MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	AC	3	6	260	265	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
2	NC_007427	CA	3	6	650	655	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
3	NC_007427	CT	3	6	734	739	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
4	NC_007427	TC	3	6	746	751	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
5	NC_007427	CG	3	6	3109	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007427	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
7	NC_007427	GA	3	6	3568	3573	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
8	NC_007427	TG	3	6	4157	4162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007427	TC	3	6	4513	4518	0 %	50 %	0 %	50 %	76803372
10	NC_007427	GT	3	6	4963	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	76803373
11	NC_007427	GA	3	6	6263	6268	50 %	0 %	50 %	0 %	76803376
12	NC_007427	CT	3	6	7534	7539	0 %	50 %	0 %	50 %	76803378
13	NC_007427	GT	4	8	8576	8583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007427	CA	3	6	10251	10256	50 %	0 %	0 %	50 %	76803380
15	NC_007427	AC	3	6	10353	10358	50 %	0 %	0 %	50 %	76803380
16	NC_007427	AC	3	6	10385	10390	50 %	0 %	0 %	50 %	76803380
17	NC_007427	CT	3	6	11637	11642	0 %	50 %	0 %	50 %	76803381
18	NC_007427	AG	3	6	11774	11779	50 %	0 %	50 %	0 %	76803381
19	NC_007427	GA	3	6	13978	13983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007427	GA	4	8	16449	16456	50 %	0 %	50 %	0 %	76803386
21	NC_007427	CG	3	6	16630	16635	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
22	NC_007427	GC	3	6	16821	16826	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
23	NC_007427	CG	3	6	17113	17118	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
24	NC_007427	AC	3	6	17318	17323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007427	AG	3	6	17418	17423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007427	TG	3	6	17505	17510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007427	GA	3	6	17848	17853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007427	TC	4	8	19847	19854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007427	GA	3	6	20348	20353	50 %	0 %	50 %	0 %	76803388
30	NC_007427	AT	3	6	20734	20739	50 %	50 %	0 %	0 %	76803388
31	NC_007427	GA	3	6	21303	21308	50 %	0 %	50 %	0 %	76803389
32	NC_007427	AG	3	6	21652	21657	50 %	0 %	50 %	0 %	76803389
33	NC_007427	TC	3	6	21906	21911	0 %	50 %	0 %	50 %	76803390
34	NC_007427	GA	3	6	22243	22248	50 %	0 %	50 %	0 %	76803390
35	NC_007427	GT	3	6	23125	23130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007427	GT	3	6	24213	24218	0 %	50 %	50 %	0 %	76803393
37	NC_007427	CA	3	6	24304	24309	50 %	0 %	0 %	50 %	76803393
38	NC_007427	CA	3	6	26398	26403	50 %	0 %	0 %	50 %	76803395
39	NC_007427	CA	3	6	26491	26496	50 %	0 %	0 %	50 %	76803395
40	NC_007427	CG	3	6	26605	26610	0 %	0 %	50 %	50 %	76803395
41	NC_007427	GA	3	6	26766	26771	50 %	0 %	50 %	0 %	76803395
42	NC_007427	CA	3	6	27810	27815	50 %	0 %	0 %	50 %	76803395
43	NC_007427	GA	3	6	27984	27989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007427	AC	3	6	28124	28129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007427	GT	3	6	28199	28204	0 %	50 %	50 %	0 %	76803396
46	NC_007427	CT	3	6	29167	29172	0 %	50 %	0 %	50 %	76803397
47	NC_007427	AC	3	6	30121	30126	50 %	0 %	0 %	50 %	76803399
