MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	CTCA	2	8	485	492	25 %	25 %	0 %	50 %	76803368
2	NC_007427	AGGA	2	8	1279	1286	50 %	0 %	50 %	0 %	76803368
3	NC_007427	CGAC	2	8	1368	1375	25 %	0 %	25 %	50 %	76803368
4	NC_007427	CGAC	2	8	1445	1452	25 %	0 %	25 %	50 %	76803369
5	NC_007427	TGAA	2	8	1830	1837	50 %	25 %	25 %	0 %	76803370
6	NC_007427	GCCG	2	8	5221	5228	0 %	0 %	50 %	50 %	76803373
7	NC_007427	TCCG	2	8	5495	5502	0 %	25 %	25 %	50 %	76803374
8	NC_007427	GCTG	2	8	5731	5738	0 %	25 %	50 %	25 %	76803375
9	NC_007427	CGTC	2	8	6282	6289	0 %	25 %	25 %	50 %	76803376
10	NC_007427	TGAA	2	8	6756	6763	50 %	25 %	25 %	0 %	76803377
11	NC_007427	GCTG	2	8	7248	7255	0 %	25 %	50 %	25 %	76803378
12	NC_007427	TGAC	2	8	8061	8068	25 %	25 %	25 %	25 %	76803378
13	NC_007427	TGAC	2	8	9074	9081	25 %	25 %	25 %	25 %	76803380
14	NC_007427	GCCC	2	8	9097	9104	0 %	0 %	25 %	75 %	76803380
15	NC_007427	CTAC	2	8	9276	9283	25 %	25 %	0 %	50 %	76803380
16	NC_007427	CGGG	2	8	9711	9718	0 %	0 %	75 %	25 %	76803380
17	NC_007427	GTCG	2	8	10212	10219	0 %	25 %	50 %	25 %	76803380
18	NC_007427	CCGA	2	8	10811	10818	25 %	0 %	25 %	50 %	76803380
19	NC_007427	CAGA	2	8	11022	11029	50 %	0 %	25 %	25 %	76803380
20	NC_007427	TCAA	2	8	11669	11676	50 %	25 %	0 %	25 %	76803381
21	NC_007427	CGAG	2	8	12461	12468	25 %	0 %	50 %	25 %	76803382
22	NC_007427	TCCA	2	8	13047	13054	25 %	25 %	0 %	50 %	76803383
23	NC_007427	GTCC	2	8	13406	13413	0 %	25 %	25 %	50 %	76803383
24	NC_007427	GAAT	2	8	13432	13439	50 %	25 %	25 %	0 %	76803383
25	NC_007427	CCGT	2	8	14346	14353	0 %	25 %	25 %	50 %	76803384
26	NC_007427	CACG	2	8	15517	15524	25 %	0 %	25 %	50 %	76803384
27	NC_007427	TCAA	2	8	15723	15730	50 %	25 %	0 %	25 %	76803384
28	NC_007427	GGAA	2	8	15905	15912	50 %	0 %	50 %	0 %	76803385
29	NC_007427	GTCA	2	8	16972	16979	25 %	25 %	25 %	25 %	76803386
30	NC_007427	CGGT	2	8	18276	18283	0 %	25 %	50 %	25 %	76803387
31	NC_007427	TCAG	2	8	18669	18676	25 %	25 %	25 %	25 %	76803387
32	NC_007427	GGTC	2	8	18718	18725	0 %	25 %	50 %	25 %	76803387
33	NC_007427	GTCG	2	8	18739	18746	0 %	25 %	50 %	25 %	76803387
34	NC_007427	TCCA	2	8	18845	18852	25 %	25 %	0 %	50 %	76803387
35	NC_007427	ACTC	2	8	20451	20458	25 %	25 %	0 %	50 %	76803388
36	NC_007427	ACGG	2	8	23020	23027	25 %	0 %	50 %	25 %	76803391
37	NC_007427	CGAA	2	8	24383	24390	50 %	0 %	25 %	25 %	76803393
38	NC_007427	TTGC	2	8	24746	24753	0 %	50 %	25 %	25 %	76803393
