %	76803413
113	NC_007427	CAGC	3	12	44290	44301	25 %	0 %	25 %	50 %	76803413
114	NC_007427	CTAT	2	8	44439	44446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007427	GATT	2	8	45010	45017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007427	CAAC	2	8	45314	45321	50 %	0 %	0 %	50 %	76803414
117	NC_007427	GACG	2	8	46320	46327	25 %	0 %	50 %	25 %	76803415
118	NC_007427	AGGC	2	8	46690	46697	25 %	0 %	50 %	25 %	76803416
119	NC_007427	ATCT	2	8	47477	47484	25 %	50 %	0 %	25 %	76803417
120	NC_007427	CGCC	2	8	47710	47717	0 %	0 %	25 %	75 %	76803417
121	NC_007427	ATCT	2	8	47816	47823	25 %	50 %	0 %	25 %	76803417
122	NC_007427	GAGC	2	8	48335	48342	25 %	0 %	50 %	25 %	76803417
123	NC_007427	CCGC	2	8	48860	48867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_007427	CTGC	2	8	49073	49080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007427	CAAC	2	8	49235	49242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007427	CAAG	2	8	49781	49788	50 %	0 %	25 %	25 %	76803418
127	NC_007427	TCAA	2	8	49929	49936	50 %	25 %	0 %	25 %	76803418
128	NC_007427	TTCT	2	8	50398	50405	0 %	75 %	0 %	25 %	76803418
129	NC_007427	AACG	2	8	50597	50604	50 %	0 %	25 %	25 %	76803419
130	NC_007427	GGAC	2	8	50637	50644	25 %	0 %	50 %	25 %	76803419
131	NC_007427	CGAA	2	8	51696	51703	50 %	0 %	25 %	25 %	76803420
132	NC_007427	CGAG	2	8	51774	51781	25 %	0 %	50 %	25 %	76803420
133	NC_007427	GCTC	2	8	51817	51824	0 %	25 %	25 %	50 %	76803420
134	NC_007427	CGAC	2	8	52374	52381	25 %	0 %	25 %	50 %	76803421
135	NC_007427	GTCG	2	8	52595	52602	0 %	25 %	50 %	25 %	76803421
136	NC_007427	CAGT	2	8	53168	53175	25 %	25 %	25 %	25 %	76803422
137	NC_007427	AGGG	2	8	53901	53908	25 %	0 %	75 %	0 %	76803423
138	NC_007427	GCCG	2	8	54095	54102	0 %	0 %	50 %	50 %	76803423
139	NC_007427	GCGA	2	8	54386	54393	25 %	0 %	50 %	25 %	76803423
140	NC_007427	TCCT	2	8	54395	54402	0 %	50 %	0 %	50 %	76803423
141	NC_007427	CCAC	2	8	54534	54541	25 %	0 %	0 %	75 %	76803423
142	NC_007427	CAAA	2	8	54766	54773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007427	TCGT	2	8	55171	55178	0 %	50 %	25 %	25 %	76803424
144	NC_007427	GCAC	2	8	56148	56155	25 %	0 %	25 %	50 %	76803424
145	NC_007427	GCGG	2	8	56177	56184	0 %	0 %	75 %	25 %	76803424
146	NC_007427	CGAG	2	8	56374	56381	25 %	0 %	50 %	25 %	76803424
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.