48	NC_007427	AT	3	6	30571	30576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007427	AT	3	6	30675	30680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007427	TC	3	6	31287	31292	0 %	50 %	0 %	50 %	76803400
51	NC_007427	CT	3	6	31930	31935	0 %	50 %	0 %	50 %	76803400
52	NC_007427	GT	3	6	32370	32375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007427	AC	3	6	33144	33149	50 %	0 %	0 %	50 %	76803402
54	NC_007427	CA	3	6	33246	33251	50 %	0 %	0 %	50 %	76803402
55	NC_007427	TG	3	6	33337	33342	0 %	50 %	50 %	0 %	76803402
56	NC_007427	CG	3	6	34213	34218	0 %	0 %	50 %	50 %	76803403
57	NC_007427	GT	3	6	34558	34563	0 %	50 %	50 %	0 %	76803403
58	NC_007427	GC	3	6	35150	35155	0 %	0 %	50 %	50 %	76803403
59	NC_007427	GA	3	6	35506	35511	50 %	0 %	50 %	0 %	76803403
60	NC_007427	AG	3	6	36157	36162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007427	CA	3	6	36479	36484	50 %	0 %	0 %	50 %	76803404
62	NC_007427	CG	3	6	36727	36732	0 %	0 %	50 %	50 %	76803404
63	NC_007427	CA	4	8	37207	37214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007427	TC	3	6	37226	37231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007427	AC	3	6	37287	37292	50 %	0 %	0 %	50 %	76803405
66	NC_007427	CG	3	6	38012	38017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007427	TG	3	6	39293	39298	0 %	50 %	50 %	0 %	76803408
68	NC_007427	AT	3	6	40259	40264	50 %	50 %	0 %	0 %	76803409
69	NC_007427	TC	3	6	43539	43544	0 %	50 %	0 %	50 %	76803413
70	NC_007427	CG	3	6	43861	43866	0 %	0 %	50 %	50 %	76803413
71	NC_007427	TC	3	6	43877	43882	0 %	50 %	0 %	50 %	76803413
72	NC_007427	GT	3	6	44365	44370	0 %	50 %	50 %	0 %	76803413
73	NC_007427	TA	3	6	44472	44477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007427	TA	3	6	44482	44487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007427	TC	3	6	44628	44633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007427	CT	3	6	45410	45415	0 %	50 %	0 %	50 %	76803414
77	NC_007427	TC	3	6	45933	45938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007427	AG	4	8	45985	45992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007427	TG	3	6	46654	46659	0 %	50 %	50 %	0 %	76803416
80	NC_007427	CA	3	6	46816	46821	50 %	0 %	0 %	50 %	76803416
81	NC_007427	GC	3	6	46975	46980	0 %	0 %	50 %	50 %	76803416
82	NC_007427	CT	3	6	47154	47159	0 %	50 %	0 %	50 %	76803416
83	NC_007427	CT	3	6	48877	48882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007427	AG	3	6	49145	49150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007427	CA	3	6	50567	50572	50 %	0 %	0 %	50 %	76803419
86	NC_007427	CG	3	6	52096	52101	0 %	0 %	50 %	50 %	76803421
87	NC_007427	AC	3	6	55893	55898	50 %	0 %	0 %	50 %	76803424
88	NC_007427	TC	3	6	55985	55990	0 %	50 %	0 %	50 %	76803424
89	NC_007427	CT	3	6	56805	56810	0 %	50 %	0 %	50 %	76803424
90	NC_007427	GA	3	6	60084	60089	50 %	0 %	50 %	0 %	76803429
91	NC_007427	TA	3	6	61347	61352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007427	CG	3	6	61747	61752	0 %	0 %	50 %	50 %	76803432
93	NC_007427	AC	3	6	62014	62019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007427	CA	3	6	62548	62553	50 %	0 %	0 %	50 %	76803433
95	NC_007427	GA	3	6	62875	62880	50 %	0 %	50 %	0 %	76803433
96	NC_007427	CT	3	6	63156	63161	0 %	50 %	0 %	50 %	76803433
97	NC_007427	AT	3	6	63404	63409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007427	AT	3	6	64416	64421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007427	AT	3	6	65100	65105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007427	TC	3	6	65151	65156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007427	CT	3	6	65575	65580	0 %	50 %	0 %	50 %	76803436