39	NC_007427	GGCT	2	8	24796	24803	0 %	25 %	50 %	25 %	76803393
40	NC_007427	CCGA	2	8	24916	24923	25 %	0 %	25 %	50 %	76803394
41	NC_007427	CCCG	2	8	25624	25631	0 %	0 %	25 %	75 %	76803394
42	NC_007427	CGGT	2	8	26177	26184	0 %	25 %	50 %	25 %	76803395
43	NC_007427	CCGG	2	8	26218	26225	0 %	0 %	50 %	50 %	76803395
44	NC_007427	ATCG	2	8	26422	26429	25 %	25 %	25 %	25 %	76803395
45	NC_007427	CAAA	2	8	27161	27168	75 %	0 %	0 %	25 %	76803395
46	NC_007427	AACG	2	8	27211	27218	50 %	0 %	25 %	25 %	76803395
47	NC_007427	TCCG	2	8	27456	27463	0 %	25 %	25 %	50 %	76803395
48	NC_007427	CGAG	2	8	28373	28380	25 %	0 %	50 %	25 %	76803396
49	NC_007427	GGTT	2	8	28481	28488	0 %	50 %	50 %	0 %	76803396
50	NC_007427	GCCA	2	8	29069	29076	25 %	0 %	25 %	50 %	76803397
51	NC_007427	GCTG	2	8	30010	30017	0 %	25 %	50 %	25 %	76803399
52	NC_007427	AACC	2	8	30350	30357	50 %	0 %	0 %	50 %	76803399
53	NC_007427	ACTC	2	8	31146	31153	25 %	25 %	0 %	50 %	76803400
54	NC_007427	CTAT	2	8	31271	31278	25 %	50 %	0 %	25 %	76803400
55	NC_007427	CGAC	2	8	31869	31876	25 %	0 %	25 %	50 %	76803400
56	NC_007427	GCTG	2	8	32148	32155	0 %	25 %	50 %	25 %	76803400
57	NC_007427	CCTA	2	8	33062	33069	25 %	25 %	0 %	50 %	76803401
58	NC_007427	GAGC	2	8	33398	33405	25 %	0 %	50 %	25 %	76803402
59	NC_007427	CCGA	2	8	34698	34705	25 %	0 %	25 %	50 %	76803403
60	NC_007427	GCTG	2	8	36369	36376	0 %	25 %	50 %	25 %	76803404
61	NC_007427	GCCC	2	8	36681	36688	0 %	0 %	25 %	75 %	76803404
62	NC_007427	ACGA	2	8	36909	36916	50 %	0 %	25 %	25 %	76803404
63	NC_007427	ATCC	2	8	37036	37043	25 %	25 %	0 %	50 %	76803404
64	NC_007427	CCGT	2	8	37368	37375	0 %	25 %	25 %	50 %	76803405
65	NC_007427	TCGT	2	8	37465	37472	0 %	50 %	25 %	25 %	76803405
66	NC_007427	GTTT	2	8	38848	38855	0 %	75 %	25 %	0 %	76803407
67	NC_007427	TCGG	2	8	39937	39944	0 %	25 %	50 %	25 %	76803408
68	NC_007427	TTCG	2	8	40334	40341	0 %	50 %	25 %	25 %	76803409
69	NC_007427	GCGG	2	8	40742	40749	0 %	0 %	75 %	25 %	76803410
70	NC_007427	GTTG	2	8	40954	40961	0 %	50 %	50 %	0 %	76803410
71	NC_007427	GTCT	2	8	41390	41397	0 %	50 %	25 %	25 %	76803410
72	NC_007427	GTCG	2	8	41402	41409	0 %	25 %	50 %	25 %	76803410
73	NC_007427	TGAG	2	8	41413	41420	25 %	25 %	50 %	0 %	76803410
74	NC_007427	GATG	2	8	41541	41548	25 %	25 %	50 %	0 %	76803411
75	NC_007427	CACC	2	8	41646	41653	25 %	0 %	0 %	75 %	76803411
76	NC_007427	CCGC	2	8	41808	41815	0 %	0 %	25 %	75 %	76803411
