MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160

Total Repeats: 1538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007426	TCGCC	2	10	548	557	0 %	20 %	20 %	60 %	76800656
2	NC_007426	CGATG	2	10	2328	2337	20 %	20 %	40 %	20 %	76800658
3	NC_007426	GGTCC	2	10	5562	5571	0 %	20 %	40 %	40 %	76800661
4	NC_007426	CCGAG	2	10	8230	8239	20 %	0 %	40 %	40 %	76800664
5	NC_007426	GACCG	2	10	8928	8937	20 %	0 %	40 %	40 %	76800665
6	NC_007426	GTCCC	2	10	9610	9619	0 %	20 %	20 %	60 %	76800666
7	NC_007426	GAGCC	2	10	11930	11939	20 %	0 %	40 %	40 %	76800670
8	NC_007426	AGCGA	2	10	12452	12461	40 %	0 %	40 %	20 %	76800670
9	NC_007426	GCACA	2	10	12544	12553	40 %	0 %	20 %	40 %	76800670
10	NC_007426	AGTCG	2	10	21182	21191	20 %	20 %	40 %	20 %	76800681
11	NC_007426	GTCGA	2	10	22391	22400	20 %	20 %	40 %	20 %	76800682
12	NC_007426	GGGCT	2	10	25551	25560	0 %	20 %	60 %	20 %	76800687
13	NC_007426	GCGCC	2	10	26025	26034	0 %	0 %	40 %	60 %	76800687
14	NC_007426	TCGAG	2	10	27889	27898	20 %	20 %	40 %	20 %	76800688
15	NC_007426	ACGTG	2	10	28760	28769	20 %	20 %	40 %	20 %	76800689
16	NC_007426	ATCGC	2	10	29112	29121	20 %	20 %	20 %	40 %	76800690
17	NC_007426	TCTCG	2	10	29430	29439	0 %	40 %	20 %	40 %	76800690
18	NC_007426	CGGCT	2	10	30464	30473	0 %	20 %	40 %	40 %	76800691
19	NC_007426	TTCTT	2	10	32825	32834	0 %	80 %	0 %	20 %	76800693
20	NC_007426	GCTCC	2	10	34848	34857	0 %	20 %	20 %	60 %	76800697
21	NC_007426	GACCG	2	10	36335	36344	20 %	0 %	40 %	40 %	76800700
22	NC_007426	AGTCG	2	10	38407	38416	20 %	20 %	40 %	20 %	76800700
23	NC_007426	GGACG	2	10	39073	39082	20 %	0 %	60 %	20 %	76800700
24	NC_007426	GCCGA	2	10	39131	39140	20 %	0 %	40 %	40 %	76800700
25	NC_007426	CGGAA	2	10	44745	44754	40 %	0 %	40 %	20 %	76800707
26	NC_007426	GGCGT	2	10	45421	45430	0 %	20 %	60 %	20 %	76800707
27	NC_007426	CAACA	2	10	47240	47249	60 %	0 %	0 %	40 %	76800709
28	NC_007426	GATGA	2	10	50792	50801	40 %	20 %	40 %	0 %	76800711
29	NC_007426	GTCCC	2	10	51509	51518	0 %	20 %	20 %	60 %	76800712
30	NC_007426	CGGCG	2	10	53302	53311	0 %	0 %	60 %	40 %	76800712
31	NC_007426	CGAAT	2	10	55619	55628	40 %	20 %	20 %	20 %	76800713
32	NC_007426	CGGCC	2	10	56076	56085	0 %	0 %	40 %	60 %	76800713
33	NC_007426	TCGAA	2	10	56886	56895	40 %	20 %	20 %	20 %	76800714
34	NC_007426	AAGCA	2	10	58352	58361	60 %	0 %	20 %	20 %	76800716
35	NC_007426	CGACG	2	10	58726	58735	20 %	0 %	40 %	40 %	76800717
36	NC_007426	GCACC	2	10	60023	60032	20 %	0 %	20 %	60 %	76800718
37	NC_007426	GGACG	2	10	60111	60120	20 %	0 %	60 %	20 %	76800718
38	NC_007426	TGGCG	2	10	62354	62363	0 %	20 %	60 %	20 %	76800720
39	NC_007426	ACGGC	2	10	64070	64079	20 %	0 %	40 %	40 %	76800721
40	NC_007426	CCCAT	2	10	65258	65267	20 %	20 %	0 %	60 %	76800721
