MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	TCCG	2	8	3076	3083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007427	CCGC	2	8	4319	4326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_007427	TTGT	2	8	6483	6490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007427	CAAA	2	8	8237	8244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007427	GTCC	2	8	8488	8495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007427	CGCT	2	8	8616	8623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007427	CTGC	2	8	8680	8687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007427	CGCT	2	8	8725	8732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007427	GACC	2	8	11237	11244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007427	CGGT	2	8	13962	13969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007427	TCTG	2	8	14020	14027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007427	GGCG	2	8	14114	14121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007427	ATCA	2	8	14281	14288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007427	ATTT	2	8	17345	17352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007427	ATTC	2	8	17353	17360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007427	CAGC	2	8	17719	17726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007427	TGAT	2	8	19731	19738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007427	ATTT	2	8	21044	21051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007427	TCAA	2	8	23178	23185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007427	AGTG	2	8	26063	26070	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007427	GTGC	2	8	26114	26121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007427	GACA	2	8	26142	26149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007427	TGGA	2	8	30498	30505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007427	CATT	2	8	33699	33706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007427	CAAC	2	8	35857	35864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007427	GGAC	2	8	35935	35942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007427	GCAC	2	8	36212	36219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007427	GTGG	2	8	38053	38060	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007427	TCGC	2	8	38473	38480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007427	CTAT	2	8	44439	44446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007427	GATT	2	8	45010	45017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007427	CCGC	2	8	48860	48867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_007427	CTGC	2	8	49073	49080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007427	CAAC	2	8	49235	49242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007427	CAAA	2	8	54766	54773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007427	ACAT	2	8	57980	57987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007427	CGAT	2	8	59226	59233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007427	TAAC	2	8	61387	61394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007427	TGGC	2	8	61913	61920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007427	GTCG	2	8	61982	61989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007427	AGGG	2	8	64604	64611	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007427	CGAA	2	8	64648	64655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007427	TTGC	2	8	64688	64695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007427	CCGT	2	8	64892	64899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007427	AGCG	2	8	64937	64944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007427	AGTC	2	8	73092	73099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007427	AGCT	2	8	73109	73116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007427	TCAA	2	8	73133	73140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007427	TTAT	2	8	73246	73253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007427	ATTA	2	8	73505	73512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007427	AATT	2	8	73680	73687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007427	TATC	2	8	76352	76359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007427	TGGG	2	8	78940	78947	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007427	GTCA	2	8	79034	79041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007427	TCTA	2	8	79085	79092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007427	ATGG	2	8	88693	88700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007427	CTTT	2	8	88931	88938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007427	CATG	2	8	89140	89147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007427	TCAT	2	8	91646	91653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007427	GACA	2	8	95072	95079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007427	GTCT	2	8	95463	95470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007427	GGCT	2	8	95536	95543	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007427	AAGC	2	8	95592	95599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007427	CCGC	2	8	95601	95608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_007427	ATCA	2	8	97488	97495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007427	GCTA	2	8	108079	108086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007427	GAGT	2	8	109854	109861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007427	GACC	2	8	110347	110354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007427	AGTT	2	8	110414	110421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007427	CTTG	2	8	110430	110437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007427	TTCC	2	8	110592	110599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007427	AGCG	2	8	111822	111829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007427	AATA	2	8	115591	115598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007427	CTGC	2	8	117617	117624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007427	CTCC	2	8	117650	117657	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_007427	GTAG	2	8	117662	117669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007427	CGAG	2	8	117695	117702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007427	GCGG	2	8	118483	118490	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007427	AGTA	2	8	120482	120489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007427	CGAT	2	8	124614	124621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007427	GCTC	2	8	124743	124750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007427	CGAG	2	8	125939	125946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007427	TCGA	2	8	125971	125978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007427	GTCG	2	8	127148	127155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007427	CCAG	2	8	128760	128767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007427	CATA	2	8	130233	130240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007427	GGCA	2	8	130295	130302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.