102	NC_007427	GT	3	6	67169	67174	0 %	50 %	50 %	0 %	76803438
103	NC_007427	TA	3	6	67775	67780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007427	CT	3	6	67899	67904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007427	CA	3	6	67938	67943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007427	CG	3	6	68014	68019	0 %	0 %	50 %	50 %	76803439
107	NC_007427	GA	3	6	70304	70309	50 %	0 %	50 %	0 %	76803442
108	NC_007427	TC	3	6	70488	70493	0 %	50 %	0 %	50 %	76803442
109	NC_007427	GT	3	6	71493	71498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007427	GT	3	6	71519	71524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007427	GC	3	6	72163	72168	0 %	0 %	50 %	50 %	76803444
112	NC_007427	GT	3	6	72457	72462	0 %	50 %	50 %	0 %	76803444
113	NC_007427	AC	3	6	76924	76929	50 %	0 %	0 %	50 %	76803447
114	NC_007427	GA	3	6	77020	77025	50 %	0 %	50 %	0 %	76803447
115	NC_007427	CG	4	8	77387	77394	0 %	0 %	50 %	50 %	76803447
116	NC_007427	GC	3	6	77559	77564	0 %	0 %	50 %	50 %	76803448
117	NC_007427	AC	3	6	78695	78700	50 %	0 %	0 %	50 %	76803448
118	NC_007427	CT	3	6	78845	78850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007427	TA	3	6	79116	79121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007427	AT	3	6	79472	79477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007427	GA	3	6	81130	81135	50 %	0 %	50 %	0 %	76803450
122	NC_007427	AT	3	6	81423	81428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007427	GA	3	6	81617	81622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007427	GT	3	6	83873	83878	0 %	50 %	50 %	0 %	76803452
125	NC_007427	CA	3	6	84177	84182	50 %	0 %	0 %	50 %	76803452
126	NC_007427	TA	3	6	84820	84825	50 %	50 %	0 %	0 %	76803453
127	NC_007427	GA	3	6	85543	85548	50 %	0 %	50 %	0 %	76803454
128	NC_007427	TC	3	6	86186	86191	0 %	50 %	0 %	50 %	76803454
129	NC_007427	GC	3	6	88160	88165	0 %	0 %	50 %	50 %	76803457
130	NC_007427	TA	4	8	89065	89072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007427	GA	3	6	89168	89173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007427	TC	3	6	91107	91112	0 %	50 %	0 %	50 %	76803458
133	NC_007427	AT	4	8	91687	91694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007427	AT	3	6	92792	92797	50 %	50 %	0 %	0 %	76803459
135	NC_007427	AC	3	6	93106	93111	50 %	0 %	0 %	50 %	76803460
136	NC_007427	TG	3	6	93897	93902	0 %	50 %	50 %	0 %	76803460
137	NC_007427	CT	3	6	95054	95059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007427	GA	3	6	95132	95137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007427	GT	3	6	95260	95265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007427	TC	3	6	95479	95484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007427	TG	3	6	95814	95819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007427	CG	3	6	96636	96641	0 %	0 %	50 %	50 %	76803461
143	NC_007427	CA	3	6	96944	96949	50 %	0 %	0 %	50 %	76803461
144	NC_007427	AC	3	6	98515	98520	50 %	0 %	0 %	50 %	76803462
145	NC_007427	TG	3	6	99092	99097	0 %	50 %	50 %	0 %	76803462
146	NC_007427	GC	3	6	99493	99498	0 %	0 %	50 %	50 %	76803462
147	NC_007427	GC	3	6	100316	100321	0 %	0 %	50 %	50 %	76803463
148	NC_007427	CG	3	6	100987	100992	0 %	0 %	50 %	50 %	76803464
149	NC_007427	CT	3	6	101475	101480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.