MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 1693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	CGA	2	6	128	133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
2	NC_007427	TCG	2	6	211	216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
3	NC_007427	CCG	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
4	NC_007427	GCT	2	6	372	377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
5	NC_007427	ACG	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
6	NC_007427	GCC	2	6	459	464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
7	NC_007427	ACC	2	6	549	554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803368
8	NC_007427	TTC	2	6	598	603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803368
9	NC_007427	CCG	2	6	718	723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
10	NC_007427	GCC	2	6	777	782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
11	NC_007427	GAC	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
12	NC_007427	GTC	2	6	822	827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
13	NC_007427	GAC	2	6	930	935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
14	NC_007427	GAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803368
15	NC_007427	TCA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803368
16	NC_007427	AGA	2	6	1028	1033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803368
17	NC_007427	GGC	2	6	1124	1129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803368
18	NC_007427	CGG	2	6	1140	1145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803368
19	NC_007427	TCC	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803368
20	NC_007427	CAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803368
21	NC_007427	CGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
22	NC_007427	TGG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803369
23	NC_007427	CGA	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803369
24	NC_007427	TCG	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803369
25	NC_007427	GTT	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803370
26	NC_007427	GAT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803370
27	NC_007427	CAG	2	6	1942	1947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803370
28	NC_007427	TTC	2	6	1994	1999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803370
29	NC_007427	TAC	2	6	2045	2050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803370
30	NC_007427	ATC	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803370
31	NC_007427	TGT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803370
32	NC_007427	AGT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803370
33	NC_007427	CAA	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803370
34	NC_007427	CCG	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803370
35	NC_007427	CTC	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803370
36	NC_007427	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803370
37	NC_007427	GGT	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803371
38	NC_007427	ATC	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803371
39	NC_007427	GTC	2	6	3279	3284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803371
40	NC_007427	AAG	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
41	NC_007427	GAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
42	NC_007427	CAG	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
43	NC_007427	GCA	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
44	NC_007427	TCA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803371
45	NC_007427	CGA	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
46	NC_007427	CGG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803371
47	NC_007427	CAG	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
48	NC_007427	GAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
49	NC_007427	TCT	2	6	3986	3991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803371
50	NC_007427	CTC	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803372
51	NC_007427	CTC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803373
52	NC_007427	TCG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
53	NC_007427	CGC	2	6	4751	4756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803373
54	NC_007427	CGA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
55	NC_007427	GCG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803373
56	NC_007427	TCG	2	6	4869	4874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
57	NC_007427	CGT	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
58	NC_007427	GTA	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803373
59	NC_007427	ACG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
60	NC_007427	CGA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
61	NC_007427	TCG	3	9	5237	5245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
62	NC_007427	CCG	2	6	5259	5264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803374
63	NC_007427	CGT	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
64	NC_007427	GTC	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
65	NC_007427	GTA	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803374
66	NC_007427	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
67	NC_007427	CGA	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803374
68	NC_007427	CCG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803374
69	NC_007427	TCG	2	6	5582	5587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
70	NC_007427	TCG	3	9	5804	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803375
71	NC_007427	TCG	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803375
72	NC_007427	TCG	2	6	6104	6109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
73	NC_007427	CTC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803376
74	NC_007427	GTG	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803376
75	NC_007427	GTC	2	6	6202	6207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
76	NC_007427	TCG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
77	NC_007427	GTC	2	6	6334	6339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
78	NC_007427	GTC	2	6	6391	6396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
79	NC_007427	TCG	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
80	NC_007427	GAC	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803377
81	NC_007427	TTC	2	6	6789	6794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803377
82	NC_007427	CGA	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803377
83	NC_007427	GCT	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
84	NC_007427	TGA	3	9	7308	7316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803378
85	NC_007427	GAA	2	6	7339	7344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803378
86	NC_007427	GAT	3	9	7408	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803378
87	NC_007427	GAC	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803378
88	NC_007427	GCT	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
89	NC_007427	CGA	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803378
90	NC_007427	CGG	2	6	7575	7580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803378
91	NC_007427	GTC	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
92	NC_007427	CGA	3	9	7608	7616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803378
93	NC_007427	ACT	2	6	7662	7667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803378
94	NC_007427	GAG	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803378
95	NC_007427	CTG	2	6	8016	8021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803378
96	NC_007427	CTT	2	6	8169	8174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803379
97	NC_007427	CGT	2	6	8217	8222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803379
98	NC_007427	AAC	2	6	8964	8969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803380
99	NC_007427	CGA	3	9	8997	9005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
100	NC_007427	TGC	2	6	9024	9029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
101	NC_007427	CTT	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803380
102	NC_007427	GAC	2	6	9049	9054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
103	NC_007427	ATC	2	6	9127	9132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803380
104	NC_007427	CAA	2	6	9358	9363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803380
105	NC_007427	CGA	2	6	9411	9416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
106	NC_007427	CCT	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803380
107	NC_007427	TCA	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803380
108	NC_007427	CTG	2	6	9587	9592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
109	NC_007427	TCG	2	6	9701	9706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
110	NC_007427	GCT	2	6	9780	9785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
111	NC_007427	CTC	2	6	9862	9867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803380
112	NC_007427	AGA	2	6	9879	9884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803380
113	NC_007427	CGT	2	6	9897	9902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
114	NC_007427	CGA	2	6	9921	9926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
115	NC_007427	CAG	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
116	NC_007427	ATT	2	6	10279	10284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76803380
117	NC_007427	TCA	2	6	10457	10462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803380
118	NC_007427	CAA	2	6	10504	10509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803380
119	NC_007427	CAG	2	6	10513	10518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803380
120	NC_007427	CGT	2	6	10536	10541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803380
121	NC_007427	TGA	2	6	10665	10670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803380
122	NC_007427	CGG	2	6	10869	10874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803380
123	NC_007427	CGG	2	6	10992	10997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803380
124	NC_007427	TTG	2	6	11030	11035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803380
125	NC_007427	TGG	2	6	11076	11081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803380
126	NC_007427	CTC	2	6	11106	11111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803380
127	NC_007427	ACG	2	6	11319	11324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803381
128	NC_007427	GCA	2	6	11338	11343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803381
129	NC_007427	CGA	2	6	11512	11517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803381
130	NC_007427	CGG	2	6	11548	11553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803381
131	NC_007427	AGC	2	6	11623	11628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803381
132	NC_007427	CGA	2	6	11680	11685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803381
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145	NC_007427	CTC	2	6	12408	12413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803382
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