41	NC_007426	GCACA	2	10	65674	65683	40 %	0 %	20 %	40 %	76800721
42	NC_007426	TGTCG	2	10	67881	67890	0 %	40 %	40 %	20 %	76800724
43	NC_007426	GTAAA	2	10	69306	69315	60 %	20 %	20 %	0 %	76800726
44	NC_007426	TCGTT	2	10	71949	71958	0 %	60 %	20 %	20 %	76800727
45	NC_007426	CGGCG	2	10	72165	72174	0 %	0 %	60 %	40 %	76800727
46	NC_007426	CCGAG	2	10	72998	73007	20 %	0 %	40 %	40 %	76800728
47	NC_007426	AATCG	2	10	73816	73825	40 %	20 %	20 %	20 %	76800729
48	NC_007426	GCTCG	2	10	74656	74665	0 %	20 %	40 %	40 %	76800731
49	NC_007426	GTTCC	2	10	75392	75401	0 %	40 %	20 %	40 %	76800732
50	NC_007426	AACGC	2	10	76211	76220	40 %	0 %	20 %	40 %	76800733
51	NC_007426	GCCGA	2	10	76767	76776	20 %	0 %	40 %	40 %	76800734
52	NC_007426	TCGAA	2	10	79131	79140	40 %	20 %	20 %	20 %	76800735
53	NC_007426	TGGTC	2	10	79190	79199	0 %	40 %	40 %	20 %	76800735
54	NC_007426	AAACG	2	10	79818	79827	60 %	0 %	20 %	20 %	76800735
55	NC_007426	CGGGG	2	10	80331	80340	0 %	0 %	80 %	20 %	76800735
56	NC_007426	AGCGG	2	10	81151	81160	20 %	0 %	60 %	20 %	76800736
57	NC_007426	ATCGA	2	10	81179	81188	40 %	20 %	20 %	20 %	76800736
58	NC_007426	GGTAT	2	10	81265	81274	20 %	40 %	40 %	0 %	76800737
59	NC_007426	GTTCT	2	10	83810	83819	0 %	60 %	20 %	20 %	76800739
60	NC_007426	CAGTC	2	10	84269	84278	20 %	20 %	20 %	40 %	76800739
61	NC_007426	ACCGG	2	10	84753	84762	20 %	0 %	40 %	40 %	76800740
62	NC_007426	CGGCG	2	10	85631	85640	0 %	0 %	60 %	40 %	76800741
63	NC_007426	GAGCC	2	10	85722	85731	20 %	0 %	40 %	40 %	76800741
64	NC_007426	ATCGT	2	10	86901	86910	20 %	40 %	20 %	20 %	76800742
65	NC_007426	GTCGC	2	10	87120	87129	0 %	20 %	40 %	40 %	76800742
66	NC_007426	AACGT	2	10	87540	87549	40 %	20 %	20 %	20 %	76800742
67	NC_007426	TTCTC	2	10	87789	87798	0 %	60 %	0 %	40 %	76800742
68	NC_007426	CTACG	2	10	88802	88811	20 %	20 %	20 %	40 %	76800744
69	NC_007426	TGGCA	2	10	89905	89914	20 %	20 %	40 %	20 %	76800744
70	NC_007426	GAAGC	2	10	92511	92520	40 %	0 %	40 %	20 %	76800749
71	NC_007426	GGACG	2	10	92887	92896	20 %	0 %	60 %	20 %	76800749
72	NC_007426	TTCGC	2	10	93951	93960	0 %	40 %	20 %	40 %	76800749
73	NC_007426	CCGGG	2	10	94757	94766	0 %	0 %	60 %	40 %	76800750
74	NC_007426	CGGTC	2	10	95185	95194	0 %	20 %	40 %	40 %	76800751
75	NC_007426	CCGGC	2	10	95845	95854	0 %	0 %	40 %	60 %	76800751
76	NC_007426	GGGCC	2	10	96556	96565	0 %	0 %	60 %	40 %	76800752
77	NC_007426	CATCG	2	10	97199	97208	20 %	20 %	20 %	40 %	76800752
78	NC_007426	CCTTC	2	10	100698	100707	0 %	40 %	0 %	60 %	76800756
79	NC_007426	CGGCG	2	10	100950	100959	0 %	0 %	60 %	40 %	76800756
80	NC_007426	GGTCC	2	10	102561	102570	0 %	20 %	40 %	40 %	76800757
81	NC_007426	CCAGC	2	10	104429	104438	20 %	0 %	20 %	60 %	76800758
