MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	AC	3	6	260	265	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
2	NC_007427	CA	3	6	650	655	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
3	NC_007427	CT	3	6	734	739	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
4	NC_007427	TC	3	6	746	751	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
5	NC_007427	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
6	NC_007427	GA	3	6	3568	3573	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
7	NC_007427	TC	3	6	4513	4518	0 %	50 %	0 %	50 %	76803372
8	NC_007427	GT	3	6	4963	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	76803373
9	NC_007427	GA	3	6	6263	6268	50 %	0 %	50 %	0 %	76803376
10	NC_007427	CT	3	6	7534	7539	0 %	50 %	0 %	50 %	76803378
11	NC_007427	CA	3	6	10251	10256	50 %	0 %	0 %	50 %	76803380
12	NC_007427	AC	3	6	10353	10358	50 %	0 %	0 %	50 %	76803380
13	NC_007427	AC	3	6	10385	10390	50 %	0 %	0 %	50 %	76803380
14	NC_007427	CT	3	6	11637	11642	0 %	50 %	0 %	50 %	76803381
15	NC_007427	AG	3	6	11774	11779	50 %	0 %	50 %	0 %	76803381
16	NC_007427	GA	4	8	16449	16456	50 %	0 %	50 %	0 %	76803386
17	NC_007427	CG	3	6	16630	16635	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
18	NC_007427	GC	3	6	16821	16826	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
19	NC_007427	CG	3	6	17113	17118	0 %	0 %	50 %	50 %	76803386
20	NC_007427	GA	3	6	20348	20353	50 %	0 %	50 %	0 %	76803388
21	NC_007427	AT	3	6	20734	20739	50 %	50 %	0 %	0 %	76803388
22	NC_007427	GA	3	6	21303	21308	50 %	0 %	50 %	0 %	76803389
23	NC_007427	AG	3	6	21652	21657	50 %	0 %	50 %	0 %	76803389
24	NC_007427	TC	3	6	21906	21911	0 %	50 %	0 %	50 %	76803390
25	NC_007427	GA	3	6	22243	22248	50 %	0 %	50 %	0 %	76803390
26	NC_007427	GT	3	6	24213	24218	0 %	50 %	50 %	0 %	76803393
27	NC_007427	CA	3	6	24304	24309	50 %	0 %	0 %	50 %	76803393
28	NC_007427	CA	3	6	26398	26403	50 %	0 %	0 %	50 %	76803395
29	NC_007427	CA	3	6	26491	26496	50 %	0 %	0 %	50 %	76803395
30	NC_007427	CG	3	6	26605	26610	0 %	0 %	50 %	50 %	76803395
31	NC_007427	GA	3	6	26766	26771	50 %	0 %	50 %	0 %	76803395
32	NC_007427	CA	3	6	27810	27815	50 %	0 %	0 %	50 %	76803395
33	NC_007427	GT	3	6	28199	28204	0 %	50 %	50 %	0 %	76803396
34	NC_007427	CT	3	6	29167	29172	0 %	50 %	0 %	50 %	76803397
35	NC_007427	AC	3	6	30121	30126	50 %	0 %	0 %	50 %	76803399
36	NC_007427	TC	3	6	31287	31292	0 %	50 %	0 %	50 %	76803400
37	NC_007427	CT	3	6	31930	31935	0 %	50 %	0 %	50 %	76803400
38	NC_007427	AC	3	6	33144	33149	50 %	0 %	0 %	50 %	76803402
39	NC_007427	CA	3	6	33246	33251	50 %	0 %	0 %	50 %	76803402
40	NC_007427	TG	3	6	33337	33342	0 %	50 %	50 %	0 %	76803402
41	NC_007427	CG	3	6	34213	34218	0 %	0 %	50 %	50 %	76803403