77	NC_007427	CGGC	2	8	42342	42349	0 %	0 %	50 %	50 %	76803411
78	NC_007427	TGAC	2	8	42662	42669	25 %	25 %	25 %	25 %	76803412
79	NC_007427	ATAG	2	8	43030	43037	50 %	25 %	25 %	0 %	76803412
80	NC_007427	GCTC	2	8	43392	43399	0 %	25 %	25 %	50 %	76803413
81	NC_007427	TCGT	2	8	43498	43505	0 %	50 %	25 %	25 %	76803413
82	NC_007427	TCGT	2	8	43762	43769	0 %	50 %	25 %	25 %	76803413
83	NC_007427	CGCC	2	8	44201	44208	0 %	0 %	25 %	75 %	76803413
84	NC_007427	CAGC	3	12	44290	44301	25 %	0 %	25 %	50 %	76803413
85	NC_007427	CAAC	2	8	45314	45321	50 %	0 %	0 %	50 %	76803414
86	NC_007427	GACG	2	8	46320	46327	25 %	0 %	50 %	25 %	76803415
87	NC_007427	AGGC	2	8	46690	46697	25 %	0 %	50 %	25 %	76803416
88	NC_007427	ATCT	2	8	47477	47484	25 %	50 %	0 %	25 %	76803417
89	NC_007427	CGCC	2	8	47710	47717	0 %	0 %	25 %	75 %	76803417
90	NC_007427	ATCT	2	8	47816	47823	25 %	50 %	0 %	25 %	76803417
91	NC_007427	GAGC	2	8	48335	48342	25 %	0 %	50 %	25 %	76803417
92	NC_007427	CAAG	2	8	49781	49788	50 %	0 %	25 %	25 %	76803418
93	NC_007427	TCAA	2	8	49929	49936	50 %	25 %	0 %	25 %	76803418
94	NC_007427	TTCT	2	8	50398	50405	0 %	75 %	0 %	25 %	76803418
95	NC_007427	AACG	2	8	50597	50604	50 %	0 %	25 %	25 %	76803419
96	NC_007427	GGAC	2	8	50637	50644	25 %	0 %	50 %	25 %	76803419
97	NC_007427	CGAA	2	8	51696	51703	50 %	0 %	25 %	25 %	76803420
98	NC_007427	CGAG	2	8	51774	51781	25 %	0 %	50 %	25 %	76803420
99	NC_007427	GCTC	2	8	51817	51824	0 %	25 %	25 %	50 %	76803420
100	NC_007427	CGAC	2	8	52374	52381	25 %	0 %	25 %	50 %	76803421
101	NC_007427	GTCG	2	8	52595	52602	0 %	25 %	50 %	25 %	76803421
102	NC_007427	CAGT	2	8	53168	53175	25 %	25 %	25 %	25 %	76803422
103	NC_007427	AGGG	2	8	53901	53908	25 %	0 %	75 %	0 %	76803423
104	NC_007427	GCCG	2	8	54095	54102	0 %	0 %	50 %	50 %	76803423
105	NC_007427	GCGA	2	8	54386	54393	25 %	0 %	50 %	25 %	76803423
106	NC_007427	TCCT	2	8	54395	54402	0 %	50 %	0 %	50 %	76803423
107	NC_007427	CCAC	2	8	54534	54541	25 %	0 %	0 %	75 %	76803423
108	NC_007427	TCGT	2	8	55171	55178	0 %	50 %	25 %	25 %	76803424
109	NC_007427	GCAC	2	8	56148	56155	25 %	0 %	25 %	50 %	76803424
110	NC_007427	GCGG	2	8	56177	56184	0 %	0 %	75 %	25 %	76803424
111	NC_007427	CGAG	2	8	56374	56381	25 %	0 %	50 %	25 %	76803424
112	NC_007427	ATGA	2	8	56586	56593	50 %	25 %	25 %	0 %	76803424
113	NC_007427	CGAG	2	8	56902	56909	25 %	0 %	50 %	25 %	76803424
114	NC_007427	GCGG	2	8	57182	57189	0 %	0 %	75 %	25 %	76803424