82	NC_007426	GCCGA	2	10	104515	104524	20 %	0 %	40 %	40 %	76800758
83	NC_007426	GATTC	2	10	104529	104538	20 %	40 %	20 %	20 %	76800758
84	NC_007426	GCCGC	2	10	105877	105886	0 %	0 %	40 %	60 %	76800760
85	NC_007426	ATCGA	2	10	108722	108731	40 %	20 %	20 %	20 %	76800762
86	NC_007426	GTCGT	2	10	113388	113397	0 %	40 %	40 %	20 %	76800766
87	NC_007426	CGAGG	2	10	113675	113684	20 %	0 %	60 %	20 %	76800766
88	NC_007426	CGGGA	2	10	117923	117932	20 %	0 %	60 %	20 %	76800771
89	NC_007426	CGGCG	2	10	119531	119540	0 %	0 %	60 %	40 %	76800772
90	NC_007426	ACCGG	2	10	120254	120263	20 %	0 %	40 %	40 %	76800773
91	NC_007426	GGCCG	2	10	120619	120628	0 %	0 %	60 %	40 %	76800773
92	NC_007426	CAGCG	2	10	122971	122980	20 %	0 %	40 %	40 %	76800776
93	NC_007426	GTCGG	2	10	125221	125230	0 %	20 %	60 %	20 %	76800778
94	NC_007426	TGGCG	2	10	125980	125989	0 %	20 %	60 %	20 %	76800779
95	NC_007426	CCGTT	2	10	126920	126929	0 %	40 %	20 %	40 %	76800780
96	NC_007426	GTCGA	2	10	128532	128541	20 %	20 %	40 %	20 %	76800782
97	NC_007426	GTCGG	2	10	132440	132449	0 %	20 %	60 %	20 %	76800784
98	NC_007426	CGACT	2	10	132706	132715	20 %	20 %	20 %	40 %	76800784
99	NC_007426	GTCGC	2	10	133610	133619	0 %	20 %	40 %	40 %	76800785
100	NC_007426	CCGTC	2	10	133746	133755	0 %	20 %	20 %	60 %	76800785
101	NC_007426	GTCCG	2	10	135073	135082	0 %	20 %	40 %	40 %	76800787
102	NC_007426	AGCGG	2	10	136314	136323	20 %	0 %	60 %	20 %	76800788
103	NC_007426	TTTGA	2	10	138677	138686	20 %	60 %	20 %	0 %	76800790
104	NC_007426	GCGCC	2	10	139992	140001	0 %	0 %	40 %	60 %	76800791
105	NC_007426	CGAGT	2	10	140266	140275	20 %	20 %	40 %	20 %	76800791
106	NC_007426	CGAGC	2	10	141116	141125	20 %	0 %	40 %	40 %	76800792
107	NC_007426	CGGAA	2	10	141332	141341	40 %	0 %	40 %	20 %	76800792
108	NC_007426	CGGCG	2	10	145914	145923	0 %	0 %	60 %	40 %	76800797
109	NC_007426	CAGAA	2	10	147969	147978	60 %	0 %	20 %	20 %	76800799
110	NC_007426	CCGTT	2	10	152333	152342	0 %	40 %	20 %	40 %	76800802
111	NC_007426	CCTCT	2	10	153464	153473	0 %	40 %	0 %	60 %	76800803
112	NC_007426	AGCGA	2	10	154061	154070	40 %	0 %	40 %	20 %	76800804
113	NC_007426	ACGGC	2	10	155051	155060	20 %	0 %	40 %	40 %	76800805
114	NC_007426	CCGAC	2	10	155147	155156	20 %	0 %	20 %	60 %	76800805
115	NC_007426	CGAAG	2	10	160029	160038	40 %	0 %	40 %	20 %	76800811
116	NC_007426	AGACG	2	10	160791	160800	40 %	0 %	40 %	20 %	76800811
117	NC_007426	CGGAC	2	10	163075	163084	20 %	0 %	40 %	40 %	76800814
118	NC_007426	CGAAC	2	10	163335	163344	40 %	0 %	20 %	40 %	76800814
119	NC_007426	GAGCA	2	10	167026	167035	40 %	0 %	40 %	20 %	76800816
120	NC_007426	TGACC	2	10	167393	167402	20 %	20 %	20 %	40 %	76800816
121	NC_007426	ACAGC	2	10	167439	167448	40 %	0 %	20 %	40 %	76800816