42	NC_007427	GT	3	6	34558	34563	0 %	50 %	50 %	0 %	76803403
43	NC_007427	GC	3	6	35150	35155	0 %	0 %	50 %	50 %	76803403
44	NC_007427	GA	3	6	35506	35511	50 %	0 %	50 %	0 %	76803403
45	NC_007427	CA	3	6	36479	36484	50 %	0 %	0 %	50 %	76803404
46	NC_007427	CG	3	6	36727	36732	0 %	0 %	50 %	50 %	76803404
47	NC_007427	AC	3	6	37287	37292	50 %	0 %	0 %	50 %	76803405
48	NC_007427	TG	3	6	39293	39298	0 %	50 %	50 %	0 %	76803408
49	NC_007427	AT	3	6	40259	40264	50 %	50 %	0 %	0 %	76803409
50	NC_007427	TC	3	6	43539	43544	0 %	50 %	0 %	50 %	76803413
51	NC_007427	CG	3	6	43861	43866	0 %	0 %	50 %	50 %	76803413
52	NC_007427	TC	3	6	43877	43882	0 %	50 %	0 %	50 %	76803413
53	NC_007427	GT	3	6	44365	44370	0 %	50 %	50 %	0 %	76803413
54	NC_007427	CT	3	6	45410	45415	0 %	50 %	0 %	50 %	76803414
55	NC_007427	TG	3	6	46654	46659	0 %	50 %	50 %	0 %	76803416
56	NC_007427	CA	3	6	46816	46821	50 %	0 %	0 %	50 %	76803416
57	NC_007427	GC	3	6	46975	46980	0 %	0 %	50 %	50 %	76803416
58	NC_007427	CT	3	6	47154	47159	0 %	50 %	0 %	50 %	76803416
59	NC_007427	CA	3	6	50567	50572	50 %	0 %	0 %	50 %	76803419
60	NC_007427	CG	3	6	52096	52101	0 %	0 %	50 %	50 %	76803421
61	NC_007427	AC	3	6	55893	55898	50 %	0 %	0 %	50 %	76803424
62	NC_007427	TC	3	6	55985	55990	0 %	50 %	0 %	50 %	76803424
63	NC_007427	CT	3	6	56805	56810	0 %	50 %	0 %	50 %	76803424
64	NC_007427	GA	3	6	60084	60089	50 %	0 %	50 %	0 %	76803429
65	NC_007427	CG	3	6	61747	61752	0 %	0 %	50 %	50 %	76803432
66	NC_007427	CA	3	6	62548	62553	50 %	0 %	0 %	50 %	76803433
67	NC_007427	GA	3	6	62875	62880	50 %	0 %	50 %	0 %	76803433
68	NC_007427	CT	3	6	63156	63161	0 %	50 %	0 %	50 %	76803433
69	NC_007427	CT	3	6	65575	65580	0 %	50 %	0 %	50 %	76803436
70	NC_007427	GT	3	6	67169	67174	0 %	50 %	50 %	0 %	76803438
71	NC_007427	CG	3	6	68014	68019	0 %	0 %	50 %	50 %	76803439
72	NC_007427	GA	3	6	70304	70309	50 %	0 %	50 %	0 %	76803442
73	NC_007427	TC	3	6	70488	70493	0 %	50 %	0 %	50 %	76803442
74	NC_007427	GC	3	6	72163	72168	0 %	0 %	50 %	50 %	76803444
75	NC_007427	GT	3	6	72457	72462	0 %	50 %	50 %	0 %	76803444
76	NC_007427	AC	3	6	76924	76929	50 %	0 %	0 %	50 %	76803447
77	NC_007427	GA	3	6	77020	77025	50 %	0 %	50 %	0 %	76803447
78	NC_007427	CG	4	8	77387	77394	0 %	0 %	50 %	50 %	76803447
79	NC_007427	GC	3	6	77559	77564	0 %	0 %	50 %	50 %	76803448
80	NC_007427	AC	3	6	78695	78700	50 %	0 %	0 %	50 %	76803448
81	NC_007427	GA	3	6	81130	81135	50 %	0 %	50 %	0 %	76803450
82	NC_007427	GT	3	6	83873	83878	0 %	50 %	50 %	0 %	76803452
83	NC_007427	CA	3	6	84177	84182	50 %	0 %	0 %	50 %	76803452
84	NC_007427	TA	3	6	84820	84825	50 %	50 %	0 %	0 %	76803453
85	NC_007427	GA	3	6	85543	85548	50 %	0 %	50 %	0 %	76803454
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87	NC_007427	GC	3	6	88160	88165	0 %	0 %	50 %	50 %	76803457