115	NC_007427	TCGC	2	8	57775	57782	0 %	25 %	25 %	50 %	76803426
116	NC_007427	CTCG	2	8	58945	58952	0 %	25 %	25 %	50 %	76803428
117	NC_007427	AGAA	2	8	59672	59679	75 %	0 %	25 %	0 %	76803429
118	NC_007427	CGTG	2	8	59821	59828	0 %	25 %	50 %	25 %	76803429
119	NC_007427	TTTC	2	8	60295	60302	0 %	75 %	0 %	25 %	76803429
120	NC_007427	TCGA	2	8	60895	60902	25 %	25 %	25 %	25 %	76803430
121	NC_007427	TGAC	2	8	61876	61883	25 %	25 %	25 %	25 %	76803432
122	NC_007427	TCAC	2	8	63177	63184	25 %	25 %	0 %	50 %	76803433
123	NC_007427	ACGA	2	8	63610	63617	50 %	0 %	25 %	25 %	76803434
124	NC_007427	AATA	2	8	63901	63908	75 %	25 %	0 %	0 %	76803435
125	NC_007427	CGGA	2	8	64252	64259	25 %	0 %	50 %	25 %	76803435
126	NC_007427	CCGC	2	8	65465	65472	0 %	0 %	25 %	75 %	76803436
127	NC_007427	CGCT	3	12	66073	66084	0 %	25 %	25 %	50 %	76803436
128	NC_007427	CGTT	2	8	66218	66225	0 %	50 %	25 %	25 %	76803436
129	NC_007427	CGGA	2	8	66478	66485	25 %	0 %	50 %	25 %	76803437
130	NC_007427	AGGG	2	8	66524	66531	25 %	0 %	75 %	0 %	76803437
131	NC_007427	CGTC	2	8	66595	66602	0 %	25 %	25 %	50 %	76803437
132	NC_007427	AGCG	2	8	67063	67070	25 %	0 %	50 %	25 %	76803438
133	NC_007427	TCCG	2	8	68052	68059	0 %	25 %	25 %	50 %	76803439
134	NC_007427	GTTC	2	8	68083	68090	0 %	50 %	25 %	25 %	76803439
135	NC_007427	CGAG	2	8	68192	68199	25 %	0 %	50 %	25 %	76803439
136	NC_007427	GAAC	2	8	68687	68694	50 %	0 %	25 %	25 %	76803441
137	NC_007427	TTCC	2	8	69422	69429	0 %	50 %	0 %	50 %	76803441
138	NC_007427	GCCA	2	8	70455	70462	25 %	0 %	25 %	50 %	76803442
139	NC_007427	AGTC	2	8	70893	70900	25 %	25 %	25 %	25 %	76803442
140	NC_007427	GACG	2	8	71073	71080	25 %	0 %	50 %	25 %	76803442
141	NC_007427	TCGA	2	8	71188	71195	25 %	25 %	25 %	25 %	76803442
142	NC_007427	CCTT	2	8	71890	71897	0 %	50 %	0 %	50 %	76803443
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280	NC_007427	TGAC	2	8	129657	129664	25 %	25 %	25 %	25 %	76803491
281	NC_007427	GGAC	2	8	129700	129707	25 %	0 %	50 %	25 %	76803491
282	NC_007427	GTCG	2	8	129964	129971	0 %	25 %	50 %	25 %	76803491
283	NC_007427	CGAT	2	8	130038	130045	25 %	25 %	25 %	25 %	76803491
284	NC_007427	GAGT	2	8	130094	130101	25 %	25 %	50 %	0 %	76803491
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286	NC_007427	GTCG	2	8	130703	130710	0 %	25 %	50 %	25 %	76803492

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.