122	NC_007426	CAGAC	2	10	170531	170540	40 %	0 %	20 %	40 %	76800818
123	NC_007426	CGGTC	2	10	170840	170849	0 %	20 %	40 %	40 %	76800819
124	NC_007426	TCGAT	2	10	173742	173751	20 %	40 %	20 %	20 %	76800820
125	NC_007426	TGCGA	2	10	175690	175699	20 %	20 %	40 %	20 %	76800822
126	NC_007426	CGGCT	2	10	177511	177520	0 %	20 %	40 %	40 %	76800823
127	NC_007426	GCGCG	2	10	179504	179513	0 %	0 %	60 %	40 %	76800827
128	NC_007426	GCCCG	2	10	184763	184772	0 %	0 %	40 %	60 %	76800834
129	NC_007426	CGTGC	2	10	187726	187735	0 %	20 %	40 %	40 %	76800835
130	NC_007426	ACCGC	2	10	189216	189225	20 %	0 %	20 %	60 %	76800837
131	NC_007426	GGCCG	2	10	189490	189499	0 %	0 %	60 %	40 %	76800837
132	NC_007426	GGCCG	2	10	189845	189854	0 %	0 %	60 %	40 %	76800837
133	NC_007426	TCTGG	2	10	189880	189889	0 %	40 %	40 %	20 %	76800837
134	NC_007426	GTCCG	2	10	192415	192424	0 %	20 %	40 %	40 %	76800839
135	NC_007426	CGGTT	2	10	196380	196389	0 %	40 %	40 %	20 %	76800844
136	NC_007426	ACGCG	2	10	197694	197703	20 %	0 %	40 %	40 %	76800846
137	NC_007426	GGAGT	2	10	198623	198632	20 %	20 %	60 %	0 %	76800846
138	NC_007426	ACGCG	2	10	200474	200483	20 %	0 %	40 %	40 %	76800851
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144	NC_007426	ACGGG	2	10	218866	218875	20 %	0 %	60 %	20 %	76800866
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150	NC_007426	CGAGG	2	10	226232	226241	20 %	0 %	60 %	20 %	76800873
151	NC_007426	GCGTC	2	10	227333	227342	0 %	20 %	40 %	40 %	76800874
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249	NC_007426	AGACC	2	10	365912	365921	40 %	0 %	20 %	40 %	76801015
250	NC_007426	GGTCA	2	10	366606	366615	20 %	20 %	40 %	20 %	76801015
251	NC_007426	ATCGA	2	10	366760	366769	40 %	20 %	20 %	20 %	76801016
252	NC_007426	GTCCG	2	10	367587	367596	0 %	20 %	40 %	40 %	76801017
253	NC_007426	ATTCG	2	10	368378	368387	20 %	40 %	20 %	20 %	76801017
254	NC_007426	GCCGA	2	10	370826	370835	20 %	0 %	40 %	40 %	76801020
255	NC_007426	CCGAC	2	10	371349	371358	20 %	0 %	20 %	60 %	76801020
256	NC_007426	AGTTC	2	10	376118	376127	20 %	40 %	20 %	20 %	76801024
257	NC_007426	CGACG	2	10	376236	376245	20 %	0 %	40 %	40 %	76801024
258	NC_007426	CAGTA	2	10	382695	382704	40 %	20 %	20 %	20 %	76801031
259	NC_007426	GTACA	2	10	384328	384337	40 %	20 %	20 %	20 %	76801032
260	NC_007426	GAAAC	2	10	386203	386212	60 %	0 %	20 %	20 %	76801034
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262	NC_007426	GACCG	2	10	395768	395777	20 %	0 %	40 %	40 %	76801044
263	NC_007426	TCGTC	2	10	396829	396838	0 %	40 %	20 %	40 %	76801045
264	NC_007426	GCCGC	2	10	396894	396903	0 %	0 %	40 %	60 %	76801045
265	NC_007426	GTCGG	2	10	397998	398007	0 %	20 %	60 %	20 %	76801047
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