88	NC_007427	TC	3	6	91107	91112	0 %	50 %	0 %	50 %	76803458
89	NC_007427	AT	3	6	92792	92797	50 %	50 %	0 %	0 %	76803459
90	NC_007427	AC	3	6	93106	93111	50 %	0 %	0 %	50 %	76803460
91	NC_007427	TG	3	6	93897	93902	0 %	50 %	50 %	0 %	76803460
92	NC_007427	CG	3	6	96636	96641	0 %	0 %	50 %	50 %	76803461
93	NC_007427	CA	3	6	96944	96949	50 %	0 %	0 %	50 %	76803461
94	NC_007427	AC	3	6	98515	98520	50 %	0 %	0 %	50 %	76803462
95	NC_007427	TG	3	6	99092	99097	0 %	50 %	50 %	0 %	76803462
96	NC_007427	GC	3	6	99493	99498	0 %	0 %	50 %	50 %	76803462
97	NC_007427	GC	3	6	100316	100321	0 %	0 %	50 %	50 %	76803463
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100	NC_007427	GC	3	6	104108	104113	0 %	0 %	50 %	50 %	76803466
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102	NC_007427	TG	3	6	105389	105394	0 %	50 %	50 %	0 %	76803466
103	NC_007427	AG	3	6	106009	106014	50 %	0 %	50 %	0 %	76803467
104	NC_007427	CG	3	6	106054	106059	0 %	0 %	50 %	50 %	76803467
105	NC_007427	TC	3	6	106951	106956	0 %	50 %	0 %	50 %	76803469
106	NC_007427	TG	4	8	107638	107645	0 %	50 %	50 %	0 %	76803469
107	NC_007427	AG	3	6	108437	108442	50 %	0 %	50 %	0 %	76803470
108	NC_007427	AC	3	6	108981	108986	50 %	0 %	0 %	50 %	76803471
109	NC_007427	TC	3	6	111691	111696	0 %	50 %	0 %	50 %	76803474
110	NC_007427	GA	3	6	111949	111954	50 %	0 %	50 %	0 %	76803475
111	NC_007427	GT	3	6	112711	112716	0 %	50 %	50 %	0 %	76803476
112	NC_007427	GA	3	6	112889	112894	50 %	0 %	50 %	0 %	76803477
113	NC_007427	TC	3	6	113162	113167	0 %	50 %	0 %	50 %	76803478
114	NC_007427	CT	3	6	113235	113240	0 %	50 %	0 %	50 %	76803478
115	NC_007427	GC	3	6	113935	113940	0 %	0 %	50 %	50 %	76803478
116	NC_007427	AC	3	6	114764	114769	50 %	0 %	0 %	50 %	76803479
117	NC_007427	TC	3	6	115627	115632	0 %	50 %	0 %	50 %	76803480
118	NC_007427	CA	3	6	115787	115792	50 %	0 %	0 %	50 %	76803480
119	NC_007427	CT	3	6	116523	116528	0 %	50 %	0 %	50 %	76803481
120	NC_007427	CG	3	6	119379	119384	0 %	0 %	50 %	50 %	76803485
121	NC_007427	TC	3	6	119766	119771	0 %	50 %	0 %	50 %	76803485
122	NC_007427	CT	3	6	121574	121579	0 %	50 %	0 %	50 %	76803486
123	NC_007427	TC	3	6	123549	123554	0 %	50 %	0 %	50 %	76803487
124	NC_007427	TG	4	8	123648	123655	0 %	50 %	50 %	0 %	76803487
125	NC_007427	GT	3	6	123837	123842	0 %	50 %	50 %	0 %	76803487
126	NC_007427	AG	3	6	126201	126206	50 %	0 %	50 %	0 %	76803489
127	NC_007427	CG	3	6	126577	126582	0 %	0 %	50 %	50 %	76803489
128	NC_007427	CA	3	6	127617	127622	50 %	0 %	0 %	50 %	76803490
129	NC_007427	GA	3	6	128306	128311	50 %	0 %	50 %	0 %	76803490
130	NC_007427	AG	3	6	129163	129168	50 %	0 %	50 %	0 %	76803491
131	NC_007427	GC	3	6	129291	129296	0 %	0 %	50 %	50 %	76803491

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.